19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_2998 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008573  Shewana3_4282  IS4 family transposase  99.86 
 
 		 738 bp  1449    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4306  IS4 family transposase  99.85 
 
 		 681 bp  1336    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.482317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2998    100 
 
 		 919 bp  1822    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0124    89.37 
 
 		 812 bp  603  1e-170  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4283  transposase  100 
 
 		 171 bp  333  5.0000000000000004e-89  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.901579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1614    84.36 
 
 		 375 bp  149  2e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.893848  normal  0.312056 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3487  transposase IS4 family protein  81.69 
 
 		 963 bp  75.8  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2179  transposase, IS4 family protein  84.38 
 
 		 918 bp  71.9  0.0000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.602242  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2918  transposase, IS4 family protein  89.47 
 
 		 918 bp  65.9  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1944    86.96 
 
 		 917 bp  65.9  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3556    90.2 
 
 		 985 bp  61.9  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2245  transposase, IS4 family protein  87.3 
 
 		 150 bp  61.9  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.166496  hitchhiker  0.00350399 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1624    80.91 
 
 		 948 bp  52  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0182667  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2887    93.94 
 
 		 153 bp  50.1  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2926    90.24 
 
 		 956 bp  50.1  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.937376  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0597    85.71 
 
 		 687 bp  48.1  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0625  transposase, IS4 family protein  85.71 
 
 		 342 bp  48.1  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.190743 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0629    85.71 
 
 		 873 bp  48.1  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0073    85.71 
 
 		 276 bp  48.1  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.0648349  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>