170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_3080 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_3080  ApaG  100 
 
 		 126 aa  261  2e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2889  ApaG  68.91 
 
 		 126 aa  178  2e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.203189  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0976  ApaG  64.29 
 
 		 126 aa  177  4.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.13666  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3314  ApaG  64.29 
 
 		 126 aa  177  4.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1045  ApaG  64.29 
 
 		 126 aa  177  4.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.102627  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0904  ApaG  63.49 
 
 		 126 aa  175  2e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.764534  normal  0.43881 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2820  ApaG  66.67 
 
 		 128 aa  175  2e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.841755 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1078  ApaG  63.49 
 
 		 126 aa  175  2e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.804618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3116  ApaG  63.49 
 
 		 126 aa  174  3e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0988  ApaG  62.7 
 
 		 126 aa  174  5e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.233116  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3210  ApaG  63.49 
 
 		 126 aa  172  9e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.664218  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3640  ApaG  62.7 
 
 		 126 aa  170  6.999999999999999e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0878  ApaG  63.49 
 
 		 126 aa  167  4e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0963  ApaG  61.11 
 
 		 126 aa  166  1e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1013  ApaG  60.32 
 
 		 126 aa  160  5.0000000000000005e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.156243  hitchhiker  0.00045551 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0861  ApaG  56.35 
 
 		 126 aa  157  4e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4014  ApaG  54.76 
 
 		 126 aa  138  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0735  ApaG  51.59 
 
 		 126 aa  134  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001666  ApaG protein  50.4 
 
 		 126 aa  132  9.999999999999999e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1982  ApaG domain protein  54.24 
 
 		 130 aa  132  9.999999999999999e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.78252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07710  ApaG  51.59 
 
 		 126 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0202441 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2860  ApaG  52.54 
 
 		 126 aa  130  6e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00242464  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4802  ApaG  50 
 
 		 126 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.897217  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3636  ApaG  47.06 
 
 		 125 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0431  ApaG  50 
 
 		 126 aa  128  3e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.425394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0420  ApaG domain protein  50.43 
 
 		 211 aa  127  5.0000000000000004e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.416529 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0601  ApaG  47.9 
 
 		 125 aa  127  7.000000000000001e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0400  ApaG  49.21 
 
 		 126 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3574  ApaG  45.97 
 
 		 125 aa  125  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0222  ApaG  52.17 
 
 		 128 aa  126  1.0000000000000001e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.954602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0434  ApaG  49.21 
 
 		 126 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.292503  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3445  ApaG  45.97 
 
 		 125 aa  125  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.310149  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00807  ApaG  47.2 
 
 		 126 aa  125  1.0000000000000001e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0723  ApaG  50 
 
 		 125 aa  126  1.0000000000000001e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.854022 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0773  ApaG  45.97 
 
 		 125 aa  125  1.0000000000000001e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0328045  normal  0.124499 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0736  ApaG  51.26 
 
 		 123 aa  125  2.0000000000000002e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3833  ApaG  46.22 
 
 		 125 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2231  ApaG  50.42 
 
 		 127 aa  124  5e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.340232  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2738  apaG protein  49.58 
 
 		 127 aa  123  7e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0093  ApaG  50 
 
 		 125 aa  123  7e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.574173 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0095  ApaG  50 
 
 		 125 aa  123  7e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0100  ApaG  50 
 
 		 125 aa  123  7e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.819852  normal  0.574462 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0098  ApaG  50 
 
 		 125 aa  123  7e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.267128  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2359  ApaG domain protein  49.58 
 
 		 127 aa  123  7e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.342277  hitchhiker  0.000000000770969 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0094  ApaG  50 
 
 		 125 aa  123  7e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.237472  normal  0.301698 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1346  ApaG  50.86 
 
 		 142 aa  123  8.000000000000001e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.637296  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0550  apaG protein  50.41 
 
 		 126 aa  123  9e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.589067  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0562  ApaG  46.22 
 
 		 125 aa  122  2e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2722  ApaG domain protein  49.58 
 
 		 129 aa  122  2e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0764  ApaG  47.83 
 
 		 131 aa  122  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0925231  hitchhiker  0.00575768 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46840  ApaG  46.83 
 
