171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_0164 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010531  Pnec_0164  ApaG  100 
 
 		 130 aa  275  2e-73  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.703501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0150  ApaG  96.77 
 
 		 124 aa  255  1e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0464  ApaG  68.55 
 
 		 124 aa  192  1e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3624  ApaG  68.55 
 
 		 124 aa  191  2e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.815881 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0442  ApaG  68.55 
 
 		 124 aa  192  2e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0466  ApaG  66.93 
 
 		 147 aa  191  2e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.357414  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3493  ApaG  68.55 
 
 		 124 aa  192  2e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00288381  decreased coverage  0.0000301407 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2568  ApaG  67.74 
 
 		 124 aa  190  6e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0537  ApaG  67.74 
 
 		 124 aa  190  6e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.371391  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2906  ApaG  66.93 
 
 		 185 aa  189  8e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.809331  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3571  ApaG  66.14 
 
 		 185 aa  187  2.9999999999999997e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458352  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2857  ApaG  67.74 
 
 		 124 aa  187  2.9999999999999997e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.93069  normal  0.818828 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0509  ApaG  66.94 
 
 		 124 aa  187  5e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0536  ApaG  66.94 
 
 		 124 aa  186  7e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.680201  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0641  ApaG  66.94 
 
 		 124 aa  186  7e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0937  ApaG  66.94 
 
 		 124 aa  186  7e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3552  ApaG  66.94 
 
 		 124 aa  186  7e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.144794  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3579  ApaG  66.94 
 
 		 124 aa  186  7e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1907  ApaG  66.94 
 
 		 124 aa  186  7e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3020  ApaG  64.84 
 
 		 137 aa  186  1e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.737478  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3175  ApaG  64.52 
 
 		 124 aa  186  1e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2878  ApaG  65.32 
 
 		 124 aa  181  3e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.289279  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3120  ApaG  66.13 
 
 		 124 aa  180  5.0000000000000004e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.802006  normal  0.119699 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2755  ApaG  66.13 
 
 		 124 aa  180  5.0000000000000004e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.263263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2695  ApaG  62.9 
 
 		 124 aa  179  9.000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.911706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3484  ApaG  54.76 
 
 		 127 aa  153  8e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.526547  normal  0.166283 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2231  ApaG  57.85 
 
 		 127 aa  153  9e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.340232  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3900  ApaG domain-containing protein  56.45 
 
 		 128 aa  151  2e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.195593 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3468  ApaG  55.83 
 
 		 124 aa  146  1.0000000000000001e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2372  ApaG  52.85 
 
 		 127 aa  145  2.0000000000000003e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3661  ApaG  53.85 
 
 		 142 aa  139  9e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1982  ApaG domain protein  52.07 
 
 		 130 aa  138  3e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.78252  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2722  ApaG domain protein  51.24 
 
 		 129 aa  137  4.999999999999999e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0437  ApaG  54.7 
 
 		 136 aa  136  1e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.30268 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0349  ApaG  52.14 
 
 		 135 aa  134  3.0000000000000003e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.093684  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2335  ApaG  52.07 
 
 		 126 aa  134  4e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0493  ApaG  55.17 
 
 		 131 aa  134  4e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4467  ApaG  52.14 
 
 		 131 aa  133  8e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.323841 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2636  ApaG  52.07 
 
 		 127 aa  132  9.999999999999999e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0222  ApaG  50.42 
 
 		 128 aa  133  9.999999999999999e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.954602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0735  ApaG  52.07 
 
 		 126 aa  133  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3413  ApaG  48.41 
 
 		 127 aa  132  9.999999999999999e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.329551  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07710  ApaG  51.24 
 
 		 126 aa  130  7.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0202441 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0360  ApaG  56.73 
 
 		 137 aa  130  7.999999999999999e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0586  ApaG  50.43 
 
 		 135 aa  130  7.999999999999999e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.12497  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0400  ApaG  47.93 
 
 		 126 aa  130  9e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46840  ApaG  50.41 
 
 		 126 aa  129  9e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0434  ApaG  47.93 
 
 		 126 aa  130  9e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.292503  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1346  ApaG  47.97 
 
 		 142 aa  129  2.0000000000000002e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.637296  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4802  ApaG  46.28 
 
