170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0721 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_0721  ApaG  100 
 
 
156 aa  322  9e-88  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0437  ApaG  61.03 
 
 
136 aa  181  3e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.30268 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0349  ApaG  58.52 
 
 
135 aa  171  3.9999999999999995e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.093684  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0586  ApaG  58.39 
 
 
135 aa  165  2.9999999999999998e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.12497  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3661  ApaG  57.35 
 
 
142 aa  164  4e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4467  ApaG  55.56 
 
 
131 aa  159  1e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.323841 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0493  ApaG  54.07 
 
 
131 aa  159  2e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0360  ApaG  59.84 
 
 
137 aa  157  6e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0466  ApaG  53.96 
 
 
147 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.357414  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3120  ApaG  58.97 
 
 
124 aa  150  8.999999999999999e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.802006  normal  0.119699 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2878  ApaG  57.26 
 
 
124 aa  149  1e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.289279  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2755  ApaG  58.97 
 
 
124 aa  149  1e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.263263  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2857  ApaG  58.97 
 
 
124 aa  149  1e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.93069  normal  0.818828 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3624  ApaG  57.63 
 
 
124 aa  148  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.815881 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2568  ApaG  57.63 
 
 
124 aa  148  2e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0537  ApaG  57.63 
 
 
124 aa  148  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.371391  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0442  ApaG  57.63 
 
 
124 aa  148  3e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3900  ApaG domain-containing protein  55.83 
 
 
128 aa  148  3e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.195593 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0509  ApaG  57.63 
 
 
124 aa  147  7e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0536  ApaG  57.26 
 
 
124 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.680201  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0641  ApaG  57.26 
 
 
124 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0937  ApaG  57.26 
 
 
124 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3552  ApaG  57.26 
 
 
124 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.144794  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3579  ApaG  57.26 
 
 
124 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1907  ApaG  57.26 
 
 
124 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2906  ApaG  56.78 
 
 
185 aa  144  3e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.809331  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3571  ApaG  56.78 
 
 
185 aa  144  6e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458352  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0464  ApaG  55.08 
 
 
124 aa  144  6e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0531  ApaG  52.54 
 
 
130 aa  142  1e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3493  ApaG  55.08 
 
 
124 aa  143  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00288381  decreased coverage  0.0000301407 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3468  ApaG  55.56 
 
 
124 aa  141  4e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3175  ApaG  56.25 
 
 
124 aa  140  8e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2231  ApaG  55.75 
 
 
127 aa  139  9.999999999999999e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.340232  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3020  ApaG  57.14 
 
 
137 aa  138  3e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.737478  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3484  ApaG  52.54 
 
 
127 aa  135  2e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.526547  normal  0.166283 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2695  ApaG  51.69 
 
 
124 aa  134  4e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.911706  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2372  ApaG  53.98 
 
 
127 aa  133  9.999999999999999e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0150  ApaG  51.28 
 
 
124 aa  128  3e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0164  ApaG  48.74 
 
 
130 aa  127  5.0000000000000004e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.703501  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2738  apaG protein  53.45 
 
 
127 aa  127  7.000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2359  ApaG domain protein  53.45 
 
 
127 aa  127  7.000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.342277  hitchhiker  0.000000000770969 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2636  ApaG  52.68 
 
 
127 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0222  ApaG  51.79 
 
 
128 aa  125  2.0000000000000002e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.954602  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2722  ApaG domain protein  46.97 
 
 
129 aa  125  3e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0764  ApaG  47.18 
 
 
131 aa  122  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0925231  hitchhiker  0.00575768 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07710  ApaG  49.12 
 
 
126 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0202441 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2335  ApaG  49.56 
 
 
126 aa  120  9.999999999999999e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6540  ApaG  48.67 
 
 
130 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.560513 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0667  ApaG  52.68 
 
 
135 aa  119  1.9999999999999998e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46840  ApaG  47.41 
 
 
126 aa  118  3e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04646  ApaG  50 
 
 
127 aa  117  4.9999999999999996e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0854079  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7451  ApaG  48.67 
 
