71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_A0125 on replicon NC_004349
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004349  SO_A0125    100 
 
 		 268 bp  531  1e-149  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3854  ISSod12, transposase  92.75 
 
 		 924 bp  361  6e-98  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4333  transposase IS4 family protein  89.02 
 
 		 924 bp  276  3e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4184  transposase IS4 family protein  89.02 
 
 		 924 bp  276  3e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4183    89.02 
 
 		 1679 bp  276  3e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4648  transposase IS4 family protein  89.02 
 
 		 924 bp  276  3e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4398  transposase IS4 family protein  89.02 
 
 		 924 bp  276  3e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2010  transposase, IS4 family protein  88.63 
 
 		 789 bp  268  7e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.242542  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1094  transposase, IS4 family protein  88.24 
 
 		 924 bp  260  2e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3528  transposase, IS4 family protein  88.24 
 
 		 924 bp  260  2e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3145  transposase, IS4 family protein  88.24 
 
 		 597 bp  260  2e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.075025  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3033  transposase, IS4 family protein  88.24 
 
 		 924 bp  260  2e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2717  transposase, IS4 family protein  88.24 
 
 		 924 bp  260  2e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0465526  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2611  transposase, IS4 family protein  88.24 
 
 		 924 bp  260  2e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0603  transposase IS4 family protein  88.24 
 
 		 924 bp  260  2e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1837  transposase, IS4 family protein  88.24 
 
 		 924 bp  260  2e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0900  transposase, IS4 family protein  88.24 
 
 		 924 bp  260  2e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0631  transposase IS4 family protein  88.24 
 
 		 924 bp  260  2e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.301293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1723  IS4 family transposase  88.24 
 
 		 924 bp  260  2e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.060513 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0848  IS4 family transposase  88.24 
 
 		 924 bp  260  2e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.133661 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0806  IS4 family transposase  88.24 
 
 		 924 bp  260  2e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3296  ISSod12, transposase  87.84 
 
 		 924 bp  252  4e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1780  IS4 family transposase  87.84 
 
 		 924 bp  252  4e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2114  IS4 family transposase  87.84 
 
 		 924 bp  252  4e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0120  ISSod12, transposase  87.84 
 
 		 924 bp  252  4e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3656  IS4 family transposase  87.84 
 
 		 924 bp  252  4e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1860  IS4 family transposase  87.84 
 
 		 924 bp  252  4e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.876835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3098  IS4 family transposase  87.84 
 
 		 924 bp  252  4e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.161431 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4439  transposase, IS4 family protein  87.84 
 
 		 516 bp  252  4e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  normal  0.721447 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1939    87.45 
 
 		 924 bp  244  1e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.7341  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2137    87.45 
 
 		 923 bp  244  1e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00245844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0135    87.39 
 
 		 707 bp  117  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1621    82.13 
 
 		 748 bp  115  6e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.187393  normal  0.334056 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0614    81.47 
 
 		 857 bp  111  1e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0583    81.5 
 
 		 834 bp  109  4e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05652  hypothetical protein  91.25 
 
 		 132 bp  103  2e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04803  hypothetical protein  91.25 
 
 		 921 bp  103  2e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06899  hypothetical protein  91.25 
 
 		 921 bp  103  2e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02447  hypothetical protein  91.25 
 
 		 921 bp  103  2e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01663  hypothetical protein  91.25 
 
 		 921 bp  103  2e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2178    94.03 
 
 		 323 bp  101  1e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0241092  hitchhiker  0.00521689 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01517  transposase  90.24 
 
 		 921 bp  99.6  4e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05975  hypothetical protein  89.02 
 
 		 903 bp  91.7  9e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06002  hypothetical protein  89.02 
 
 		 921 bp  91.7  9e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06380  hypothetical protein  89.02 
 
 		 921 bp  91.7  9e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05989  hypothetical protein  89.02 
 
 		 909 bp  91.7  9e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06678  hypothetical protein  89.02 
 
 		 921 bp  91.7  9e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06818  hypothetical protein  89.02 
 
 		 921 bp  91.7  9e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1722  transposase IS4 family protein  89.02 
 
 		 921 bp  91.7  9e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.287576  normal  0.252342 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3475  transposase IS4 family protein  89.02 
 
 		 921 bp  91.7  9e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00252922 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05983  hypothetical protein  89.02 
 
 		 303 bp  91.7  9e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05850  hypothetical protein  89.02 
 
 		 921 bp  91.7  9e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03012  hypothetical protein  89.02 
 
 		 921 bp  91.7  9e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03002  hypothetical protein  89.02 
 
 		 870 bp  91.7  9e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02877  hypothetical protein  89.02 
 
 		 921 bp  91.7  9e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02158  hypothetical protein  89.02 
 
 		 849 bp  91.7  9e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02152  hypothetical protein  89.02 
 
 		 921 bp  91.7  9e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01672  hypothetical protein  89.02 
 
 		 921 bp  91.7  9e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0343  transposase  87.5 
 
 		 219 bp  79.8  0.0000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0611  transposase, IS4 family protein  84.38 
 
 		 138 bp  71.9  0.00000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.337264 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04740  hypothetical protein  85.37 
 
 		 921 bp  67.9  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07125  hypothetical protein  85.37 
 
 		 921 bp  67.9  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01492  hypothetical protein  100 
 
 		 114 bp  60  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06919  hypothetical protein  94.44 
 
 		 381 bp  56  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2926    96.77 
 
 		 956 bp  54  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.937376  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3487  transposase IS4 family protein  88.24 
 
 		 963 bp  54  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3556    88.24 
 
 		 985 bp  54  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00549  hypothetical protein  87.23 
 
 		 171 bp  46.1  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2179  transposase, IS4 family protein  87.23 
 
 		 918 bp  46.1  0.005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.602242  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05900  hypothetical protein  87.23 
 
 		 171 bp  46.1  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1415    93.55 
 
 		 920 bp  46.1  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00216347 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>