170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_0402 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_0402  ApaG  100 
 
 		 130 aa  267  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.104997  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0370  ApaG  100 
 
 		 130 aa  267  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.292548  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0438  ApaG  98.46 
 
 		 130 aa  264  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.500146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2312  ApaG  89.23 
 
 		 130 aa  243  4.9999999999999997e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.661489  normal  0.04269 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6540  ApaG  83.08 
 
 		 130 aa  226  1e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.560513 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7451  ApaG  83.08 
 
 		 130 aa  223  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.953585  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0397  ApaG  57.69 
 
 		 130 aa  161  3e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0304  ApaG  60 
 
 		 130 aa  159  1e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0380419  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4913  ApaG  58.46 
 
 		 140 aa  159  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.468217 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0317  ApaG  59.23 
 
 		 141 aa  158  2e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0764  ApaG  62.1 
 
 		 131 aa  157  3e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0925231  hitchhiker  0.00575768 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1039  ApaG domain-containing protein  57.69 
 
 		 130 aa  157  5e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0408  ApaG  55.38 
 
 		 130 aa  157  6e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.833726  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1015  ApaG domain protein  54.62 
 
 		 130 aa  156  7e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000524176 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0898  ApaG  57.69 
 
 		 140 aa  154  3e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0787  ApaG  56.92 
 
 		 145 aa  153  6e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.539898  normal  0.0936673 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0470  ApaG  56.15 
 
 		 130 aa  153  9e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.327059 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5255  ApaG  57.69 
 
 		 130 aa  153  1e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.178875  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0543  ApaG  54.62 
 
 		 130 aa  149  2e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0223  ApaG  58.02 
 
 		 172 aa  147  4e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0135  ApaG  57.25 
 
 		 237 aa  147  5e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.903636  normal  0.829835 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0072  ApaG  57.72 
 
 		 144 aa  145  1.0000000000000001e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0189  ApaG  53.08 
 
 		 130 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.57181  normal  0.332972 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0179  ApaG  52.31 
 
 		 130 aa  144  4.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.386018  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0130  ApaG  50.77 
 
 		 130 aa  144  4.0000000000000006e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.431164 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0491  ApaG  51.54 
 
 		 130 aa  140  8e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.735069  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3484  ApaG  56.9 
 
 		 127 aa  129  9e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.526547  normal  0.166283 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1660  ApaG  51.54 
 
 		 154 aa  129  2.0000000000000002e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.453905  normal  0.120686 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0493  ApaG  53.51 
 
 		 131 aa  127  3e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0420  ApaG domain protein  52.94 
 
 		 211 aa  127  4.0000000000000003e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.416529 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0736  ApaG  49.58 
 
 		 123 aa  127  5.0000000000000004e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1197  ApaG  53.27 
 
 		 134 aa  124  3e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3413  ApaG  51.3 
 
 		 127 aa  125  3e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.329551  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2231  ApaG  47.69 
 
 		 127 aa  124  4.0000000000000003e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.340232  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1982  ApaG domain protein  50 
 
 		 130 aa  124  4.0000000000000003e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.78252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1033  ApaG  46.15 
 
 		 134 aa  122  1e-27  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0222  ApaG  52.59 
 
 		 128 aa  122  1e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.954602  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2335  ApaG  52.94 
 
 		 126 aa  122  1e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0829  ApaG  45.38 
 
 		 134 aa  122  2e-27  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  decreased coverage  0.00542439  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2722  ApaG domain protein  52.46 
 
 		 129 aa  121  3e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1346  ApaG  52.17 
 
 		 142 aa  121  4e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.637296  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0963  ApaG  51.28 
 
 		 126 aa  120  6e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1141  ApaG  44.62 
 
 		 133 aa  119  9.999999999999999e-27  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2636  ApaG  47.69 
 
 		 127 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2660  ApaG  46.72 
 
 		 139 aa  118  3e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2661  ApaG  45.8 
 
 		 157 aa  118  3e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.00116294  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0431  ApaG  49.57 
 
 		 126 aa  118  3e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.425394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2372  ApaG  48.36 
 
 		 127 aa  117  3.9999999999999996e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0400  ApaG  49.57 
 
