170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0017 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_0017  ApaG  100 
 
 		 128 aa  269  1e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.755409  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0247  ApaG domain protein  61.72 
 
 		 128 aa  178  2e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00311466 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0197  ApaG  59.38 
 
 		 128 aa  167  4e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.190971  normal  0.154239 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2587  ApaG  60.94 
 
 		 128 aa  153  6e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0222  ApaG  56.25 
 
 		 128 aa  135  2e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.578122  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0338  ApaG domain protein  51.24 
 
 		 127 aa  114  3.9999999999999997e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1758  ApaG  42.19 
 
 		 128 aa  114  5e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0304  ApaG  46.77 
 
 		 130 aa  113  6.9999999999999995e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0380419  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2860  ApaG  49.17 
 
 		 126 aa  113  1.0000000000000001e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00242464  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3413  ApaG  45.83 
 
 		 127 aa  111  3e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.329551  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2312  ApaG  44 
 
 		 130 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.661489  normal  0.04269 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0397  ApaG  47.58 
 
 		 130 aa  110  7.000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12178  hypothetical protein  44.53 
 
 		 128 aa  110  8.000000000000001e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001666  ApaG protein  48.33 
 
 		 126 aa  109  1.0000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0402  ApaG  44.8 
 
 		 130 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.104997  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0072  ApaG  46.77 
 
 		 144 aa  109  1.0000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0438  ApaG  44 
 
 		 130 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.500146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0370  ApaG  44.8 
 
 		 130 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.292548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0317  ApaG  45.16 
 
 		 141 aa  108  2.0000000000000002e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00807  ApaG  47.5 
 
 		 126 aa  108  2.0000000000000002e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0491  ApaG  47.9 
 
 		 130 aa  108  3e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.735069  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0223  ApaG  42.74 
 
 		 172 aa  108  4.0000000000000004e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6540  ApaG  45.6 
 
 		 130 aa  107  5e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.560513 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0735  ApaG  46.67 
 
 		 126 aa  107  6e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0135  ApaG  41.94 
 
 		 237 aa  106  1e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.903636  normal  0.829835 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2722  ApaG domain protein  45 
 
 		 129 aa  105  1e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07710  ApaG  46.67 
 
 		 126 aa  106  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0202441 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3636  ApaG  46.55 
 
 		 125 aa  105  2e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0420  ApaG domain protein  42.98 
 
 		 211 aa  105  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.416529 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0400  ApaG  43.33 
 
 		 126 aa  105  3e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7451  ApaG  45.6 
 
 		 130 aa  105  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.953585  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4173  ApaG  42.19 
 
 		 125 aa  104  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0244735  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1197  ApaG  49.54 
 
 		 134 aa  105  3e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0434  ApaG  43.33 
 
 		 126 aa  105  3e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.292503  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0963  ApaG  43.31 
 
 		 126 aa  104  3e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4031  ApaG  42.19 
 
 		 125 aa  104  4e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00953692  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4913  ApaG  43.55 
 
 		 140 aa  104  4e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.468217 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0723  ApaG  48.28 
 
 		 125 aa  104  4e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.854022 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0431  ApaG  43.33 
 
 		 126 aa  104  4e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.425394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2231  ApaG  45.45 
 
 		 127 aa  104  5e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.340232  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0130  ApaG  43.55 
 
 		 130 aa  104  5e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.431164 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4802  ApaG  42.5 
 
 		 126 aa  103  7e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.897217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3080  ApaG  45.69 
 
 		 126 aa  103  7e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4147  ApaG  42.19 
 
 		 125 aa  103  7e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0310361  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00054  hypothetical protein  46.55 
 
 		 125 aa  103  8e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.641296  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3549  ApaG domain protein  46.55 
 
 		 125 aa  103  8e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3605  ApaG  46.55 
 
 		 125 aa  103  8e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00118033 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0044  ApaG  46.55 
 
 		 125 aa  103  8e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.271562  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2660  ApaG  45.24 
 
 		 139 aa  103  8e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00053  hypothetical protein  46.55 
 
 		 125 aa  103  8e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.456951  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0056  ApaG  46.55 
 
