170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1087 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_1087  ApaG  100 
 
 		 133 aa  271  2.0000000000000002e-72  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2660  ApaG  58.33 
 
 		 139 aa  161  3e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1197  ApaG  62.88 
 
 		 134 aa  160  6e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6540  ApaG  49.18 
 
 		 130 aa  128  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.560513 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7451  ApaG  48.36 
 
 		 130 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.953585  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0130  ApaG  48.78 
 
 		 130 aa  124  3e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.431164 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1660  ApaG  50.4 
 
 		 154 aa  122  1e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.453905  normal  0.120686 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0764  ApaG  48.36 
 
 		 131 aa  122  1e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0925231  hitchhiker  0.00575768 
 
 
-
 
NC_004310  BR0304  ApaG  48.36 
 
 		 130 aa  120  9e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0380419  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0898  ApaG  45.9 
 
 		 140 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0408  ApaG  46.72 
 
 		 130 aa  118  1.9999999999999998e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.833726  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0072  ApaG  48 
 
 		 144 aa  118  3e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0438  ApaG  47.54 
 
 		 130 aa  118  3e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.500146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0543  ApaG  46.72 
 
 		 130 aa  117  3.9999999999999996e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1039  ApaG domain-containing protein  44.26 
 
 		 130 aa  117  3.9999999999999996e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0735  ApaG  52.46 
 
 		 126 aa  117  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0189  ApaG  47.15 
 
 		 130 aa  117  4.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.57181  normal  0.332972 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2335  ApaG  52.14 
 
 		 126 aa  117  4.9999999999999996e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0787  ApaG  45.08 
 
 		 145 aa  117  6e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.539898  normal  0.0936673 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0317  ApaG  47.54 
 
 		 141 aa  117  7e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0491  ApaG  49.14 
 
 		 130 aa  116  7.999999999999999e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.735069  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0179  ApaG  46.34 
 
 		 130 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.386018  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07710  ApaG  52.46 
 
 		 126 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0202441 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0197  ApaG  48.36 
 
 		 128 aa  116  9.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.190971  normal  0.154239 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0402  ApaG  46.72 
 
 		 130 aa  115  9.999999999999999e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.104997  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0370  ApaG  46.72 
 
 		 130 aa  115  9.999999999999999e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.292548  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5255  ApaG  44.26 
 
 		 130 aa  114  3e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.178875  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2312  ApaG  45.9 
 
 		 130 aa  114  5e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.661489  normal  0.04269 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2231  ApaG  47.83 
 
 		 127 aa  113  7.999999999999999e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.340232  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2372  ApaG  49.57 
 
 		 127 aa  112  1.0000000000000001e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3413  ApaG  46.96 
 
 		 127 aa  111  3e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.329551  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1982  ApaG domain protein  46.15 
 
 		 130 aa  111  3e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.78252  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1237  ApaG  47.15 
 
 		 158 aa  111  3e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0437  ApaG  53.64 
 
 		 136 aa  110  5e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.30268 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0397  ApaG  45.9 
 
 		 130 aa  110  5e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4913  ApaG  43.44 
 
 		 140 aa  110  6e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.468217 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1015  ApaG domain protein  40.98 
 
 		 130 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000524176 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0338  ApaG domain protein  46.4 
 
 		 127 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0396  ApaG  46.67 
 
 		 124 aa  109  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.352913  hitchhiker  0.000351729 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0247  ApaG domain protein  44.26 
 
 		 128 aa  108  3e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00311466 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0736  ApaG  43.97 
 
 		 123 aa  108  3e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0667  ApaG  43.59 
 
 		 135 aa  107  6e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2722  ApaG domain protein  45.22 
 
 		 129 aa  107  6e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0223  ApaG  43.9 
 
 		 172 aa  107  7.000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0493  ApaG  46.09 
 
 		 131 aa  106  9.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4031  ApaG  44.8 
 
 		 125 aa  106  9.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00953692  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0135  ApaG  42.86 
 
 		 237 aa  105  1e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.903636  normal  0.829835 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2755  ApaG  46.96 
 
 		 124 aa  106  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.263263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0470  ApaG  45.08 
 
 		 130 aa  106  1e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.327059 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0270  ApaG  52 
 
