55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_3556 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_3487  transposase IS4 family protein  97.66 
 
 		 963 bp  1804    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1660  transposase IS4 family protein  93.97 
 
 		 504 bp  783    Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000446098  normal  0.138544 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3556    100 
 
 		 985 bp  1953    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1624    91.43 
 
 		 948 bp  1320    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0182667  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2179  transposase, IS4 family protein  94.89 
 
 		 918 bp  1515    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.602242  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0629    95.55 
 
 		 873 bp  549  1e-154  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1661  transposase, IS4 family protein  92.46 
 
 		 399 bp  551  1e-154  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000369012  normal  0.132453 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0625  transposase, IS4 family protein  95.55 
 
 		 342 bp  549  1e-154  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.190743 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0597    95.55 
 
 		 687 bp  549  1e-154  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2719    89.51 
 
 		 619 bp  470  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000884127  hitchhiker  0.0000000711999 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0073    93.53 
 
 		 276 bp  341  1.9999999999999998e-91  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.0648349  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4320    95.16 
 
 		 186 bp  297  3e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2245  transposase, IS4 family protein  95.24 
 
 		 150 bp  236  1e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.166496  hitchhiker  0.00350399 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2534  transposase, IS4 family protein  92.26 
 
 		 225 bp  212  1e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0503362 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0624  transposase, IS4 family protein  84.47 
 
 		 273 bp  117  6e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.186967 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0598    90 
 
 		 475 bp  95.6  2e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0567    90 
 
 		 469 bp  95.6  2e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0328218  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4282  IS4 family transposase  90.2 
 
 		 738 bp  61.9  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0104  hypothetical protein  93.02 
 
 		 126 bp  61.9  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2137    90.2 
 
 		 923 bp  61.9  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00245844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2998    90.2 
 
 		 919 bp  61.9  0.0000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2918  transposase, IS4 family protein  83.91 
 
 		 918 bp  61.9  0.0000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4306  IS4 family transposase  90.2 
 
 		 681 bp  61.9  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.482317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1837  transposase, IS4 family protein  88.24 
 
 		 924 bp  54  0.00008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4333  transposase IS4 family protein  88.24 
 
 		 924 bp  54  0.00008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4184  transposase IS4 family protein  88.24 
 
 		 924 bp  54  0.00008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4183    88.24 
 
 		 1679 bp  54  0.00008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3098  IS4 family transposase  88.24 
 
 		 924 bp  54  0.00008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.161431 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0120  ISSod12, transposase  88.24 
 
 		 924 bp  54  0.00008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0125    88.24 
 
 		 268 bp  54  0.00008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4439  transposase, IS4 family protein  88.24 
 
 		 516 bp  54  0.00008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  normal  0.721447 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4648  transposase IS4 family protein  88.24 
 
 		 924 bp  54  0.00008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0900  transposase, IS4 family protein  88.24 
 
 		 924 bp  54  0.00008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1094  transposase, IS4 family protein  88.24 
 
 		 924 bp  54  0.00008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1723  IS4 family transposase  88.24 
 
 		 924 bp  54  0.00008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.060513 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1780  IS4 family transposase  88.24 
 
 		 924 bp  54  0.00008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0631  transposase IS4 family protein  88.24 
 
 		 924 bp  54  0.00008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.301293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2114  IS4 family transposase  88.24 
 
 		 924 bp  54  0.00008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3656  IS4 family transposase  88.24 
 
 		 924 bp  54  0.00008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2717  transposase, IS4 family protein  88.24 
 
 		 924 bp  54  0.00008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0465526  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3033  transposase, IS4 family protein  88.24 
 
 		 924 bp  54  0.00008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3145  transposase, IS4 family protein  88.24 
 
 		 597 bp  54  0.00008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.075025  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3528  transposase, IS4 family protein  88.24 
 
 		 924 bp  54  0.00008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3296  ISSod12, transposase  88.24 
 
 		 924 bp  54  0.00008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1860  IS4 family transposase  88.24 
 
 		 924 bp  54  0.00008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.876835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2010  transposase, IS4 family protein  88.24 
 
 		 789 bp  54  0.00008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.242542  n/a   
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4398  transposase IS4 family protein  88.24 
 
 		 924 bp  54  0.00008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1939    88.24 
 
 		 924 bp  54  0.00008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.7341  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0848  IS4 family transposase  88.24 
 
 		 924 bp  54  0.00008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.133661 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0603  transposase IS4 family protein  88.24 
 
 		 924 bp  54  0.00008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0806  IS4 family transposase  88.24 
 
 		 924 bp  54  0.00008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2611  transposase, IS4 family protein  88.24 
 
 		 924 bp  54  0.00008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0547  copper exporting ATPase  100 
 
 		 2502 bp  48.1  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0343  transposase  84.38 
 
 		 219 bp  48.1  0.005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2887    93.75 
 
 		 153 bp  48.1  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>