91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP2353 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_1568  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  65.3 
 
 		 528 aa  689    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.313123  normal  0.0213036 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2353  hypothetical protein  100 
 
 		 521 aa  1046    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2124  hypothetical protein  68.22 
 
 		 517 aa  743    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00830  predicted membrane protein  61.09 
 
 		 520 aa  635    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1229  hypothetical protein  92.86 
 
 		 518 aa  978    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.941876  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1836  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  66.21 
 
 		 517 aa  683    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1254  hypothetical protein  92.86 
 
 		 518 aa  978    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.111433  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04550  predicted membrane protein  61.6 
 
 		 528 aa  628  1e-179  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0056  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  99.33 
 
 		 300 aa  601  1e-170  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2491  hypothetical protein  99.33 
 
 		 300 aa  601  1e-170  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1242  putatve dicarboxylate transporter  46.67 
 
 		 502 aa  465  9.999999999999999e-131  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0072618  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1054  C4-dicarboxylate anaerobic carrier family protein  46.87 
 
 		 502 aa  467  9.999999999999999e-131  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.544295  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1000  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  44.44 
 
 		 497 aa  440  9.999999999999999e-123  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0219424  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0553  C4-dicarboxylate anaerobic carrier dcuC  42.58 
 
 		 512 aa  402  9.999999999999999e-111  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  7.693670000000001e-19 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1835  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  37.73 
 
 		 492 aa  337  3.9999999999999995e-91  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4645  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  38.69 
 
 		 477 aa  316  6e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2242  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  37.18 
 
 		 478 aa  301  2e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.354885  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1974  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  35.77 
 
 		 468 aa  299  1e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0449  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  34.14 
 
 		 467 aa  289  7e-77  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.935589  normal  0.0170379 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4846  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  33.87 
 
 		 467 aa  277  3e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0431  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  34.9 
 
 		 482 aa  273  5.000000000000001e-72  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.73068  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4810  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  33.27 
 
 		 467 aa  271  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.334996  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4866  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  33.27 
 
 		 467 aa  271  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4716  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  33.27 
 
 		 467 aa  272  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.226613  normal  0.397486 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4747  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  33.27 
 
 		 467 aa  272  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2592  hypothetical protein  29.96 
 
 		 513 aa  211  2e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000045044  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02223  predicted inner membrane protein  29.96 
 
 		 506 aa  211  2e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000247482  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02183  hypothetical protein  29.96 
 
 		 506 aa  211  2e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000257833  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2448  hypothetical protein  29.96 
 
 		 513 aa  211  2e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000669935  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2454  hypothetical protein  29.96 
 
 		 513 aa  211  2e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000219916  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2674  hypothetical protein  29.51 
 
 		 513 aa  212  2e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000012139  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3438  hypothetical protein  29.96 
 
 		 513 aa  211  3e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000568736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1502  hypothetical protein  30.96 
 
 		 520 aa  210  5e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.342277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1853  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  28.43 
 
 		 461 aa  208  2e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.00000000000744962  normal  0.0199441 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1358  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  30.06 
 
 		 492 aa  207  5e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000126812  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1354  hypothetical protein  30.06 
 
 		 492 aa  206  7e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000651661  normal  0.856488 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1545  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  28.18 
 
 		 505 aa  204  2e-51  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2480  hypothetical protein  29.98 
 
 		 506 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.434803  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2568  hypothetical protein  29.98 
 
 		 506 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.801671 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2580  hypothetical protein  29.98 
 
 		 506 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.138083  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2525  hypothetical protein  29.98 
 
 		 506 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.449872 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2688  hypothetical protein  29.78 
 
 		 506 aa  204  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.831014 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0766  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  27.77 
 
 		 477 aa  202  9.999999999999999e-51  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.607983  normal  0.276485 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1715  hypothetical protein  29.88 
 
 		 513 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000685021 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1927  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  28.94 
 
 		 508 aa  199  1.0000000000000001e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.148371  normal  0.0894208 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0199  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  30.85 
 