 		 126 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.897217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0431  ApaG  47.11 
 
 		 126 aa  128  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.425394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0721  ApaG  48.74 
 
 		 156 aa  127  4.0000000000000003e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0531  ApaG  48.46 
 
 		 130 aa  127  6e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5136  ApaG  47.11 
 
 		 126 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0736  ApaG  49.18 
 
 		 123 aa  125  1.0000000000000001e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2359  ApaG domain protein  46.72 
 
 		 127 aa  126  1.0000000000000001e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.342277  hitchhiker  0.000000000770969 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2738  apaG protein  46.72 
 
 		 127 aa  126  1.0000000000000001e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6540  ApaG  49.18 
 
 		 130 aa  123  9e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.560513 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00054  hypothetical protein  46.77 
 
 		 125 aa  122  2e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.641296  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3549  ApaG domain protein  46.77 
 
 		 125 aa  122  2e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4628  ApaG  44.63 
 
 		 133 aa  122  2e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3605  ApaG  46.77 
 
 		 125 aa  122  2e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00118033 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0054  ApaG  46.77 
 
 		 125 aa  122  2e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.496379 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00053  hypothetical protein  46.77 
 
 		 125 aa  122  2e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.456951  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3833  ApaG  43.55 
 
 		 125 aa  122  2e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0044  ApaG  46.77 
 
 		 125 aa  122  2e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.271562  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0056  ApaG  46.77 
 
 		 125 aa  122  2e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0915002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0056  ApaG  46.77 
 
 		 125 aa  122  2e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0054  ApaG  46.77 
 
 		 125 aa  122  2e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00391573  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0550  apaG protein  44.63 
 
 		 126 aa  121  3e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.589067  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03415  ApaG  45.16 
 
 		 124 aa  121  3e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.250185  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7451  ApaG  48.36 
 
 		 130 aa  120  8e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.953585  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0667  ApaG  47.93 
 
 		 135 aa  119  9.999999999999999e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04646  ApaG  48.76 
 
 		 127 aa  119  9.999999999999999e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0854079  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0898  ApaG  47.58 
 
 		 140 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3636  ApaG  42.74 
 
 		 125 aa  119  9.999999999999999e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4031  ApaG  46.83 
 
 		 125 aa  118  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00953692  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0420  ApaG domain protein  46.46 
 
 		 211 aa  119  1.9999999999999998e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.416529 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0787  ApaG  46.77 
 
 		 145 aa  117  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.539898  normal  0.0936673 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5255  ApaG  46.77 
 
 		 130 aa  117  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.178875  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0095  ApaG  45.16 
 
 		 125 aa  117  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0093  ApaG  45.16 
 
 		 125 aa  117  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.574173 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0599  ApaG  46.22 
 
 		 125 aa  117  4.9999999999999996e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.121399  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0094  ApaG  45.16 
 
 		 125 aa  117  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.237472  normal  0.301698 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0098  ApaG  45.16 
 
 		 125 aa  117  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.267128  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0100  ApaG  45.16 
 
 		 125 aa  117  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.819852  normal  0.574462 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0241  ApaG  50.41 
 
 		 126 aa  117  6e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.136647  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0562  ApaG  43.55 
 
 		 125 aa  117  6e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0601  ApaG  45.97 
 
 		 125 aa  116  7.999999999999999e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4014  ApaG  45.45 
 
 		 126 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4913  ApaG  45.97 
 
 		 140 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.468217 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0921  ApaG  45 
 
 		 127 aa  115  3e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.116399  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4173  ApaG  46.83 
 
 		 125 aa  115  3e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0244735  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1279  ApaG domain protein  47.06 
 
 		 142 aa  114  3.9999999999999997e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.638394  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0408  ApaG  49.18 
 
 		 130 aa  114  3.9999999999999997e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.833726  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1015  ApaG domain protein  47.01 
 
 		 130 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000524176 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1039  ApaG domain-containing protein  46.15 
 
 		 130 aa  114  5e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3574  ApaG  43.7 
 
 		 125 aa  114  5e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4147  ApaG  46.83 
 
 		 125 aa  114  5e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0310361  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3445  ApaG  43.7 
 
 		 125 aa  114  5e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.310149  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>