 
130 aa  117  6e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.953585  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0735  ApaG  48.25 
 
 
126 aa  117  6e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0420  ApaG domain protein  46.15 
 
 
211 aa  117  7e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.416529 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4031  ApaG  50 
 
 
125 aa  116  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00953692  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1039  ApaG domain-containing protein  46.09 
 
 
130 aa  116  9.999999999999999e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4173  ApaG  50 
 
 
125 aa  115  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0244735  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0550  apaG protein  47.79 
 
 
126 aa  115  3e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.589067  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4802  ApaG  45.69 
 
 
126 aa  115  3e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.897217  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1015  ApaG domain protein  46.09 
 
 
130 aa  114  3e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000524176 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1197  ApaG  49.04 
 
 
134 aa  114  3.9999999999999997e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3413  ApaG  50.45 
 
 
127 aa  114  3.9999999999999997e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.329551  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0898  ApaG  45.99 
 
 
140 aa  114  6e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0438  ApaG  49.11 
 
 
130 aa  113  8.999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.500146  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0402  ApaG  49.11 
 
 
130 aa  113  8.999999999999998e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.104997  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0370  ApaG  49.11 
 
 
130 aa  113  8.999999999999998e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.292548  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4147  ApaG  50 
 
 
125 aa  113  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0310361  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4014  ApaG  44.83 
 
 
126 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0179  ApaG  44.83 
 
 
130 aa  111  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.386018  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4628  ApaG  44.54 
 
 
133 aa  111  3e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0135  ApaG  45.99 
 
 
237 aa  112  3e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.903636  normal  0.829835 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0736  ApaG  45.54 
 
 
123 aa  111  3e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0130  ApaG  47.41 
 
 
130 aa  112  3e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.431164 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0400  ApaG  44.83 
 
 
126 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5136  ApaG  44.83 
 
 
126 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0434  ApaG  44.83 
 
 
126 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.292503  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0562  ApaG  48.18 
 
 
125 aa  111  4.0000000000000004e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0431  ApaG  44.83 
 
 
126 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.425394  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0189  ApaG  45.22 
 
 
130 aa  111  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.57181  normal  0.332972 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2312  ApaG  48.21 
 
 
130 aa  110  5e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.661489  normal  0.04269 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0491  ApaG  47.32 
 
 
130 aa  110  5e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.735069  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5255  ApaG  43.61 
 
 
130 aa  110  6e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.178875  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0408  ApaG  48.25 
 
 
130 aa  110  6e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.833726  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4913  ApaG  46.03 
 
 
140 aa  110  7.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.468217 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0396  ApaG  50.43 
 
 
124 aa  110  7.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.352913  hitchhiker  0.000351729 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1982  ApaG domain protein  44.64 
 
 
130 aa  110  8.000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.78252  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1346  ApaG  48.18 
 
 
142 aa  110  1.0000000000000001e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.637296  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0787  ApaG  42.25 
 
 
145 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.539898  normal  0.0936673 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0543  ApaG  45.22 
 
 
130 aa  108  2.0000000000000002e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1289  ApaG  49.14 
 
 
127 aa  108  3e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1353  ApaG  49.14 
 
 
127 aa  108  3e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.214186  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3833  ApaG  47.27 
 
 
125 aa  107  4.0000000000000004e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0223  ApaG  47.24 
 
 
172 aa  108  4.0000000000000004e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0601  ApaG  47.27 
 
 
125 aa  107  6e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1660  ApaG  45.95 
 
 
154 aa  107  8.000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.453905  normal  0.120686 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2820  ApaG  44.64 
 
 
128 aa  107  8.000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.841755 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0093  ApaG  45.45 
 
 
125 aa  106  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.574173 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0094  ApaG  45.45 
 
 
125 aa  106  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.237472  normal  0.301698 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0098  ApaG  45.45 
 
 
125 aa  106  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.267128  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0100  ApaG  45.45 
 
 
125 aa  106  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.819852  normal  0.574462 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>