34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_4264 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_2480  hypothetical protein  90.63 
 
 
1035 bp  1275    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4182    95.42 
 
 
863 bp  1308    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1126  hypothetical protein  93.24 
 
 
1035 bp  1489    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.776641  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1178  hypothetical protein  93.33 
 
 
1035 bp  1497    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0303591  normal  0.0825627 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3200  hypothetical protein  92.75 
 
 
1035 bp  1449    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.789239 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4403    100 
 
 
803 bp  1592    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4264    100 
 
 
1034 bp  2050    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0910  hypothetical protein  92.66 
 
 
1035 bp  1441    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1697  hypothetical protein  87.84 
 
 
1050 bp  620  1e-175  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1945  protein of unknown function DUF1568  87.16 
 
 
1026 bp  593  1e-167  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.499337 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2414  hypothetical protein  87 
 
 
1026 bp  585  1e-164  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.301389  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1226  protein of unknown function DUF1568  86.52 
 
 
1026 bp  561  1e-157  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.353731  hitchhiker  0.000000017845 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2403  hypothetical protein  86.04 
 
 
1026 bp  537  1e-150  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.284659  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2840  protein of unknown function DUF1568  85.25 
 
 
1038 bp  494  1e-137  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0644633 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3200    89.43 
 
 
1051 bp  458  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0868  hypothetical protein  84.44 
 
 
1035 bp  454  1e-125  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1167    88.94 
 
 
1051 bp  442  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1413    80.54 
 
 
639 bp  283  5e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1542  hypothetical protein  83.93 
 
 
420 bp  278  3e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1514    83.67 
 
 
1062 bp  270  7e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1505    83.42 
 
 
1062 bp  262  2e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4402  hypothetical protein  100 
 
 
78 bp  155  3e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1541  hypothetical protein  82.79 
 
 
630 bp  133  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4450    91.92 
 
 
99 bp  133  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1946    90.1 
 
 
105 bp  121  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.563589 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2933  hypothetical protein  83.61 
 
 
1038 bp  117  7.000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.161086  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1506    89.11 
 
 
192 bp  113  1e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3659  hypothetical protein  77.45 
 
 
1044 bp  105  3e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2906  hypothetical protein  80.41 
 
 
990 bp  83.8  0.00000000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.881072 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3299  hypothetical protein  83.65 
 
 
642 bp  71.9  0.0000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0856  hypothetical protein  80.7 
 
 
1044 bp  69.9  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1735  hypothetical protein  92.68 
 
 
984 bp  58  0.000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1111  hypothetical protein  90.48 
 
 
984 bp  52  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0480419  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0606  hypothetical protein  96.55 
 
 
978 bp  50.1  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>