170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_6540 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_6540  ApaG  100 
 
 		 130 aa  269  7e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.560513 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7451  ApaG  96.15 
 
 		 130 aa  262  8.999999999999999e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.953585  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0438  ApaG  83.08 
 
 		 130 aa  227  4e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.500146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0402  ApaG  83.08 
 
 		 130 aa  226  1e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.104997  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0370  ApaG  83.08 
 
 		 130 aa  226  1e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.292548  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2312  ApaG  81.54 
 
 		 130 aa  222  1e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.661489  normal  0.04269 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1039  ApaG domain-containing protein  57.69 
 
 		 130 aa  159  1e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1015  ApaG domain protein  55.38 
 
 		 130 aa  157  5e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000524176 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0470  ApaG  57.69 
 
 		 130 aa  157  5e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.327059 
 
 
-
 
NC_004310  BR0304  ApaG  56.92 
 
 		 130 aa  156  1e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0380419  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0764  ApaG  59.54 
 
 		 131 aa  155  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0925231  hitchhiker  0.00575768 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0317  ApaG  56.15 
 
 		 141 aa  155  2e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0408  ApaG  54.62 
 
 		 130 aa  155  2e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.833726  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4913  ApaG  56.15 
 
 		 140 aa  153  7e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.468217 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0898  ApaG  56.15 
 
 		 140 aa  152  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0397  ApaG  53.85 
 
 		 130 aa  152  1e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5255  ApaG  56.15 
 
 		 130 aa  150  5e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.178875  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0787  ApaG  55.38 
 
 		 145 aa  150  8e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.539898  normal  0.0936673 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0543  ApaG  53.85 
 
 		 130 aa  149  1e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0223  ApaG  58.02 
 
 		 172 aa  148  2e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0135  ApaG  57.25 
 
 		 237 aa  147  4e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.903636  normal  0.829835 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0491  ApaG  51.54 
 
 		 130 aa  145  1.0000000000000001e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.735069  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0189  ApaG  51.54 
 
 		 130 aa  143  8.000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.57181  normal  0.332972 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0130  ApaG  49.23 
 
 		 130 aa  141  4e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.431164 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0072  ApaG  55.28 
 
 		 144 aa  139  9e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0179  ApaG  49.23 
 
 		 130 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.386018  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3413  ApaG  53.04 
 
 		 127 aa  136  1e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.329551  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0493  ApaG  52.38 
 
 		 131 aa  135  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0420  ApaG domain protein  54.62 
 
 		 211 aa  135  2e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.416529 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3484  ApaG  55.74 
 
 		 127 aa  134  3.0000000000000003e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.526547  normal  0.166283 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1660  ApaG  53.49 
 
 		 154 aa  134  4e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.453905  normal  0.120686 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2722  ApaG domain protein  54.1 
 
 		 129 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1197  ApaG  51.61 
 
 		 134 aa  132  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1982  ApaG domain protein  51.56 
 
 		 130 aa  131  3e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.78252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0736  ApaG  52.14 
 
 		 123 aa  130  6e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2231  ApaG  47.69 
 
 		 127 aa  130  7.999999999999999e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.340232  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2660  ApaG  50.82 
 
 		 139 aa  130  7.999999999999999e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0667  ApaG  47.69 
 
 		 135 aa  128  3e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0735  ApaG  53.04 
 
 		 126 aa  127  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46840  ApaG  53.04 
 
 		 126 aa  127  7.000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07710  ApaG  53.04 
 
 		 126 aa  127  8.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0202441 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1346  ApaG  53.04 
 
 		 142 aa  126  1.0000000000000001e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.637296  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0222  ApaG  53.45 
 
 		 128 aa  126  1.0000000000000001e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.954602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4014  ApaG  51.3 
 
 		 126 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0861  ApaG  49.57 
 
 		 126 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0431  ApaG  50.43 
 
 		 126 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.425394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2372  ApaG  46.92 
 
 		 127 aa  124  3e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0601  ApaG  49.57 
 
 		 125 aa  124  4.0000000000000003e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1033  ApaG  45.38 
 
 		 134 aa  124  5e-28  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0437  ApaG  48.03 
 
 		 136 aa  124  5e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.30268 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4802  ApaG  48.7 
 