 		 125 aa  103  8e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0915002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0599  ApaG  47.41 
 
 		 125 aa  103  8e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.121399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0056  ApaG  46.55 
 
 		 125 aa  103  8e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0054  ApaG  46.55 
 
 		 125 aa  103  8e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00391573  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0054  ApaG  46.55 
 
 		 125 aa  103  8e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.496379 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0222  ApaG  43.8 
 
 		 128 aa  103  9e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.954602  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2820  ApaG  43.31 
 
 		 128 aa  102  1e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.841755 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0408  ApaG  44 
 
 		 130 aa  103  1e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.833726  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1237  ApaG  43.44 
 
 		 158 aa  102  2e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3833  ApaG  44.83 
 
 		 125 aa  102  2e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0562  ApaG  47.41 
 
 		 125 aa  102  2e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0861  ApaG  41.13 
 
 		 126 aa  102  2e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1346  ApaG  45 
 
 		 142 aa  102  3e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.637296  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0898  ApaG  41.94 
 
 		 140 aa  101  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0189  ApaG  45.16 
 
 		 130 aa  101  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.57181  normal  0.332972 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0470  ApaG  43.2 
 
 		 130 aa  101  3e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.327059 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1039  ApaG domain-containing protein  42.4 
 
 		 130 aa  101  4e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2335  ApaG  44.63 
 
 		 126 aa  101  4e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0543  ApaG  42.74 
 
 		 130 aa  100  7e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0179  ApaG  44.35 
 
 		 130 aa  100  7e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.386018  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0093  ApaG  46.15 
 
 		 125 aa  100  8e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.574173 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0100  ApaG  46.15 
 
 		 125 aa  100  8e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.819852  normal  0.574462 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0094  ApaG  46.15 
 
 		 125 aa  100  8e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.237472  normal  0.301698 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0095  ApaG  46.15 
 
 		 125 aa  100  8e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0098  ApaG  46.15 
 
 		 125 aa  100  8e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.267128  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0787  ApaG  41.94 
 
 		 145 aa  99.4  1e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.539898  normal  0.0936673 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3422  ApaG  45.83 
 
 		 133 aa  99.4  1e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.687346  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0601  ApaG  47.41 
 
 		 125 aa  100  1e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2359  ApaG domain protein  44.74 
 
 		 127 aa  99.8  1e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.342277  hitchhiker  0.000000000770969 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2738  apaG protein  44.74 
 
 		 127 aa  99.8  1e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1982  ApaG domain protein  46.34 
 
 		 130 aa  99  2e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.78252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0904  ApaG  39.37 
 
 		 126 aa  99  2e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.764534  normal  0.43881 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1015  ApaG domain protein  41.73 
 
 		 130 aa  99  2e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000524176 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0988  ApaG  39.37 
 
 		 126 aa  99  2e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.233116  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3484  ApaG  46.36 
 
 		 127 aa  98.2  3e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.526547  normal  0.166283 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3116  ApaG  39.37 
 
 		 126 aa  98.6  3e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5255  ApaG  40.32 
 
 		 130 aa  98.2  3e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.178875  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3574  ApaG  44.83 
 
 		 125 aa  97.8  5e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3445  ApaG  44.83 
 
 		 125 aa  97.8  5e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.310149  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3314  ApaG  38.58 
 
 		 126 aa  97.1  7e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0976  ApaG  38.58 
 
 		 126 aa  97.1  7e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.13666  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1045  ApaG  38.58 
 
 		 126 aa  97.1  7e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.102627  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1078  ApaG  38.58 
 
 		 126 aa  97.1  7e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.804618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0773  ApaG  44.83 
 
 		 125 aa  97.1  8e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0328045  normal  0.124499 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5136  ApaG  43.8 
 
 		 126 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0736  ApaG  44.17 
 
 		 123 aa  96.3  1e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3175  ApaG  40.83 
 
 		 124 aa  96.7  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0878  ApaG  42.5 
 
 		 126 aa  96.3  1e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3210  ApaG  38.58 
 
 		 126 aa  95.9  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.664218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2661  ApaG  39.32 
 
 		 157 aa  95.9  2e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.00116294  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>