170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1660 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_1660  ApaG  100 
 
 
154 aa  312  9.999999999999999e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.453905  normal  0.120686 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1039  ApaG domain-containing protein  50.77 
 
 
130 aa  136  1e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0072  ApaG  49.23 
 
 
144 aa  134  3.0000000000000003e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6540  ApaG  53.49 
 
 
130 aa  134  5e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.560513 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1015  ApaG domain protein  50.77 
 
 
130 aa  131  3e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000524176 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7451  ApaG  52.85 
 
 
130 aa  131  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.953585  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0179  ApaG  48.46 
 
 
130 aa  130  5e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.386018  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0491  ApaG  52.85 
 
 
130 aa  130  6e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.735069  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0764  ApaG  49.61 
 
 
131 aa  130  9e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0925231  hitchhiker  0.00575768 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0787  ApaG  51.54 
 
 
145 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.539898  normal  0.0936673 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0898  ApaG  50 
 
 
140 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0402  ApaG  51.54 
 
 
130 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.104997  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5255  ApaG  52.31 
 
 
130 aa  128  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.178875  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0438  ApaG  51.54 
 
 
130 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.500146  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0370  ApaG  51.54 
 
 
130 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.292548  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4913  ApaG  50.38 
 
 
140 aa  128  3e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.468217 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0130  ApaG  46.92 
 
 
130 aa  128  3e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.431164 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0189  ApaG  47.69 
 
 
130 aa  128  4.0000000000000003e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.57181  normal  0.332972 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2312  ApaG  50.77 
 
 
130 aa  127  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.661489  normal  0.04269 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0397  ApaG  47.69 
 
 
130 aa  125  1.0000000000000001e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0408  ApaG  49.23 
 
 
130 aa  126  1.0000000000000001e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.833726  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0223  ApaG  48.2 
 
 
172 aa  125  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0543  ApaG  47.69 
 
 
130 aa  124  3e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0317  ApaG  49.23 
 
 
141 aa  124  6e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0304  ApaG  49.23 
 
 
130 aa  122  1e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0380419  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0470  ApaG  46.92 
 
 
130 aa  123  1e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.327059 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0135  ApaG  48.85 
 
 
237 aa  122  2e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.903636  normal  0.829835 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1197  ApaG  52.03 
 
 
134 aa  119  9.999999999999999e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0437  ApaG  52.78 
 
 
136 aa  116  9.999999999999999e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.30268 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2660  ApaG  44.44 
 
 
139 aa  114  5e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0667  ApaG  43.55 
 
 
135 aa  112  2.0000000000000002e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0735  ApaG  50.43 
 
 
126 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2231  ApaG  44.63 
 
 
127 aa  111  3e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.340232  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07710  ApaG  50.43 
 
 
126 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0202441 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1237  ApaG  46.77 
 
 
158 aa  110  7.000000000000001e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0222  ApaG  46.02 
 
 
128 aa  110  9e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.954602  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1033  ApaG  44.72 
 
 
134 aa  108  2.0000000000000002e-23  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2661  ApaG  48.39 
 
 
157 aa  108  2.0000000000000002e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.00116294  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0164  ApaG  46.15 
 
 
130 aa  108  3e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.703501  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04646  ApaG  46.96 
 
 
127 aa  108  3e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0854079  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0493  ApaG  46.36 
 
 
131 aa  107  5e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0150  ApaG  45.3 
 
 
124 aa  107  5e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0829  ApaG  44.72 
 
 
134 aa  107  6e-23  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  decreased coverage  0.00542439  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3484  ApaG  49.57 
 
 
127 aa  107  7.000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.526547  normal  0.166283 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2335  ApaG  45.22 
 
 
126 aa  107  8.000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0721  ApaG  45.95 
 
 
156 aa  107  8.000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0736  ApaG  45.22 
 
 
123 aa  106  9.000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0349  ApaG  47.27 
 
 
135 aa  105  2e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.093684  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4467  ApaG  47.27 
 
 
131 aa  104  3e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.323841 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0420  ApaG domain protein  45.76 
 
