94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_1496 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_1715  hypothetical protein  79.53 
 
 		 513 aa  768    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000685021 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1496  hypothetical protein  100 
 
 		 522 aa  1050    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0734371 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1563  hypothetical protein  99.04 
 
 		 522 aa  1040    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.150626 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1557  hypothetical protein  99.43 
 
 		 522 aa  1043    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.750418  normal  0.28282 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1502  hypothetical protein  73.81 
 
 		 520 aa  766    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.342277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2386  hypothetical protein  77.38 
 
 		 509 aa  734    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.416992  normal  0.0308106 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2374  hypothetical protein  91.67 
 
 		 492 aa  874    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2448  hypothetical protein  63.37 
 
 		 513 aa  637    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000669935  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2592  hypothetical protein  63.56 
 
 		 513 aa  638    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000045044  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1358  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  64.71 
 
 		 492 aa  637    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000126812  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1678  hypothetical protein  77.71 
 
 		 514 aa  771    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.113687  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1354  hypothetical protein  64.5 
 
 		 492 aa  636    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000651661  normal  0.856488 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2454  hypothetical protein  63.56 
 
 		 513 aa  638    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000219916  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2876  hypothetical protein  79.64 
 
 		 513 aa  790    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00586434 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3438  hypothetical protein  63.56 
 
 		 513 aa  639    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000568736  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02183  hypothetical protein  63.37 
 
 		 506 aa  638    Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000257833  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000044  membrane protein  70.26 
 
 		 491 aa  695    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02223  predicted inner membrane protein  63.37 
 
 		 506 aa  638    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000247482  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2674  hypothetical protein  62.77 
 
 		 513 aa  633  1e-180  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000012139  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2688  hypothetical protein  62.62 
 
 		 506 aa  629  1e-179  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.831014 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2480  hypothetical protein  62.82 
 
 		 506 aa  631  1e-179  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.434803  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2568  hypothetical protein  62.82 
 
 		 506 aa  631  1e-179  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.801671 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2580  hypothetical protein  62.82 
 
 		 506 aa  631  1e-179  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.138083  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2525  hypothetical protein  62.82 
 
 		 506 aa  631  1e-179  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.449872 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0199  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  54.77 
 
 		 505 aa  558  1e-158  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1005  hypothetical protein  56.06 
 
 		 502 aa  556  1e-157  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2000  hypothetical protein  48 
 
 		 481 aa  468  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0420164  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1985  hypothetical protein  48 
 
 		 481 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2339  hypothetical protein  48.48 
 
 		 481 aa  467  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00278972  normal  0.0466746 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2048  hypothetical protein  47.8 
 
 		 481 aa  468  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0776324  normal  0.0346444 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2392  hypothetical protein  47.91 
 
 		 484 aa  425  1e-118  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.294283 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1853  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  34.61 
 
 		 461 aa  274  4.0000000000000004e-72  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.00000000000744962  normal  0.0199441 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2668  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  36.11 
 
 		 460 aa  254  2.0000000000000002e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1145  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  35.56 
 
 		 464 aa  248  2e-64  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.400945  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0766  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  32.85 
 
 		 477 aa  236  5.0000000000000005e-61  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.607983  normal  0.276485 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0553  C4-dicarboxylate anaerobic carrier dcuC  29.07 
 
 		 512 aa  229  8e-59  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  7.693670000000001e-19 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2242  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  32.54 
 
 		 478 aa  223  8e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.354885  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1836  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  30.29 
 
 		 517 aa  220  3.9999999999999997e-56  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1974  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  33.2 
 
 		 468 aa  220  5e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4645  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  32.14 
 
 		 477 aa  218  2e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0449  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  30.71 
 
 		 467 aa  217  2.9999999999999998e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.935589  normal  0.0170379 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4846  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  32 
 
 		 467 aa  216  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2124  hypothetical protein  29.54 
 
 		 517 aa  216  9.999999999999999e-55  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4261  C4-dicarboxylate anaerobic carrier-like protein  31.59 
 
 		 460 aa  216  9.999999999999999e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.118271 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4747  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  31.79 
 
 		 467 aa  214  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4810  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  31.79 
 
 		 467 aa  214  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.334996  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4866  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  31.79 
 