 		 126 aa  120  6e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0599  ApaG  49.17 
 
 		 125 aa  120  6e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.121399  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2372  ApaG  50.42 
 
 		 127 aa  120  7e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2335  ApaG  46.03 
 
 		 126 aa  120  7e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5136  ApaG  47.62 
 
 		 126 aa  120  8e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00054  hypothetical protein  48.39 
 
 		 125 aa  120  9e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.641296  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3549  ApaG domain protein  48.39 
 
 		 125 aa  120  9e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0054  ApaG  48.39 
 
 		 125 aa  120  9e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.496379 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0056  ApaG  48.39 
 
 		 125 aa  120  9e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0915002  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00053  hypothetical protein  48.39 
 
 		 125 aa  120  9e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.456951  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0044  ApaG  48.39 
 
 		 125 aa  120  9e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.271562  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3605  ApaG  48.39 
 
 		 125 aa  120  9e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00118033 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0056  ApaG  48.39 
 
 		 125 aa  120  9e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0054  ApaG  48.39 
 
 		 125 aa  120  9e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00391573  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4628  ApaG  50 
 
 		 133 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3413  ApaG  47.06 
 
 		 127 aa  119  9.999999999999999e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.329551  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5255  ApaG  46.09 
 
 		 130 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.178875  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1050  ApaG  49.57 
 
 		 124 aa  118  1.9999999999999998e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0328783  normal  0.737772 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0898  ApaG  45.22 
 
 		 140 aa  116  7.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0787  ApaG  45.22 
 
 		 145 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.539898  normal  0.0936673 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2636  ApaG  44.54 
 
 		 127 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0493  ApaG  46.09 
 
 		 131 aa  114  3e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1279  ApaG domain protein  45.9 
 
 		 142 aa  113  8.999999999999998e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.638394  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0130  ApaG  45.38 
 
 		 130 aa  113  8.999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.431164 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3422  ApaG  45.83 
 
 		 133 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.687346  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0179  ApaG  45.38 
 
 		 130 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.386018  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4913  ApaG  45.22 
 
 		 140 aa  111  3e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.468217 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0189  ApaG  45.38 
 
 		 130 aa  111  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.57181  normal  0.332972 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1039  ApaG domain-containing protein  43.8 
 
 		 130 aa  110  5e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2878  ApaG  43.65 
 
 		 124 aa  110  6e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.289279  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2312  ApaG  41.88 
 
 		 130 aa  110  9e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.661489  normal  0.04269 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3484  ApaG  45.22 
 
 		 127 aa  109  1.0000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.526547  normal  0.166283 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6540  ApaG  42.74 
 
 		 130 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.560513 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1353  ApaG  46.15 
 
 		 127 aa  109  1.0000000000000001e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.214186  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1289  ApaG  46.15 
 
 		 127 aa  109  1.0000000000000001e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0402  ApaG  42.61 
 
 		 130 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.104997  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0491  ApaG  46.09 
 
 		 130 aa  108  2.0000000000000002e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.735069  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0438  ApaG  42.61 
 
 		 130 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.500146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0370  ApaG  42.61 
 
 		 130 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.292548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0396  ApaG  46.43 
 
 		 124 aa  108  3e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.352913  hitchhiker  0.000351729 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0408  ApaG  45.45 
 
 		 130 aa  108  3e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.833726  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0543  ApaG  41.88 
 
 		 130 aa  107  4.0000000000000004e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7451  ApaG  42.61 
 
 		 130 aa  107  5e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.953585  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0397  ApaG  45.22 
 
 		 130 aa  107  5e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3120  ApaG  43.7 
 
 		 124 aa  107  8.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.802006  normal  0.119699 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3661  ApaG  47.32 
 
 		 142 aa  106  8.000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3493  ApaG  45.9 
 
 		 124 aa  106  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00288381  decreased coverage  0.0000301407 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3020  ApaG  43.44 
 
 		 137 aa  106  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.737478  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2755  ApaG  43.7 
 
 		 124 aa  106  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.263263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0437  ApaG  47.32 
 
 		 136 aa  106  1e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.30268 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>