 
211 aa  104  3e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.416529 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0586  ApaG  46.36 
 
 
135 aa  105  3e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.12497  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2372  ApaG  41.32 
 
 
127 aa  104  4e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3661  ApaG  48.18 
 
 
142 aa  104  4e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0601  ApaG  42.61 
 
 
125 aa  104  6e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2906  ApaG  47.79 
 
 
185 aa  103  8e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.809331  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2857  ApaG  48.67 
 
 
124 aa  103  9e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.93069  normal  0.818828 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3413  ApaG  46.15 
 
 
127 aa  102  1e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.329551  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1087  ApaG  50.4 
 
 
133 aa  102  1e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0562  ApaG  42.61 
 
 
125 aa  103  1e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0098  ApaG  43.48 
 
 
125 aa  102  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.267128  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0100  ApaG  43.48 
 
 
125 aa  102  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.819852  normal  0.574462 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3020  ApaG  43.8 
 
 
137 aa  102  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.737478  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0270  ApaG  47.01 
 
 
135 aa  102  2e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0095  ApaG  43.48 
 
 
125 aa  102  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0599  ApaG  45.22 
 
 
125 aa  102  2e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.121399  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0094  ApaG  43.48 
 
 
125 aa  102  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.237472  normal  0.301698 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0723  ApaG  45.22 
 
 
125 aa  102  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.854022 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0093  ApaG  43.48 
 
 
125 aa  102  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.574173 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3571  ApaG  46.9 
 
 
185 aa  101  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458352  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3636  ApaG  42.61 
 
 
125 aa  102  3e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3624  ApaG  46.9 
 
 
124 aa  101  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.815881 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3175  ApaG  46.02 
 
 
124 aa  102  3e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3574  ApaG  42.61 
 
 
125 aa  102  3e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3445  ApaG  42.61 
 
 
125 aa  102  3e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.310149  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0773  ApaG  42.61 
 
 
125 aa  101  3e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0328045  normal  0.124499 
 
 
-
 
NC_002978  WD1141  ApaG  39.84 
 
 
133 aa  101  4e-21  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0536  ApaG  46.9 
 
 
124 aa  101  4e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.680201  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1346  ApaG  41.88 
 
 
142 aa  101  4e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.637296  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0442  ApaG  46.9 
 
 
124 aa  101  4e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0641  ApaG  46.9 
 
 
124 aa  101  4e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0937  ApaG  46.9 
 
 
124 aa  101  4e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3552  ApaG  46.9 
 
 
124 aa  101  4e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.144794  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3579  ApaG  46.9 
 
 
124 aa  101  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1907  ApaG  46.9 
 
 
124 aa  101  4e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0466  ApaG  46.49 
 
 
147 aa  100  5e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.357414  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1982  ApaG domain protein  39.67 
 
 
130 aa  100  8e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.78252  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0360  ApaG  46.15 
 
 
137 aa  100  9e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2568  ApaG  46.02 
 
 
124 aa  99.8  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0904  ApaG  42.98 
 
 
126 aa  99.4  1e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.764534  normal  0.43881 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0537  ApaG  46.02 
 
 
124 aa  99.8  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.371391  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0878  ApaG  43.86 
 
 
126 aa  99.8  1e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3120  ApaG  44.92 
 
 
124 aa  99.8  1e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.802006  normal  0.119699 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0509  ApaG  46.02 
 
 
124 aa  99.8  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2755  ApaG  44.92 
 
 
124 aa  99.4  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.263263  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3210  ApaG  42.98 
 
 
126 aa  99.4  2e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.664218  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0861  ApaG  41.38 
 
 
126 aa  99  2e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2359  ApaG domain protein  42.48 
 
 
127 aa  98.6  3e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.342277  hitchhiker  0.000000000770969 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2636  ApaG  40.71 
 
 
127 aa  98.6  3e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3116  ApaG  42.11 
 
 
126 aa  98.6  3e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4147  ApaG  43.44 
 
 
125 aa  98.2  3e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0310361  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>