17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_A0073 on replicon NC_004349
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004349  SO_A0073    100 
 
 		 276 bp  547  1e-154  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.0648349  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3487  transposase IS4 family protein  93.97 
 
 		 963 bp  349  3e-94  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3556    93.53 
 
 		 985 bp  341  5.9999999999999996e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2179  transposase, IS4 family protein  92.83 
 
 		 918 bp  335  4e-90  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.602242  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0629    91.98 
 
 		 873 bp  319  2e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0625  transposase, IS4 family protein  91.98 
 
 		 342 bp  319  2e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.190743 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0597    91.98 
 
 		 687 bp  319  2e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1624    91.18 
 
 		 948 bp  262  5.0000000000000005e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0182667  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1660  transposase IS4 family protein  91.18 
 
 		 504 bp  262  5.0000000000000005e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000446098  normal  0.138544 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2719    91.04 
 
 		 619 bp  248  6.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000884127  hitchhiker  0.0000000711999 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2534  transposase, IS4 family protein  90.38 
 
 		 225 bp  190  1e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0503362 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4320    92.31 
 
 		 186 bp  178  5e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2245  transposase, IS4 family protein  89.86 
 
 		 150 bp  174  7.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.166496  hitchhiker  0.00350399 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0104  hypothetical protein  93.02 
 
 		 126 bp  61.9  0.00000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2998    85.71 
 
 		 919 bp  48.1  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4306  IS4 family transposase  85.71 
 
 		 681 bp  48.1  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.482317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4282  IS4 family transposase  85.71 
 
 		 738 bp  48.1  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>