25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_1506 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009665  Shew185_1506    100 
 
 
192 bp  381  1e-104  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2840  protein of unknown function DUF1568  100 
 
 
1038 bp  238  4e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0644633 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1542  hypothetical protein  100 
 
 
420 bp  238  4e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1505    99.17 
 
 
1062 bp  230  1e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1514    99.17 
 
 
1062 bp  230  1e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1413    98.33 
 
 
639 bp  222  3e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1697  hypothetical protein  94.17 
 
 
1050 bp  182  2e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1178  hypothetical protein  90.76 
 
 
1035 bp  149  3e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0303591  normal  0.0825627 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1126  hypothetical protein  90.76 
 
 
1035 bp  149  3e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.776641  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1945  protein of unknown function DUF1568  90 
 
 
1026 bp  143  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.499337 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2414  hypothetical protein  89.17 
 
 
1026 bp  135  5e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.301389  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2480  hypothetical protein  91.09 
 
 
1035 bp  129  3e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0910  hypothetical protein  90.1 
 
 
1035 bp  121  7e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4182    89.11 
 
 
863 bp  113  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4403    89.11 
 
 
803 bp  113  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4264    89.11 
 
 
1034 bp  113  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3200    85.83 
 
 
1051 bp  103  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1946    87.5 
 
 
105 bp  103  2e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.563589 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3200  hypothetical protein  87.13 
 
 
1035 bp  97.6  1e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.789239 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2403  hypothetical protein  85 
 
 
1026 bp  95.6  4e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.284659  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1167    85.12 
 
 
1051 bp  89.7  3e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1226  protein of unknown function DUF1568  88.89 
 
 
1026 bp  89.7  3e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.353731  hitchhiker  0.000000017845 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0868  hypothetical protein  85.05 
 
 
1035 bp  85.7  0.000000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3659  hypothetical protein  89.71 
 
 
1044 bp  79.8  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2906  hypothetical protein  88 
 
 
990 bp  52  0.00006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.881072 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>