92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_2392 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_2392  hypothetical protein  100 
 
 		 484 aa  948    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.294283 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2048  hypothetical protein  57.67 
 
 		 481 aa  549  1e-155  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0776324  normal  0.0346444 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1985  hypothetical protein  57.06 
 
 		 481 aa  546  1e-154  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2339  hypothetical protein  57.26 
 
 		 481 aa  545  1e-154  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00278972  normal  0.0466746 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2000  hypothetical protein  56.85 
 
 		 481 aa  545  1e-153  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0420164  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0199  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  46.69 
 
 		 505 aa  419  1e-116  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2876  hypothetical protein  46.26 
 
 		 513 aa  419  1e-116  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00586434 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1005  hypothetical protein  45.2 
 
 		 502 aa  419  1e-116  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1502  hypothetical protein  47.29 
 
 		 520 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.342277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2374  hypothetical protein  48.4 
 
 		 492 aa  415  1e-114  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1678  hypothetical protein  46.4 
 
 		 514 aa  409  1e-113  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.113687  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1496  hypothetical protein  48.85 
 
 		 522 aa  410  1e-113  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0734371 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1557  hypothetical protein  48.85 
 
 		 522 aa  411  1e-113  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.750418  normal  0.28282 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1563  hypothetical protein  48.95 
 
 		 522 aa  408  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.150626 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1715  hypothetical protein  46.64 
 
 		 513 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000685021 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000044  membrane protein  46.77 
 
 		 491 aa  389  1e-107  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2386  hypothetical protein  47.01 
 
 		 509 aa  377  1e-103  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.416992  normal  0.0308106 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2525  hypothetical protein  42.51 
 
 		 506 aa  378  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.449872 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2580  hypothetical protein  42.51 
 
 		 506 aa  378  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.138083  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2568  hypothetical protein  42.51 
 
 		 506 aa  378  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.801671 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2480  hypothetical protein  42.51 
 
 		 506 aa  378  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.434803  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2688  hypothetical protein  42.51 
 
 		 506 aa  377  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.831014 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1354  hypothetical protein  40.96 
 
 		 492 aa  370  1e-101  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000651661  normal  0.856488 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02223  predicted inner membrane protein  40.96 
 
 		 506 aa  370  1e-101  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000247482  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2448  hypothetical protein  40.96 
 
 		 513 aa  369  1e-101  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000669935  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2454  hypothetical protein  41.16 
 
 		 513 aa  370  1e-101  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000219916  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3438  hypothetical protein  41.37 
 
 		 513 aa  371  1e-101  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000568736  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02183  hypothetical protein  40.96 
 
 		 506 aa  370  1e-101  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000257833  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2592  hypothetical protein  41.16 
 
 		 513 aa  370  1e-101  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000045044  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1358  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  41.16 
 
 		 492 aa  371  1e-101  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000126812  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2674  hypothetical protein  40.56 
 
 		 513 aa  365  1e-99  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000012139  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1853  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  31.94 
 
 		 461 aa  233  8.000000000000001e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.00000000000744962  normal  0.0199441 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1145  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  31.5 
 
 		 464 aa  224  2e-57  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.400945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4645  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  30.24 
 
 		 477 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1974  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  32.4 
 
 		 468 aa  210  4e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2242  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  29.91 
 
 		 478 aa  202  9e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.354885  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4261  C4-dicarboxylate anaerobic carrier-like protein  31.19 
 
 		 460 aa  202  9.999999999999999e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.118271 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2668  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  31.03 
 
 		 460 aa  201  3e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0449  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  29.13 
 
 		 467 aa  197  2.0000000000000003e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.935589  normal  0.0170379 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0766  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  29.46 
 
 		 477 aa  193  5e-48  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.607983  normal  0.276485 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0431  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  30.02 
 
 		 482 aa  193  7e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.73068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01760  hypothetical protein  31.06 
 
 		 500 aa  185  2.0000000000000003e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4846  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  28.36 
 
 		 467 aa  182  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4716  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  28.36 
 
 		 467 aa  181  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.226613  normal  0.397486 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4747  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  28.36 
 
 		 467 aa  181  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4866  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  28.15 
 
