23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_1624 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009665  Shew185_3556    91.43 
 
 		 985 bp  1320    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3487  transposase IS4 family protein  93.63 
 
 		 963 bp  1425    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2719    95.12 
 
 		 619 bp  652    Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000884127  hitchhiker  0.0000000711999 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1661  transposase, IS4 family protein  100 
 
 		 399 bp  791    Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000369012  normal  0.132453 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1660  transposase IS4 family protein  100 
 
 		 504 bp  999    Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000446098  normal  0.138544 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1624    100 
 
 		 948 bp  1879    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0182667  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2179  transposase, IS4 family protein  94.04 
 
 		 918 bp  1342    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.602242  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0597    94.5 
 
 		 687 bp  478  1e-132  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0625  transposase, IS4 family protein  94.5 
 
 		 342 bp  478  1e-132  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.190743 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0629    94.5 
 
 		 873 bp  478  1e-132  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0073    91.18 
 
 		 276 bp  262  2e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.0648349  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4320    92.47 
 
 		 186 bp  258  3e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2245  transposase, IS4 family protein  91.6 
 
 		 150 bp  157  7e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.166496  hitchhiker  0.00350399 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2534  transposase, IS4 family protein  89.76 
 
 		 225 bp  149  2e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0503362 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0567    86.32 
 
 		 469 bp  105  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0328218  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0598    86.32 
 
 		 475 bp  105  2e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0624  transposase, IS4 family protein  86.27 
 
 		 273 bp  83.8  0.00000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.186967 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1415    83.7 
 
 		 920 bp  63.9  0.00000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00216347 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4282  IS4 family transposase  80.91 
 
 		 738 bp  52  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4306  IS4 family transposase  80.91 
 
 		 681 bp  52  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.482317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2998    80.91 
 
 		 919 bp  52  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0547  copper exporting ATPase  100 
 
 		 2502 bp  48.1  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2918  transposase, IS4 family protein  85.71 
 
 		 918 bp  48.1  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>