171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_0360 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_0360  ApaG  100 
 
 		 137 aa  285  2e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0349  ApaG  97.08 
 
 		 135 aa  274  3e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.093684  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0437  ApaG  78.26 
 
 		 136 aa  223  1e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.30268 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0586  ApaG  72.26 
 
 		 135 aa  203  6e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.12497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3661  ApaG  71.53 
 
 		 142 aa  199  9.999999999999999e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4467  ApaG  70.07 
 
 		 131 aa  195  2.0000000000000003e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.323841 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0531  ApaG  64.66 
 
 		 130 aa  181  3e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0493  ApaG  62.31 
 
 		 131 aa  179  2e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0721  ApaG  59.12 
 
 		 156 aa  169  2e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3175  ApaG  62.18 
 
 		 124 aa  153  9e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0442  ApaG  60.5 
 
 		 124 aa  152  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0466  ApaG  60.5 
 
 		 147 aa  152  1e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.357414  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3624  ApaG  59.66 
 
 		 124 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.815881 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3120  ApaG  59.66 
 
 		 124 aa  151  2.9999999999999998e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.802006  normal  0.119699 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2755  ApaG  59.66 
 
 		 124 aa  151  4e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.263263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2568  ApaG  59.66 
 
 		 124 aa  150  4e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0537  ApaG  59.66 
 
 		 124 aa  150  4e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.371391  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2857  ApaG  59.66 
 
 		 124 aa  150  5.9999999999999996e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.93069  normal  0.818828 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3020  ApaG  61.34 
 
 		 137 aa  150  7e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.737478  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0509  ApaG  59.66 
 
 		 124 aa  149  1e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2878  ApaG  57.39 
 
 		 124 aa  148  3e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.289279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0464  ApaG  57.98 
 
 		 124 aa  147  5e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3493  ApaG  57.98 
 
 		 124 aa  146  7e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00288381  decreased coverage  0.0000301407 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0536  ApaG  57.14 
 
 		 124 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.680201  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0641  ApaG  57.14 
 
 		 124 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0937  ApaG  57.14 
 
 		 124 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3552  ApaG  57.14 
 
 		 124 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.144794  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3579  ApaG  57.14 
 
 		 124 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1907  ApaG  57.14 
 
 		 124 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3484  ApaG  58.26 
 
 		 127 aa  144  3e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.526547  normal  0.166283 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2906  ApaG  57.14 
 
 		 185 aa  145  3e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.809331  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3571  ApaG  57.14 
 
 		 185 aa  144  5e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458352  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3900  ApaG domain-containing protein  60.19 
 
 		 128 aa  143  7.0000000000000006e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.195593 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2695  ApaG  56.3 
 
 		 124 aa  142  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.911706  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04646  ApaG  58.26 
 
 		 127 aa  142  2e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0854079  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0222  ApaG  56.52 
 
 		 128 aa  139  9.999999999999999e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.954602  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2372  ApaG  55.65 
 
 		 127 aa  137  6e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2231  ApaG  55.65 
 
 		 127 aa  136  1e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.340232  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2335  ApaG  57.14 
 
 		 126 aa  135  1e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0164  ApaG  53.98 
 
 		 130 aa  134  3.0000000000000003e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.703501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2359  ApaG domain protein  53.91 
 
 		 127 aa  134  3.0000000000000003e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.342277  hitchhiker  0.000000000770969 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2738  apaG protein  53.91 
 
 		 127 aa  134  3.0000000000000003e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0667  ApaG  54.39 
 
 		 135 aa  134  3.0000000000000003e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0735  ApaG  52.94 
 
 		 126 aa  134  4e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3468  ApaG  51.75 
 
 		 124 aa  133  8e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0150  ApaG  53.98 
 
 		 124 aa  133  8e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2636  ApaG  51.85 
 
 		 127 aa  132  9.999999999999999e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07710  ApaG  52.94 
 
 		 126 aa  131  3e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0202441 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2722  ApaG domain protein  53.98 
 
 		 129 aa  130  6.999999999999999e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46840  ApaG  49.58 
 