 		 505 aa  196  9e-49  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2876  hypothetical protein  28.57 
 
 		 513 aa  196  1e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00586434 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2374  hypothetical protein  30.12 
 
 		 492 aa  194  3e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1005  hypothetical protein  28.82 
 
 		 502 aa  193  7e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1563  hypothetical protein  29.88 
 
 		 522 aa  192  1e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.150626 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1557  hypothetical protein  29.05 
 
 		 522 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.750418  normal  0.28282 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1496  hypothetical protein  29.05 
 
 		 522 aa  190  5.999999999999999e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0734371 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000044  membrane protein  29.67 
 
 		 491 aa  189  1e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2386  hypothetical protein  28.97 
 
 		 509 aa  187  3e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.416992  normal  0.0308106 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1145  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  30.12 
 
 		 464 aa  186  8e-46  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.400945  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2707  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  26.89 
 
 		 504 aa  185  2.0000000000000003e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4261  C4-dicarboxylate anaerobic carrier-like protein  26.73 
 
 		 460 aa  183  6e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.118271 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2668  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  28.92 
 
 		 460 aa  179  1e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2048  hypothetical protein  29.45 
 
 		 481 aa  179  2e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0776324  normal  0.0346444 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1985  hypothetical protein  29.65 
 
 		 481 aa  177  6e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0184  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  29.48 
 
 		 484 aa  176  9e-43  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1678  hypothetical protein  28.19 
 
 		 514 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.113687  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2000  hypothetical protein  29.45 
 
 		 481 aa  173  5.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0420164  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2339  hypothetical protein  29.04 
 
 		 481 aa  172  1e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00278972  normal  0.0466746 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0990  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  27.74 
 
 		 512 aa  157  3e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01760  hypothetical protein  26.97 
 
 		 500 aa  157  5.0000000000000005e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3322  putative transporter  25.29 
 
 		 476 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.871023  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3048  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  24.8 
 
 		 476 aa  152  2e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0103079  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1908  putative transporter  24.85 
 
 		 476 aa  152  2e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3342  putative transporter  24.51 
 
 		 476 aa  151  3e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00045821  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3013  transporter  24.95 
 
 		 476 aa  150  4e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000189205  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3342  putative transporter  24.95 
 
 		 476 aa  149  8e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3369  transporter  25.15 
 
 		 476 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3123  transporter  25.15 
 
 		 476 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000866663  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3328  transporter, putative  25.54 
 
 		 476 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.162731  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2392  hypothetical protein  26.48 
 
 		 484 aa  140  4.999999999999999e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.294283 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1143  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  25.44 
 
 		 484 aa  135  9.999999999999999e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.171784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5568  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  24.05 
 
 		 477 aa  133  6.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.262721  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl015  arginine-ornithine APC transporter  24.81 
 
 		 521 aa  130  9.000000000000001e-29  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0091  transporter, putative  25.76 
 
 		 489 aa  119  1.9999999999999998e-25  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0803  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  24.83 
 
 		 588 aa  117  5e-25  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0398  C4-dicarboxylate anaerobic carrier family protein  24.95 
 
 		 510 aa  110  8.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1825  C4-dicarboxylate anaerobic carrier family protein  24.95 
 
 		 520 aa  109  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0496  C4-dicarboxylate anaerobic carrier family protein  24.95 
 
 		 504 aa  108  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.774369  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1478  C4-dicarboxylate anaerobic carrier family protein  24.56 
 
 		 470 aa  105  1e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0812  C4-dicarboxylate anaerobic carrier family protein  24.76 
 
 		 492 aa  106  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.371887  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2129  C4-dicarboxylate anaerobic carrier family protein  24.76 
 
 		 495 aa  106  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1946  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  29.57 
 
 		 536 aa  104  3e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.185929  normal  0.387022 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1891  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  26.7 
 
 		 464 aa  105  3e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0282  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  23.16 
 
 		 496 aa  103  8e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0815  hypothetical protein  24.02 
 
 		 462 aa  93.2  1e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000488544  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>