170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2660 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_2660  ApaG  100 
 
 		 139 aa  290  5e-78  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1197  ApaG  63.36 
 
 		 134 aa  157  3e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1087  ApaG  58.33 
 
 		 133 aa  143  7.0000000000000006e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6540  ApaG  50.82 
 
 		 130 aa  130  7.999999999999999e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.560513 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7451  ApaG  50 
 
 		 130 aa  126  8.000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.953585  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0072  ApaG  47.29 
 
 		 144 aa  124  3e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0764  ApaG  49.18 
 
 		 131 aa  124  3e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0925231  hitchhiker  0.00575768 
 
 
-
 
NC_004310  BR0304  ApaG  46.72 
 
 		 130 aa  120  4e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0380419  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1039  ApaG domain-containing protein  44.26 
 
 		 130 aa  121  4e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0438  ApaG  47.54 
 
 		 130 aa  120  5e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.500146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0397  ApaG  47.54 
 
 		 130 aa  119  9.999999999999999e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0317  ApaG  45.16 
 
 		 141 aa  118  1.9999999999999998e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0402  ApaG  46.72 
 
 		 130 aa  118  3e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.104997  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07710  ApaG  52.17 
 
 		 126 aa  118  3e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0202441 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0370  ApaG  46.72 
 
 		 130 aa  118  3e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.292548  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1015  ApaG domain protein  43.44 
 
 		 130 aa  117  4.9999999999999996e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000524176 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2312  ApaG  45.9 
 
 		 130 aa  117  7e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.661489  normal  0.04269 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0408  ApaG  43.44 
 
 		 130 aa  115  9.999999999999999e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.833726  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0189  ApaG  46.34 
 
 		 130 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.57181  normal  0.332972 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0735  ApaG  51.3 
 
 		 126 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0179  ApaG  45.53 
 
 		 130 aa  115  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.386018  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0667  ApaG  49.57 
 
 		 135 aa  114  3e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4031  ApaG  46.4 
 
 		 125 aa  114  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00953692  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4913  ApaG  44.19 
 
 		 140 aa  114  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.468217 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1660  ApaG  44.44 
 
 		 154 aa  114  5e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.453905  normal  0.120686 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0130  ApaG  44.72 
 
 		 130 aa  114  6e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.431164 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0898  ApaG  42.62 
 
 		 140 aa  112  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0197  ApaG  46.83 
 
 		 128 aa  113  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.190971  normal  0.154239 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4173  ApaG  46.4 
 
 		 125 aa  112  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0244735  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0787  ApaG  42.62 
 
 		 145 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.539898  normal  0.0936673 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0491  ApaG  42.86 
 
 		 130 aa  112  2.0000000000000002e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.735069  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0420  ApaG domain protein  48.74 
 
 		 211 aa  112  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.416529 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1289  ApaG  45.22 
 
 		 127 aa  111  4.0000000000000004e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1353  ApaG  45.22 
 
 		 127 aa  111  4.0000000000000004e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.214186  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5255  ApaG  41.8 
 
 		 130 aa  111  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.178875  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04646  ApaG  48.7 
 
 		 127 aa  110  6e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0854079  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0338  ApaG domain protein  45.53 
 
 		 127 aa  110  6e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0396  ApaG  45 
 
 		 124 aa  110  9e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.352913  hitchhiker  0.000351729 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4147  ApaG  45.6 
 
 		 125 aa  109  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0310361  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1033  ApaG  41.6 
 
 		 134 aa  108  2.0000000000000002e-23  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0736  ApaG  44.83 
 
 		 123 aa  108  2.0000000000000002e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0543  ApaG  44.26 
 
 		 130 aa  108  2.0000000000000002e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46840  ApaG  47.83 
 
 		 126 aa  108  3e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1982  ApaG domain protein  43.97 
 
 		 130 aa  107  7.000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.78252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0829  ApaG  40.8 
 
 		 134 aa  106  9.000000000000001e-23  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  decreased coverage  0.00542439  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0247  ApaG domain protein  42.86 
 
 		 128 aa  106  9.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00311466 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0550  apaG protein  46.96 
 
 		 126 aa  106  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.589067  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0135  ApaG  41.41 
 
 		 237 aa  105  1e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.903636  normal  0.829835 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0223  ApaG  40 
 