 		 135 aa  105  2e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3120  ApaG  46.96 
 
 		 124 aa  105  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.802006  normal  0.119699 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03415  ApaG  40.52 
 
 		 124 aa  105  3e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.250185  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1346  ApaG  43.59 
 
 		 142 aa  104  4e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.637296  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1033  ApaG  42.28 
 
 		 134 aa  104  4e-22  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3080  ApaG  41.8 
 
 		 126 aa  104  4e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0420  ApaG domain protein  46.96 
 
 		 211 aa  104  4e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.416529 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3661  ApaG  45.16 
 
 		 142 aa  103  6e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5136  ApaG  46.09 
 
 		 126 aa  103  7e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0550  apaG protein  44.92 
 
 		 126 aa  103  8e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.589067  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0829  ApaG  42.28 
 
 		 134 aa  103  9e-22  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  decreased coverage  0.00542439  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1141  ApaG  40.16 
 
 		 133 aa  102  1e-21  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2820  ApaG  46.09 
 
 		 128 aa  102  1e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.841755 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4628  ApaG  44.07 
 
 		 133 aa  102  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4173  ApaG  43.2 
 
 		 125 aa  102  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0244735  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2738  apaG protein  45.61 
 
 		 127 aa  101  3e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2359  ApaG domain protein  45.61 
 
 		 127 aa  101  3e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.342277  hitchhiker  0.000000000770969 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04646  ApaG  42.74 
 
 		 127 aa  101  3e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0854079  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4147  ApaG  43.2 
 
 		 125 aa  101  4e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0310361  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3484  ApaG  43.52 
 
 		 127 aa  100  5e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.526547  normal  0.166283 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0164  ApaG  41.88 
 
 		 130 aa  100  5e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.703501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2636  ApaG  42.98 
 
 		 127 aa  100  5e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3175  ApaG  44.74 
 
 		 124 aa  100  5e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0861  ApaG  44.35 
 
 		 126 aa  100  5e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4467  ApaG  48.67 
 
 		 131 aa  100  6e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.323841 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46840  ApaG  46.09 
 
 		 126 aa  100  8e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0349  ApaG  47.32 
 
 		 135 aa  100  9e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.093684  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2860  ApaG  43.48 
 
 		 126 aa  100  9e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00242464  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3020  ApaG  45.61 
 
 		 137 aa  99.8  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.737478  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3422  ApaG  41.53 
 
 		 133 aa  99.4  1e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.687346  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0360  ApaG  49.06 
 
 		 137 aa  99.4  1e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1279  ApaG domain protein  38.84 
 
 		 142 aa  99.8  1e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.638394  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001666  ApaG protein  40.87 
 
 		 126 aa  99.8  1e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00807  ApaG  40.87 
 
 		 126 aa  99.8  1e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0963  ApaG  45.22 
 
 		 126 aa  99.4  1e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2878  ApaG  43.48 
 
 		 124 aa  99.4  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.289279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0222  ApaG  44.44 
 
 		 128 aa  99  2e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.954602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1353  ApaG  40 
 
 		 127 aa  99.4  2e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.214186  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1289  ApaG  40 
 
 		 127 aa  99.4  2e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0150  ApaG  40.17 
 
 		 124 aa  98.2  3e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3574  ApaG  45.69 
 
 		 125 aa  98.2  3e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3445  ApaG  45.69 
 
 		 125 aa  98.2  3e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.310149  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0723  ApaG  44.83 
 
 		 125 aa  98.6  3e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.854022 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0400  ApaG  43.48 
 
 		 126 aa  97.4  5e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0434  ApaG  43.48 
 
 		 126 aa  97.4  5e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.292503  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0773  ApaG  45.69 
 
 		 125 aa  97.4  5e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0328045  normal  0.124499 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3636  ApaG  43.97 
 
 		 125 aa  97.4  6e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0721  ApaG  45.45 
 
 		 156 aa  97.4  6e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2857  ApaG  43.1 
 
 		 124 aa  97.1  8e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.93069  normal  0.818828 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0431  ApaG  43.48 
 
 		 126 aa  97.1  8e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.425394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0904  ApaG  40.16 
 
 		 126 aa  96.7  9e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.764534  normal  0.43881 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>