94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_1502 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008577  Shewana3_1557  hypothetical protein  74.03 
 
 
522 aa  725    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.750418  normal  0.28282 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000044  membrane protein  68.55 
 
 
491 aa  659    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1563  hypothetical protein  76.06 
 
 
522 aa  720    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.150626 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1496  hypothetical protein  74.22 
 
 
522 aa  724    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0734371 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1502  hypothetical protein  100 
 
 
520 aa  1040    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.342277  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2386  hypothetical protein  72.3 
 
 
509 aa  668    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.416992  normal  0.0308106 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2374  hypothetical protein  74.25 
 
 
492 aa  711    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1715  hypothetical protein  72.74 
 
 
513 aa  702    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000685021 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2876  hypothetical protein  73.95 
 
 
513 aa  726    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00586434 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1678  hypothetical protein  69.5 
 
 
514 aa  698    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.113687  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2454  hypothetical protein  61.06 
 
 
513 aa  614  9.999999999999999e-175  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000219916  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2448  hypothetical protein  60.86 
 
 
513 aa  613  9.999999999999999e-175  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000669935  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2592  hypothetical protein  61.06 
 
 
513 aa  614  9.999999999999999e-175  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000045044  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3438  hypothetical protein  61.06 
 
 
513 aa  614  9.999999999999999e-175  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000568736  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02183  hypothetical protein  60.86 
 
 
506 aa  613  9.999999999999999e-175  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000257833  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02223  predicted inner membrane protein  60.86 
 
 
506 aa  613  9.999999999999999e-175  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000247482  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2674  hypothetical protein  60.27 
 
 
513 aa  608  1e-173  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000012139  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1354  hypothetical protein  61.45 
 
 
492 aa  605  9.999999999999999e-173  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000651661  normal  0.856488 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1358  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  61.65 
 
 
492 aa  606  9.999999999999999e-173  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000126812  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2525  hypothetical protein  59.88 
 
 
506 aa  607  9.999999999999999e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.449872 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2580  hypothetical protein  59.88 
 
 
506 aa  607  9.999999999999999e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.138083  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2568  hypothetical protein  59.88 
 
 
506 aa  607  9.999999999999999e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.801671 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2480  hypothetical protein  59.88 
 
 
506 aa  607  9.999999999999999e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.434803  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2688  hypothetical protein  59.69 
 
 
506 aa  606  9.999999999999999e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.831014 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0199  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  54.55 
 
 
505 aa  548  1e-155  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1005  hypothetical protein  55.42 
 
 
502 aa  530  1e-149  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2339  hypothetical protein  47.69 
 
 
481 aa  445  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00278972  normal  0.0466746 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1985  hypothetical protein  46.44 
 
 
481 aa  442  1e-123  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2000  hypothetical protein  46.64 
 
 
481 aa  443  1e-123  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0420164  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2048  hypothetical protein  46.84 
 
 
481 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0776324  normal  0.0346444 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2392  hypothetical protein  46.39 
 
 
484 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.294283 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1853  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  35.35 
 
 
461 aa  261  2e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.00000000000744962  normal  0.0199441 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1145  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  34.14 
 
 
464 aa  256  7e-67  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.400945  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2668  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  37.55 
 
 
460 aa  251  3e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0766  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  33.61 
 
 
477 aa  234  4.0000000000000004e-60  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.607983  normal  0.276485 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2124  hypothetical protein  31.05 
 
 
517 aa  225  2e-57  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1836  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  31.68 
 
 
517 aa  223  4.9999999999999996e-57  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1568  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  30.61 
 
 
528 aa  217  4e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.313123  normal  0.0213036 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00830  predicted membrane protein  30.38 
 
 
520 aa  214  1.9999999999999998e-54  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0553  C4-dicarboxylate anaerobic carrier dcuC  28.37 
 
 
512 aa  214  3.9999999999999995e-54  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  7.693670000000001e-19 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4261  C4-dicarboxylate anaerobic carrier-like protein  31.25 
 
 
460 aa  212  1e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.118271 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2353  hypothetical protein  30.96 
 
 
521 aa  210  5e-53  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1229  hypothetical protein  31.03 
 
