170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1237 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_1237  ApaG  100 
 
 
158 aa  326  8e-89  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2661  ApaG  54.73 
 
 
157 aa  156  1e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.00116294  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1033  ApaG  50.81 
 
 
134 aa  136  8.999999999999999e-32  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0829  ApaG  50 
 
 
134 aa  136  1e-31  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  decreased coverage  0.00542439  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0304  ApaG  51.22 
 
 
130 aa  135  2e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0380419  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0397  ApaG  53.66 
 
 
130 aa  135  2e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0317  ApaG  49.22 
 
 
141 aa  135  3.0000000000000003e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0491  ApaG  53.08 
 
 
130 aa  134  4e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.735069  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0408  ApaG  48.09 
 
 
130 aa  131  3e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.833726  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1141  ApaG  42.74 
 
 
133 aa  130  6.999999999999999e-30  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0223  ApaG  48.12 
 
 
172 aa  129  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0179  ApaG  50.41 
 
 
130 aa  127  7.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.386018  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0135  ApaG  47.69 
 
 
237 aa  125  3e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.903636  normal  0.829835 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0189  ApaG  49.59 
 
 
130 aa  124  4.0000000000000003e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.57181  normal  0.332972 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5255  ApaG  48.39 
 
 
130 aa  124  5e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.178875  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0543  ApaG  49.59 
 
 
130 aa  123  8.000000000000001e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0130  ApaG  47.15 
 
 
130 aa  123  8.000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.431164 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0787  ApaG  45.86 
 
 
145 aa  123  1e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.539898  normal  0.0936673 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4913  ApaG  50.81 
 
 
140 aa  123  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.468217 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0898  ApaG  48.39 
 
 
140 aa  123  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1015  ApaG domain protein  43.51 
 
 
130 aa  121  3e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000524176 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0072  ApaG  44.62 
 
 
144 aa  119  9.999999999999999e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0420  ApaG domain protein  47.62 
 
 
211 aa  119  1.9999999999999998e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.416529 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0764  ApaG  48.39 
 
 
131 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0925231  hitchhiker  0.00575768 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1039  ApaG domain-containing protein  43.08 
 
 
130 aa  117  7e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0438  ApaG  44.62 
 
 
130 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.500146  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3636  ApaG  47.93 
 
 
125 aa  116  9.999999999999999e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2312  ApaG  45.38 
 
 
130 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.661489  normal  0.04269 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0402  ApaG  44.62 
 
 
130 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.104997  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0370  ApaG  44.62 
 
 
130 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.292548  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3833  ApaG  47.11 
 
 
125 aa  115  3e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7451  ApaG  43.85 
 
 
130 aa  115  3e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.953585  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0470  ApaG  46.77 
 
 
130 aa  115  3e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.327059 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6540  ApaG  43.85 
 
 
130 aa  114  5e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.560513 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0667  ApaG  49.18 
 
 
135 aa  114  6e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2231  ApaG  48.28 
 
 
127 aa  114  6e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.340232  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0531  ApaG  49.12 
 
 
130 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3413  ApaG  47.54 
 
 
127 aa  112  1.0000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.329551  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2860  ApaG  47.46 
 
 
126 aa  113  1.0000000000000001e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00242464  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2636  ApaG  47.01 
 
 
127 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3574  ApaG  47.15 
 
 
125 aa  111  3e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3445  ApaG  47.15 
 
 
125 aa  111  3e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.310149  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1982  ApaG domain protein  46.15 
 
 
130 aa  111  4.0000000000000004e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.78252  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1197  ApaG  51.85 
 
 
134 aa  111  4.0000000000000004e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0562  ApaG  47.9 
 
 
125 aa  110  5e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0773  ApaG  47.15 
 
 
125 aa  110  6e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0328045  normal  0.124499 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0736  ApaG  42.74 
 
 
123 aa  109  1.0000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1660  ApaG  46.77 
 
 
154 aa  109  1.0000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.453905  normal  0.120686 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0601  ApaG  47.06 
 
 
125 aa  109  1.0000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2738  apaG protein  49.56 
 