 		 172 aa  106  1e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3422  ApaG  43.9 
 
 		 133 aa  106  1e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.687346  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3484  ApaG  46.96 
 
 		 127 aa  105  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.526547  normal  0.166283 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2231  ApaG  46.09 
 
 		 127 aa  105  2e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.340232  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2372  ApaG  45.22 
 
 		 127 aa  104  4e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4628  ApaG  46.09 
 
 		 133 aa  103  5e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2722  ApaG domain protein  44.35 
 
 		 129 aa  104  5e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0470  ApaG  41.8 
 
 		 130 aa  104  5e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.327059 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1237  ApaG  46.34 
 
 		 158 aa  103  8e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3413  ApaG  46.96 
 
 		 127 aa  103  8e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.329551  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0400  ApaG  44.35 
 
 		 126 aa  101  4e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0434  ApaG  44.35 
 
 		 126 aa  101  4e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.292503  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0431  ApaG  44.35 
 
 		 126 aa  101  4e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.425394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0437  ApaG  45.05 
 
 		 136 aa  100  6e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.30268 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0586  ApaG  45.54 
 
 		 135 aa  100  6e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.12497  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0721  ApaG  41.22 
 
 		 156 aa  100  7e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1346  ApaG  44.35 
 
 		 142 aa  99.8  1e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.637296  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03415  ApaG  39.66 
 
 		 124 aa  99.8  1e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.250185  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2335  ApaG  44.83 
 
 		 126 aa  100  1e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5136  ApaG  44.35 
 
 		 126 aa  99.4  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2636  ApaG  42.98 
 
 		 127 aa  99  2e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2359  ApaG domain protein  47.37 
 
 		 127 aa  99.4  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.342277  hitchhiker  0.000000000770969 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0599  ApaG  43.1 
 
 		 125 aa  99  2e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.121399  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2738  apaG protein  47.37 
 
 		 127 aa  99.4  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4802  ApaG  40.87 
 
 		 126 aa  98.6  3e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.897217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4014  ApaG  44.35 
 
 		 126 aa  98.2  3e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1141  ApaG  38.1 
 
 		 133 aa  97.8  4e-20  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2587  ApaG  45.24 
 
 		 128 aa  97.8  4e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3636  ApaG  42.24 
 
 		 125 aa  98.2  4e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1758  ApaG  37.3 
 
 		 128 aa  97.8  5e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2661  ApaG  45.08 
 
 		 157 aa  97.4  5e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.00116294  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3120  ApaG  44.35 
 
 		 124 aa  97.4  6e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.802006  normal  0.119699 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2755  ApaG  44.35 
 
 		 124 aa  97.4  6e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.263263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0861  ApaG  43.1 
 
 		 126 aa  97.1  8e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00054  hypothetical protein  39.66 
 
 		 125 aa  96.7  1e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.641296  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3549  ApaG domain protein  39.66 
 
 		 125 aa  96.7  1e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3605  ApaG  39.66 
 
 		 125 aa  96.7  1e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00118033 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3833  ApaG  43.1 
 
 		 125 aa  95.9  1e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0562  ApaG  42.24 
 
 		 125 aa  96.7  1e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0044  ApaG  39.66 
 
 		 125 aa  96.7  1e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.271562  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0056  ApaG  39.66 
 
 		 125 aa  96.7  1e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0054  ApaG  39.66 
 
 		 125 aa  96.7  1e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00391573  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00053  hypothetical protein  39.66 
 
 		 125 aa  96.7  1e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.456951  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0054  ApaG  39.66 
 
 		 125 aa  96.7  1e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.496379 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0056  ApaG  39.66 
 
 		 125 aa  96.7  1e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0915002  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0601  ApaG  43.1 
 
 		 125 aa  95.5  2e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2878  ApaG  44.35 
 
 		 124 aa  94.7  3e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.289279  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12178  hypothetical protein  39.84 
 
 		 128 aa  94.4  4e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0270  ApaG  47.2 
 
 		 135 aa  94  6e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0094  ApaG  39.66 
 
 		 125 aa  94  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.237472  normal  0.301698 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0100  ApaG  39.66 
 
 		 125 aa  94  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.819852  normal  0.574462 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0095  ApaG  39.66 
 
 		 125 aa  94  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>