21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_0629 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011663  Sbal223_0629    100 
 
 
873 bp  1731    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0625  transposase, IS4 family protein  100 
 
 
342 bp  678    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.190743 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0597    99.85 
 
 
687 bp  1354    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3487  transposase IS4 family protein  87.75 
 
 
963 bp  618  1e-175  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2179  transposase, IS4 family protein  87.62 
 
 
918 bp  613  1e-173  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.602242  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3556    95.55 
 
 
985 bp  549  1e-154  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0624  transposase, IS4 family protein  99.27 
 
 
273 bp  519  1.0000000000000001e-145  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.186967 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1624    94.5 
 
 
948 bp  478  1e-132  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0182667  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1660  transposase IS4 family protein  94.5 
 
 
504 bp  478  1e-132  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000446098  normal  0.138544 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0073    91.98 
 
 
276 bp  319  8e-85  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.0648349  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4320    93.99 
 
 
186 bp  276  1e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2719    91.71 
 
 
619 bp  264  4e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000884127  hitchhiker  0.0000000711999 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2534  transposase, IS4 family protein  91.03 
 
 
225 bp  198  2e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0503362 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2245  transposase, IS4 family protein  90.54 
 
 
150 bp  182  1e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.166496  hitchhiker  0.00350399 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0567    87.01 
 
 
469 bp  73.8  0.00000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0328218  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0598    87.01 
 
 
475 bp  73.8  0.00000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0104  hypothetical protein  97.3 
 
 
126 bp  65.9  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2918  transposase, IS4 family protein  87.1 
 
 
918 bp  60  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2998    85.71 
 
 
919 bp  48.1  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4306  IS4 family transposase  85.71 
 
 
681 bp  48.1  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.482317  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4282  IS4 family transposase  85.71 
 
 
738 bp  48.1  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>