29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_1505 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009052  Sbal_1514    98.78 
 
 
1062 bp  2002    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2840  protein of unknown function DUF1568  89.62 
 
 
1038 bp  757    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0644633 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1505    100 
 
 
1062 bp  2105    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1542  hypothetical protein  99.29 
 
 
420 bp  809    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1541  hypothetical protein  98.09 
 
 
630 bp  1150    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1697  hypothetical protein  84.91 
 
 
1050 bp  519  1.0000000000000001e-145  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1178  hypothetical protein  83.23 
 
 
1035 bp  432  1e-119  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0303591  normal  0.0825627 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1126  hypothetical protein  83.07 
 
 
1035 bp  424  1e-116  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.776641  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3200  hypothetical protein  81.49 
 
 
1035 bp  345  2e-92  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.789239 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1413    96.45 
 
 
639 bp  335  2e-89  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0910  hypothetical protein  80.7 
 
 
1035 bp  305  1e-80  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2480  hypothetical protein  83.73 
 
 
1035 bp  264  5.0000000000000005e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4403    83.42 
 
 
803 bp  262  2e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4264    83.42 
 
 
1034 bp  262  2e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4182    83.16 
 
 
863 bp  254  5e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0868  hypothetical protein  83.9 
 
 
1035 bp  250  6.999999999999999e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2414  hypothetical protein  83.33 
 
 
1026 bp  234  4e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.301389  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1506    99.17 
 
 
192 bp  230  7e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1945  protein of unknown function DUF1568  83.05 
 
 
1026 bp  226  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.499337 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2403  hypothetical protein  88.11 
 
 
1026 bp  192  1e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.284659  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1226  protein of unknown function DUF1568  88.11 
 
 
1026 bp  192  1e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.353731  hitchhiker  0.000000017845 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3200    77.58 
 
 
1051 bp  167  8.000000000000001e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3659  hypothetical protein  85.34 
 
 
1044 bp  157  8e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1167    78.95 
 
 
1051 bp  157  8e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0856  hypothetical protein  83.23 
 
 
1044 bp  109  2e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2906  hypothetical protein  82.84 
 
 
990 bp  105  3e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.881072 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1946    86.54 
 
 
105 bp  95.6  2e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.563589 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3299  hypothetical protein  81.71 
 
 
642 bp  93.7  1e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2933  hypothetical protein  78.81 
 
 
1038 bp  71.9  0.0000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.161086  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>