 		 467 aa  180  5.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4810  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  28.15 
 
 		 467 aa  180  5.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.334996  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0553  C4-dicarboxylate anaerobic carrier dcuC  25.29 
 
 		 512 aa  179  1e-43  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  7.693670000000001e-19 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1054  C4-dicarboxylate anaerobic carrier family protein  28.54 
 
 		 502 aa  169  7e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.544295  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1143  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  28.43 
 
 		 484 aa  170  7e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.171784  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1927  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  28.37 
 
 		 508 aa  167  5e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.148371  normal  0.0894208 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1242  putatve dicarboxylate transporter  28.03 
 
 		 502 aa  167  5e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0072618  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1836  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  29.12 
 
 		 517 aa  166  9e-40  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1000  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  28.06 
 
 		 497 aa  156  7e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0219424  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2124  hypothetical protein  29.59 
 
 		 517 aa  155  2e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1835  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  28.71 
 
 		 492 aa  155  2e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1568  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  27.98 
 
 		 528 aa  154  4e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.313123  normal  0.0213036 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1254  hypothetical protein  25.96 
 
 		 518 aa  148  2.0000000000000003e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.111433  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2353  hypothetical protein  26.68 
 
 		 521 aa  148  2.0000000000000003e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1229  hypothetical protein  25.96 
 
 		 518 aa  148  2.0000000000000003e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.941876  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3322  putative transporter  25.97 
 
 		 476 aa  147  6e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.871023  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3048  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  25.87 
 
 		 476 aa  146  8.000000000000001e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0103079  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04550  predicted membrane protein  26.04 
 
 		 528 aa  146  9e-34  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1908  putative transporter  25.49 
 
 		 476 aa  145  1e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3342  putative transporter  25.49 
 
 		 476 aa  144  5e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3013  transporter  25.27 
 
 		 476 aa  143  6e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000189205  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3369  transporter  25.49 
 
 		 476 aa  143  7e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3123  transporter  25.49 
 
 		 476 aa  143  7e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000866663  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5568  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  26.56 
 
 		 477 aa  143  8e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.262721  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3342  putative transporter  25.27 
 
 		 476 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00045821  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1891  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  27.7 
 
 		 464 aa  140  4.999999999999999e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00830  predicted membrane protein  26.79 
 
 		 520 aa  140  6e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3328  transporter, putative  25.49 
 
 		 476 aa  139  2e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.162731  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0282  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  28.3 
 
 		 496 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1545  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  25.23 
 
 		 505 aa  130  8.000000000000001e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0184  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  25.98 
 
 		 484 aa  126  7e-28  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0990  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  25.71 
 
 		 512 aa  118  3e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2707  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  23.52 
 
 		 504 aa  116  6.9999999999999995e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0815  hypothetical protein  22.98 
 
 		 462 aa  106  9e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000488544  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1825  C4-dicarboxylate anaerobic carrier family protein  42.48 
 
 		 520 aa  92  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1478  C4-dicarboxylate anaerobic carrier family protein  42.48 
 
 		 470 aa  92  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0398  C4-dicarboxylate anaerobic carrier family protein  42.48 
 
 		 510 aa  92  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2129  C4-dicarboxylate anaerobic carrier family protein  42.48 
 
 		 495 aa  92  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0496  C4-dicarboxylate anaerobic carrier family protein  42.48 
 
 		 504 aa  92  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.774369  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0812  C4-dicarboxylate anaerobic carrier family protein  42.48 
 
 		 492 aa  92  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.371887  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2491  hypothetical protein  25.35 
 
 		 300 aa  86.3  0.000000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0056  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  25.35 
 
 		 300 aa  86.3  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1946  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  30.22 
 
 		 536 aa  84.7  0.000000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.185929  normal  0.387022 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0803  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  23.87 
 
 		 588 aa  77  0.0000000000007  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl015  arginine-ornithine APC transporter  21.72 
 
 		 521 aa  75.9  0.000000000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0091  transporter, putative  21.19 
 
 		 489 aa  65.1  0.000000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1137  short chain fatty acid transporter  26.07 
 
 		 462 aa  47.8  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.534367 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>