 		 126 aa  117  6e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0434  ApaG  49.57 
 
 		 126 aa  117  6e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.292503  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2359  ApaG domain protein  50 
 
 		 127 aa  116  7.999999999999999e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.342277  hitchhiker  0.000000000770969 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2738  apaG protein  50 
 
 		 127 aa  116  7.999999999999999e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4802  ApaG  47.83 
 
 		 126 aa  116  9e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.897217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1237  ApaG  44.62 
 
 		 158 aa  116  9.999999999999999e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4014  ApaG  50.43 
 
 		 126 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0735  ApaG  51.3 
 
 		 126 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07710  ApaG  51.3 
 
 		 126 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0202441 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0437  ApaG  50 
 
 		 136 aa  115  1.9999999999999998e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.30268 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1013  ApaG  45.6 
 
 		 126 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.156243  hitchhiker  0.00045551 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0861  ApaG  47.86 
 
 		 126 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4031  ApaG  51.22 
 
 		 125 aa  115  3e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00953692  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46840  ApaG  51.3 
 
 		 126 aa  114  5e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0667  ApaG  44.62 
 
 		 135 aa  113  6.9999999999999995e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1279  ApaG domain protein  46.88 
 
 		 142 aa  113  6.9999999999999995e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.638394  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1078  ApaG  44.44 
 
 		 126 aa  113  6.9999999999999995e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.804618  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4147  ApaG  52.03 
 
 		 125 aa  113  7.999999999999999e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0310361  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0988  ApaG  45.3 
 
 		 126 aa  113  7.999999999999999e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.233116  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0721  ApaG  49.11 
 
 		 156 aa  113  7.999999999999999e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0976  ApaG  44.44 
 
 		 126 aa  113  8.999999999999998e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.13666  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3314  ApaG  44.44 
 
 		 126 aa  113  8.999999999999998e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1045  ApaG  44.44 
 
 		 126 aa  113  8.999999999999998e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.102627  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3640  ApaG  43.44 
 
 		 126 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0531  ApaG  46.85 
 
 		 130 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2889  ApaG  47.83 
 
 		 126 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.203189  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0904  ApaG  45.3 
 
 		 126 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.764534  normal  0.43881 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3116  ApaG  45.3 
 
 		 126 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3210  ApaG  44.44 
 
 		 126 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.664218  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0349  ApaG  46.09 
 
 		 135 aa  112  2.0000000000000002e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.093684  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0921  ApaG  46.15 
 
 		 127 aa  111  3e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.116399  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04646  ApaG  47.54 
 
 		 127 aa  111  4.0000000000000004e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0854079  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0197  ApaG  44.8 
 
 		 128 aa  111  4.0000000000000004e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.190971  normal  0.154239 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3636  ApaG  45.3 
 
 		 125 aa  110  6e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3661  ApaG  50.91 
 
 		 142 aa  110  6e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4173  ApaG  51.22 
 
 		 125 aa  110  6e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0244735  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2820  ApaG  44.83 
 
 		 128 aa  110  8.000000000000001e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.841755 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0586  ApaG  45.31 
 
 		 135 aa  110  8.000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.12497  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0601  ApaG  45.3 
 
 		 125 aa  109  1.0000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3468  ApaG  47.27 
 
 		 124 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0338  ApaG domain protein  44.54 
 
 		 127 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0878  ApaG  46.15 
 
 		 126 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0150  ApaG  45.08 
 
 		 124 aa  109  1.0000000000000001e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2878  ApaG  47.86 
 
 		 124 aa  108  2.0000000000000002e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.289279  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0550  apaG protein  46.96 
 
 		 126 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.589067  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3080  ApaG  42.61 
 
 		 126 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0164  ApaG  45.83 
 
 		 130 aa  108  2.0000000000000002e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.703501  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0562  ApaG  46.15 
 
 		 125 aa  108  3e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4628  ApaG  46.09 
 
 		 133 aa  107  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5136  ApaG  45.22 
 
 		 126 aa  107  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0176  ApaG domain protein  48.72 
 
 		 126 aa  108  4.0000000000000004e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1050  ApaG  45.69 
 
 		 124 aa  107  4.0000000000000004e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0328783  normal  0.737772 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>