 		 467 aa  214  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4716  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  31.79 
 
 		 467 aa  214  3.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.226613  normal  0.397486 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0431  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  32.74 
 
 		 482 aa  213  7.999999999999999e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.73068  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2353  hypothetical protein  29.09 
 
 		 521 aa  210  5e-53  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00830  predicted membrane protein  30.86 
 
 		 520 aa  208  2e-52  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1568  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  29.41 
 
 		 528 aa  205  1e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.313123  normal  0.0213036 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1254  hypothetical protein  29.05 
 
 		 518 aa  203  6e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.111433  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1229  hypothetical protein  29.05 
 
 		 518 aa  203  6e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.941876  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01760  hypothetical protein  31.79 
 
 		 500 aa  200  5e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1054  C4-dicarboxylate anaerobic carrier family protein  31.44 
 
 		 502 aa  191  2e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.544295  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1242  putatve dicarboxylate transporter  30.43 
 
 		 502 aa  189  1e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0072618  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3322  putative transporter  28.6 
 
 		 476 aa  187  3e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.871023  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1908  putative transporter  27.83 
 
 		 476 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3048  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  27.97 
 
 		 476 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0103079  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1143  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  28.14 
 
 		 484 aa  184  4.0000000000000006e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.171784  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3342  putative transporter  27.82 
 
 		 476 aa  182  1e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3013  transporter  27.82 
 
 		 476 aa  181  2e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000189205  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3369  transporter  27.62 
 
 		 476 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04550  predicted membrane protein  28.73 
 
 		 528 aa  181  2.9999999999999997e-44  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3123  transporter  27.62 
 
 		 476 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000866663  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3328  transporter, putative  27.62 
 
 		 476 aa  181  4e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.162731  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1000  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  34.39 
 
 		 497 aa  180  4.999999999999999e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0219424  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3342  putative transporter  27.42 
 
 		 476 aa  180  7e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00045821  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1927  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  25.81 
 
 		 508 aa  167  4e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.148371  normal  0.0894208 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1891  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  26.6 
 
 		 464 aa  160  7e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0184  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  26.29 
 
 		 484 aa  153  5.9999999999999996e-36  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1835  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  25.58 
 
 		 492 aa  151  2e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1946  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  25.32 
 
 		 536 aa  150  4e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.185929  normal  0.387022 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0282  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  30.27 
 
 		 496 aa  149  9e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1545  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  25.56 
 
 		 505 aa  144  3e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0990  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  27.06 
 
 		 512 aa  137  4e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0496  C4-dicarboxylate anaerobic carrier family protein  31.03 
 
 		 504 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.774369  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0398  C4-dicarboxylate anaerobic carrier family protein  31.03 
 
 		 510 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2707  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  25.95 
 
 		 504 aa  136  9.999999999999999e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1825  C4-dicarboxylate anaerobic carrier family protein  31.03 
 
 		 520 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2129  C4-dicarboxylate anaerobic carrier family protein  30.26 
 
 		 495 aa  134  6e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0812  C4-dicarboxylate anaerobic carrier family protein  30.26 
 
 		 492 aa  134  6e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.371887  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1478  C4-dicarboxylate anaerobic carrier family protein  30.26 
 
 		 470 aa  133  7.999999999999999e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0056  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  31.13 
 
 		 300 aa  127  4.0000000000000003e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5568  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  24.52 
 
 		 477 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.262721  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2491  hypothetical protein  31.13 
 
 		 300 aa  127  4.0000000000000003e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0815  hypothetical protein  27.02 
 
 		 462 aa  119  9.999999999999999e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000488544  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl015  arginine-ornithine APC transporter  25.06 
 
 		 521 aa  110  7.000000000000001e-23  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0803  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  24.11 
 
 		 588 aa  90.1  9e-17  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0091  transporter, putative  24.94 
 
 		 489 aa  79  0.0000000000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1137  short chain fatty acid transporter  35.35 
 
 		 462 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.534367 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0537  AbgT putative transporter  35.71 
 
 		 529 aa  45.4  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.121882  normal  0.78057 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1352  AbgT putative transporter  32.58 
 
 		 519 aa  45.1  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.0000127247  normal  0.0238452 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>