 		 126 aa  124  5e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.897217  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0400  ApaG  49.57 
 
 		 126 aa  123  7e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0434  ApaG  49.57 
 
 		 126 aa  123  7e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.292503  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0164  ApaG  49.18 
 
 		 130 aa  123  9e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.703501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3661  ApaG  52.21 
 
 		 142 aa  123  1e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0150  ApaG  48.36 
 
 		 124 aa  122  1e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3636  ApaG  48.7 
 
 		 125 aa  122  1e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1141  ApaG  43.65 
 
 		 133 aa  122  2e-27  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04646  ApaG  50 
 
 		 127 aa  122  2e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0854079  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0829  ApaG  44.62 
 
 		 134 aa  122  2e-27  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  decreased coverage  0.00542439  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5136  ApaG  46.96 
 
 		 126 aa  122  2e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2335  ApaG  51.26 
 
 		 126 aa  122  2e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2636  ApaG  47.69 
 
 		 127 aa  121  3e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0349  ApaG  46.92 
 
 		 135 aa  121  3e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.093684  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0599  ApaG  50.43 
 
 		 125 aa  121  3e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.121399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0586  ApaG  46.92 
 
 		 135 aa  120  6e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.12497  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4628  ApaG  47.83 
 
 		 133 aa  120  9e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0963  ApaG  50.43 
 
 		 126 aa  120  9e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0721  ApaG  48.67 
 
 		 156 aa  120  9e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0550  apaG protein  46.96 
 
 		 126 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.589067  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0562  ApaG  48.7 
 
 		 125 aa  119  9.999999999999999e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4031  ApaG  52.03 
 
 		 125 aa  119  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00953692  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2661  ApaG  45.8 
 
 		 157 aa  119  9.999999999999999e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.00116294  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2878  ApaG  49.18 
 
 		 124 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.289279  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2738  apaG protein  50 
 
 		 127 aa  119  1.9999999999999998e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3468  ApaG  46.9 
 
 		 124 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2359  ApaG domain protein  50 
 
 		 127 aa  119  1.9999999999999998e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.342277  hitchhiker  0.000000000770969 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0338  ApaG domain protein  47.11 
 
 		 127 aa  118  3e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3833  ApaG  46.96 
 
 		 125 aa  118  3e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0095  ApaG  49.57 
 
 		 125 aa  117  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0098  ApaG  49.57 
 
 		 125 aa  117  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.267128  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4467  ApaG  48.41 
 
 		 131 aa  117  3.9999999999999996e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.323841 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0093  ApaG  49.57 
 
 		 125 aa  117  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.574173 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2820  ApaG  48.31 
 
 		 128 aa  117  3.9999999999999996e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.841755 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0094  ApaG  49.57 
 
 		 125 aa  117  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.237472  normal  0.301698 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0100  ApaG  49.57 
 
 		 125 aa  117  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.819852  normal  0.574462 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0723  ApaG  49.57 
 
 		 125 aa  117  3.9999999999999996e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.854022 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1050  ApaG  47.41 
 
 		 124 aa  117  4.9999999999999996e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0328783  normal  0.737772 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1013  ApaG  45.53 
 
 		 126 aa  117  4.9999999999999996e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.156243  hitchhiker  0.00045551 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2755  ApaG  49.18 
 
 		 124 aa  117  6e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.263263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3120  ApaG  49.18 
 
 		 124 aa  117  7e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.802006  normal  0.119699 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00054  hypothetical protein  49.57 
 
 		 125 aa  117  7.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.641296  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3549  ApaG domain protein  49.57 
 
 		 125 aa  117  7.999999999999999e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3605  ApaG  49.57 
 
 		 125 aa  117  7.999999999999999e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00118033 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00053  hypothetical protein  49.57 
 
 		 125 aa  117  7.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.456951  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0044  ApaG  49.57 
 
 		 125 aa  117  7.999999999999999e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.271562  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0054  ApaG  49.57 
 
 		 125 aa  117  7.999999999999999e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.496379 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0056  ApaG  49.57 
 
 		 125 aa  117  7.999999999999999e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0915002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0056  ApaG  49.57 
 
 		 125 aa  117  7.999999999999999e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0054  ApaG  49.57 
 
 		 125 aa  117  7.999999999999999e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00391573  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>