40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_3200 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009665  Shew185_3200    100 
 
 
1051 bp  2083    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1167    99.05 
 
 
1051 bp  1990    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0868  hypothetical protein  84.44 
 
 
1035 bp  620  1e-175  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1945  protein of unknown function DUF1568  85.15 
 
 
1026 bp  521  1.0000000000000001e-145  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.499337 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3200  hypothetical protein  91.15 
 
 
1035 bp  521  1.0000000000000001e-145  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.789239 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2414  hypothetical protein  84.99 
 
 
1026 bp  513  1e-143  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.301389  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1226  protein of unknown function DUF1568  84.99 
 
 
1026 bp  513  1e-143  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.353731  hitchhiker  0.000000017845 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2403  hypothetical protein  84.52 
 
 
1026 bp  490  1e-136  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.284659  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4264    89.43 
 
 
1034 bp  458  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4182    89.43 
 
 
863 bp  458  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4403    89.43 
 
 
803 bp  458  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1178  hypothetical protein  88.94 
 
 
1035 bp  450  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0303591  normal  0.0825627 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1697  hypothetical protein  88.56 
 
 
1050 bp  442  9.999999999999999e-123  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1126  hypothetical protein  88.7 
 
 
1035 bp  442  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.776641  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2480  hypothetical protein  88.41 
 
 
1035 bp  440  1e-121  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0910  hypothetical protein  88.44 
 
 
1035 bp  424  1e-116  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1413    85.18 
 
 
639 bp  291  2e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2840  protein of unknown function DUF1568  80.53 
 
 
1038 bp  291  2e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0644633 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1514    78.23 
 
 
1062 bp  190  6e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1505    77.58 
 
 
1062 bp  167  8.000000000000001e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1946    93.27 
 
 
105 bp  151  5e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.563589 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1542  hypothetical protein  79.02 
 
 
420 bp  149  2e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1541  hypothetical protein  84.08 
 
 
630 bp  145  3e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2933  hypothetical protein  83.25 
 
 
1038 bp  133  1.0000000000000001e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.161086  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1506    85.83 
 
 
192 bp  103  1e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3659  hypothetical protein  81.68 
 
 
1044 bp  101  4e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4450    85.86 
 
 
99 bp  85.7  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3299  hypothetical protein  80.53 
 
 
642 bp  83.8  0.00000000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2906  hypothetical protein  89.83 
 
 
990 bp  69.9  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.881072 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4402  hypothetical protein  87.14 
 
 
78 bp  67.9  0.000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1861  hypothetical protein  96.67 
 
 
991 bp  52  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.633128  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2622  hypothetical protein  100 
 
 
960 bp  52  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0144606  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0856  hypothetical protein  85.48 
 
 
1044 bp  52  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2402  hypothetical protein  100 
 
 
978 bp  52  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.283143  normal  0.277541 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1511  hypothetical protein  100 
 
 
978 bp  52  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1777    96.55 
 
 
1042 bp  50.1  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2299  hypothetical protein  96.55 
 
 
978 bp  50.1  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.187044  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0200  hypothetical protein  90.24 
 
 
882 bp  50.1  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2555  hypothetical protein  100 
 
 
978 bp  48.1  0.005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00750734  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3087  hypothetical protein  93.75 
 
 
978 bp  48.1  0.005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>