83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_2137 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009665  Shew185_0583    90.74 
 
 
834 bp  1037    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1837  transposase, IS4 family protein  96.32 
 
 
924 bp  1554    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1939    95.45 
 
 
924 bp  1491    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.7341  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2010  transposase, IS4 family protein  96.53 
 
 
789 bp  1310    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.242542  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2611  transposase, IS4 family protein  96.43 
 
 
924 bp  1562    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2717  transposase, IS4 family protein  96.54 
 
 
924 bp  1570    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0465526  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3033  transposase, IS4 family protein  96.54 
 
 
924 bp  1570    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3145  transposase, IS4 family protein  96.58 
 
 
597 bp  944    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.075025  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3528  transposase, IS4 family protein  96.43 
 
 
924 bp  1562    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4398  transposase IS4 family protein  96.75 
 
 
924 bp  1586    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3854  ISSod12, transposase  87.5 
 
 
924 bp  888    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0603  transposase IS4 family protein  96.54 
 
 
924 bp  1570    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0631  transposase IS4 family protein  96.32 
 
 
924 bp  1554    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.301293  normal 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4648  transposase IS4 family protein  96.75 
 
 
924 bp  1586    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0614    90.66 
 
 
857 bp  1055    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2137    100 
 
 
923 bp  1830    Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00245844  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4183    96.75 
 
 
1679 bp  1586    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4184  transposase IS4 family protein  96.75 
 
 
924 bp  1586    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4333  transposase IS4 family protein  96.75 
 
 
924 bp  1586    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0900  transposase, IS4 family protein  96.43 
 
 
924 bp  1562    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3296  ISSod12, transposase  95.67 
 
 
924 bp  1507    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0120  ISSod12, transposase  95.67 
 
 
924 bp  1507    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1723  IS4 family transposase  95.35 
 
 
924 bp  1483    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.060513 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1780  IS4 family transposase  95.24 
 
 
924 bp  1475    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2114  IS4 family transposase  95.67 
 
 
924 bp  1507    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3656  IS4 family transposase  95.67 
 
 
924 bp  1507    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0806  IS4 family transposase  95.67 
 
 
924 bp  1507    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0848  IS4 family transposase  95.78 
 
 
924 bp  1515    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.133661 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1860  IS4 family transposase  95.78 
 
 
924 bp  1515    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.876835  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1094  transposase, IS4 family protein  96.32 
 
 
924 bp  1554    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4445  transposase, IS4 family protein  96.66 
 
 
432 bp  720    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3098  IS4 family transposase  95.78 
 
 
924 bp  1515    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.161431 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4439  transposase, IS4 family protein  96.69 
 
 
516 bp  874    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  normal  0.721447 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3139  transposase, IS4 family protein  96.51 
 
 
387 bp  636  1e-180  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0610  transposase, IS4 family protein  94.5 
 
 
336 bp  498  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.191795 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2027    85.38 
 
 
505 bp  367  4e-99  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.1194  normal  0.287327 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1621    82.44 
 
 
748 bp  351  2e-94  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.187393  normal  0.334056 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1949    82.87 
 
 
609 bp  337  3e-90  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00276274  normal  0.181958 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2178    89.23 
 
 
323 bp  333  5.0000000000000004e-89  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0241092  hitchhiker  0.00521689 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0125    87.45 
 
 
268 bp  244  4e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2007    96.74 
 
 
111 bp  159  2e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0239127  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0611  transposase, IS4 family protein  92.17 
 
 
138 bp  157  7e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.337264 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0135    79.6 
 
 
707 bp  139  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01663  hypothetical protein  88.64 
 
 
921 bp  95.6  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05652  hypothetical protein  88.64 
 
 
132 bp  95.6  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02447  hypothetical protein  88.64 
 
 
921 bp  95.6  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06899  hypothetical protein  88.64 
 
 
921 bp  95.6  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04803  hypothetical protein  88.64 
 
 
921 bp  95.6  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01517  transposase  87.21 
 
 
921 bp  83.8  0.00000000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06002  hypothetical protein  85.71 
 
 
921 bp  77.8  0.000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05989  hypothetical protein  85.71 
 
 
909 bp  77.8  0.000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05975  hypothetical protein  85.71 
 
 
903 bp  77.8  0.000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0343  transposase  86.75 
 
 
219 bp  77.8  0.000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06678  hypothetical protein  86.05 
 
 
921 bp  75.8  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06380  hypothetical protein  86.05 
 
 
921 bp  75.8  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06818  hypothetical protein  86.05 
 
 
921 bp  75.8  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3475  transposase IS4 family protein  86.05 
 
 
921 bp  75.8  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00252922 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1722  transposase IS4 family protein  86.05 
 
 
921 bp  75.8  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.287576  normal  0.252342 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01672  hypothetical protein  86.05 
 
 
921 bp  75.8  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05983  hypothetical protein  86.05 
 
 
303 bp  75.8  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01493  hypothetical protein  89.39 
 
 
123 bp  75.8  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05850  hypothetical protein  86.05 
 
 
921 bp  75.8  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03012  hypothetical protein  86.05 
 
 
921 bp  75.8  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03002  hypothetical protein  86.05 
 
 
870 bp  75.8  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02877  hypothetical protein  86.05 
 
 
921 bp  75.8  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02158  hypothetical protein  86.05 
 
 
849 bp  75.8  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02152  hypothetical protein  86.05 
 
 
921 bp  75.8  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3487  transposase IS4 family protein  90.2 
 
 
963 bp  61.9  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3556    90.2 
 
 
985 bp  61.9  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01492  hypothetical protein  100 
 
 
114 bp  60  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00550  hypothetical protein  86.89 
 
 
399 bp  58  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05901  hypothetical protein  86.89 
 
 
399 bp  58  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2179  transposase, IS4 family protein  89.36 
 
 
918 bp  54  0.00007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.602242  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05997  hypothetical protein  92.31 
 
 
531 bp  54  0.00007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05985  hypothetical protein  92.31 
 
 
531 bp  54  0.00007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05981  hypothetical protein  92.31 
 
 
663 bp  54  0.00007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01501  hypothetical protein  94.29 
 
 
315 bp  54  0.00007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07125  hypothetical protein  83.78 
 
 
921 bp  52  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06919  hypothetical protein  100 
 
 
381 bp  52  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05900  hypothetical protein  87.04 
 
 
171 bp  52  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04740  hypothetical protein  83.78 
 
 
921 bp  52  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00549  hypothetical protein  87.04 
 
 
171 bp  52  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2926    88.33 
 
 
956 bp  48.1  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.937376  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>