 
127 aa  108  4.0000000000000004e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2359  ApaG domain protein  49.56 
 
 
127 aa  108  4.0000000000000004e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.342277  hitchhiker  0.000000000770969 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0723  ApaG  49.11 
 
 
125 aa  108  4.0000000000000004e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.854022 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0197  ApaG  47.11 
 
 
128 aa  107  5e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.190971  normal  0.154239 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0270  ApaG  48.53 
 
 
135 aa  107  8.000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2335  ApaG  44.72 
 
 
126 aa  107  8.000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2722  ApaG domain protein  44.83 
 
 
129 aa  106  1e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1289  ApaG  45.38 
 
 
127 aa  106  1e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1353  ApaG  45.38 
 
 
127 aa  106  1e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.214186  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0493  ApaG  44.35 
 
 
131 aa  106  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0963  ApaG  43.59 
 
 
126 aa  106  1e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0222  ApaG  44.07 
 
 
128 aa  105  2e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.954602  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4147  ApaG  48.76 
 
 
125 aa  105  2e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0310361  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4173  ApaG  48.76 
 
 
125 aa  105  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0244735  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0400  ApaG  44.83 
 
 
126 aa  105  3e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4031  ApaG  47.93 
 
 
125 aa  105  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00953692  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0434  ApaG  44.83 
 
 
126 aa  105  3e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.292503  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4802  ApaG  43.97 
 
 
126 aa  104  5e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.897217  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0431  ApaG  44.83 
 
 
126 aa  104  5e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.425394  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0338  ApaG domain protein  46.67 
 
 
127 aa  104  6e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0735  ApaG  46.55 
 
 
126 aa  103  7e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2755  ApaG  45.6 
 
 
124 aa  103  7e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.263263  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0247  ApaG domain protein  42.62 
 
 
128 aa  103  8e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00311466 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001666  ApaG protein  41.88 
 
 
126 aa  103  8e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1013  ApaG  41.03 
 
 
126 aa  103  8e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.156243  hitchhiker  0.00045551 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2372  ApaG  44.83 
 
 
127 aa  103  9e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3120  ApaG  45.6 
 
 
124 aa  103  9e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.802006  normal  0.119699 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0904  ApaG  41.03 
 
 
126 aa  103  1e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.764534  normal  0.43881 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2660  ApaG  46.34 
 
 
139 aa  102  2e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3116  ApaG  41.03 
 
 
126 aa  102  2e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3210  ApaG  41.03 
 
 
126 aa  102  2e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.664218  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2820  ApaG  42.74 
 
 
128 aa  102  2e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.841755 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0599  ApaG  44.74 
 
 
125 aa  102  2e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.121399  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0861  ApaG  39.32 
 
 
126 aa  102  2e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07710  ApaG  46.55 
 
 
126 aa  102  3e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0202441 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0150  ApaG  46.55 
 
 
124 aa  102  3e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03415  ApaG  43.09 
 
 
124 aa  101  3e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.250185  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0878  ApaG  41.88 
 
 
126 aa  101  4e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0550  apaG protein  43.97 
 
 
126 aa  101  5e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.589067  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4628  ApaG  40.48 
 
 
133 aa  101  5e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3020  ApaG  46.15 
 
 
137 aa  101  5e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.737478  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3640  ApaG  40.5 
 
 
126 aa  100  6e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3549  ApaG domain protein  42.86 
 
 
125 aa  100  8e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1346  ApaG  44.83 
 
 
142 aa  100  8e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.637296  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00053  hypothetical protein  42.86 
 
 
125 aa  100  8e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.456951  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0054  ApaG  42.86 
 
 
125 aa  100  8e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.496379 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3605  ApaG  42.86 
 
 
125 aa  100  8e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00118033 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0988  ApaG  41.03 
 
 
126 aa  100  8e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.233116  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0056  ApaG  42.86 
 
 
125 aa  100  8e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0915002  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0056  ApaG  42.86 
 
 
125 aa  100  8e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0054  ApaG  42.86 
 
 
125 aa  100  8e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00391573  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>