 
518 aa  209  1e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.941876  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1254  hypothetical protein  31.03 
 
 
518 aa  209  1e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.111433  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1974  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  30.9 
 
 
468 aa  200  5e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4645  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  31.06 
 
 
477 aa  200  6e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2242  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  30.91 
 
 
478 aa  199  1.0000000000000001e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.354885  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0431  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  31.4 
 
 
482 aa  197  5.000000000000001e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.73068  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0449  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  29.47 
 
 
467 aa  193  7e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.935589  normal  0.0170379 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1143  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  28.71 
 
 
484 aa  192  9e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.171784  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4846  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  30.77 
 
 
467 aa  190  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04550  predicted membrane protein  29.29 
 
 
528 aa  191  4e-47  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01760  hypothetical protein  30.42 
 
 
500 aa  190  5e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1054  C4-dicarboxylate anaerobic carrier family protein  30.18 
 
 
502 aa  190  5.999999999999999e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.544295  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4716  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  30.77 
 
 
467 aa  189  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.226613  normal  0.397486 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4747  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  30.77 
 
 
467 aa  189  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1242  putatve dicarboxylate transporter  30.12 
 
 
502 aa  189  1e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0072618  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4866  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  30.56 
 
 
467 aa  188  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4810  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  30.56 
 
 
467 aa  188  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.334996  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1000  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  28.02 
 
 
497 aa  170  6e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0219424  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1927  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  28.29 
 
 
508 aa  170  7e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.148371  normal  0.0894208 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3048  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  26.34 
 
 
476 aa  169  9e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0103079  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1908  putative transporter  25.98 
 
 
476 aa  167  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3322  putative transporter  25.95 
 
 
476 aa  167  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.871023  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3013  transporter  25.98 
 
 
476 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000189205  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3342  putative transporter  25.98 
 
 
476 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00045821  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3369  transporter  25.98 
 
 
476 aa  164  3e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3123  transporter  25.98 
 
 
476 aa  164  3e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000866663  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3342  putative transporter  25.77 
 
 
476 aa  164  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3328  transporter, putative  25.98 
 
 
476 aa  164  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.162731  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1891  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  27.87 
 
 
464 aa  156  7e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1545  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  26.54 
 
 
505 aa  147  5e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1835  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  26.68 
 
 
492 aa  145  2e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0184  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  25.99 
 
 
484 aa  144  6e-33  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0282  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  30.97 
 
 
496 aa  143  7e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0990  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  27.87 
 
 
512 aa  141  3e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5568  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  25.35 
 
 
477 aa  137  7.000000000000001e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.262721  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0056  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  34.25 
 
 
300 aa  135  1.9999999999999998e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2491  hypothetical protein  34.25 
 
 
300 aa  135  1.9999999999999998e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1825  C4-dicarboxylate anaerobic carrier family protein  28.57 
 
 
520 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0398  C4-dicarboxylate anaerobic carrier family protein  28.57 
 
 
510 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0496  C4-dicarboxylate anaerobic carrier family protein  28.57 
 
 
504 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.774369  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1478  C4-dicarboxylate anaerobic carrier family protein  28.57 
 
 
470 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2129  C4-dicarboxylate anaerobic carrier family protein  28.57 
 
 
495 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0812  C4-dicarboxylate anaerobic carrier family protein  28.57 
 
 
492 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.371887  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2707  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  24.42 
 
 
504 aa  123  7e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl015  arginine-ornithine APC transporter  25.11 
 
 
521 aa  107  6e-22  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0815  hypothetical protein  25.15 
 
 
462 aa  105  2e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000488544  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1946  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  30.05 
 
 
536 aa  97.4  6e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.185929  normal  0.387022 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0803  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  23.87 
 
 
588 aa  87.8  4e-16  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0091  transporter, putative  25.85 
 
 
489 aa  79.7  0.0000000000001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1137  short chain fatty acid transporter  34.69 
 
 
462 aa  47  0.0009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.534367 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1352  AbgT putative transporter  32.58 
 
 
519 aa  46.2  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.0000127247  normal  0.0238452 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0537  AbgT putative transporter  33.93 
 
 
529 aa  45.1  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.121882  normal  0.78057 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>