 		 126 aa  127  4.0000000000000003e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3413  ApaG  51.75 
 
 		 127 aa  127  7.000000000000001e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.329551  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0550  apaG protein  48.74 
 
 		 126 aa  127  8.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.589067  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0898  ApaG  49.57 
 
 		 140 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4628  ApaG  47.06 
 
 		 133 aa  125  3e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1015  ApaG domain protein  45.38 
 
 		 130 aa  124  3e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000524176 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1039  ApaG domain-containing protein  49.57 
 
 		 130 aa  124  5e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0420  ApaG domain protein  50.89 
 
 		 211 aa  123  7e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.416529 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1289  ApaG  53.1 
 
 		 127 aa  123  8.000000000000001e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1353  ApaG  53.1 
 
 		 127 aa  123  8.000000000000001e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.214186  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5136  ApaG  48.74 
 
 		 126 aa  123  9e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4913  ApaG  45.04 
 
 		 140 aa  122  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.468217 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0787  ApaG  48.7 
 
 		 145 aa  122  2e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.539898  normal  0.0936673 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6540  ApaG  46.15 
 
 		 130 aa  122  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.560513 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0491  ApaG  52.21 
 
 		 130 aa  122  2e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.735069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2820  ApaG  52.68 
 
 		 128 aa  122  2e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.841755 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1050  ApaG  51.3 
 
 		 124 aa  122  2e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0328783  normal  0.737772 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4802  ApaG  45.38 
 
 		 126 aa  121  3e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.897217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0470  ApaG  48.25 
 
 		 130 aa  121  3e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.327059 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5255  ApaG  47.83 
 
 		 130 aa  120  5e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.178875  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0241  ApaG  52.1 
 
 		 126 aa  120  9e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.136647  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0764  ApaG  48.7 
 
 		 131 aa  119  9e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0925231  hitchhiker  0.00575768 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0400  ApaG  45.38 
 
 		 126 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3314  ApaG  47.9 
 
 		 126 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0976  ApaG  47.9 
 
 		 126 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.13666  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0434  ApaG  45.38 
 
 		 126 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.292503  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1045  ApaG  47.9 
 
 		 126 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.102627  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7451  ApaG  46.15 
 
 		 130 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.953585  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1078  ApaG  47.9 
 
 		 126 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.804618  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0223  ApaG  44.7 
 
 		 172 aa  119  1.9999999999999998e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0988  ApaG  47.9 
 
 		 126 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.233116  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0408  ApaG  46.15 
 
 		 130 aa  119  1.9999999999999998e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.833726  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0431  ApaG  45.38 
 
 		 126 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.425394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1982  ApaG domain protein  48.21 
 
 		 130 aa  118  3e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.78252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0135  ApaG  43.18 
 
 		 237 aa  117  6e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.903636  normal  0.829835 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0736  ApaG  50 
 
 		 123 aa  117  6e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4014  ApaG  46.22 
 
 		 126 aa  117  6e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0304  ApaG  49.12 
 
 		 130 aa  116  9.999999999999999e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0380419  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0130  ApaG  47.06 
 
 		 130 aa  116  9.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.431164 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3640  ApaG  47.06 
 
 		 126 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0317  ApaG  48.25 
 
 		 141 aa  115  1.9999999999999998e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0397  ApaG  50.44 
 
 		 130 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1346  ApaG  46.49 
 
 		 142 aa  115  3e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.637296  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4031  ApaG  50 
 
 		 125 aa  114  3e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00953692  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0878  ApaG  46.28 
 
 		 126 aa  115  3e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0904  ApaG  48.21 
 
 		 126 aa  114  5e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.764534  normal  0.43881 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0861  ApaG  47.06 
 
 		 126 aa  114  5e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03415  ApaG  46.49 
 
 		 124 aa  114  6e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.250185  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3116  ApaG  48.21 
 
 		 126 aa  114  6e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3210  ApaG  48.21 
 
 		 126 aa  114  6.9999999999999995e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.664218  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0370  ApaG  44.62 
 
 		 130 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.292548  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>