32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_1413 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_1413    100 
 
 		 639 bp  1267    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1697  hypothetical protein  86.34 
 
 		 1050 bp  379  1e-103  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1178  hypothetical protein  82.2 
 
 		 1035 bp  367  3e-99  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0303591  normal  0.0825627 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1126  hypothetical protein  82.03 
 
 		 1035 bp  359  5.999999999999999e-97  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.776641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2840  protein of unknown function DUF1568  96.95 
 
 		 1038 bp  343  4e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0644633 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1542  hypothetical protein  96.95 
 
 		 420 bp  343  4e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1505    96.45 
 
 		 1062 bp  335  9e-90  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1514    96.45 
 
 		 1062 bp  335  9e-90  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4182    80.78 
 
 		 863 bp  293  3e-77  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3200    85.18 
 
 		 1051 bp  291  1e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4403    80.54 
 
 		 803 bp  283  3e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4264    80.54 
 
 		 1034 bp  283  3e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1167    84.95 
 
 		 1051 bp  278  2.0000000000000002e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3200  hypothetical protein  84.62 
 
 		 1035 bp  268  2e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.789239 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0910  hypothetical protein  83.58 
 
 		 1035 bp  238  2.0000000000000002e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2480  hypothetical protein  83.14 
 
 		 1035 bp  228  2e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2414  hypothetical protein  79.09 
 
 		 1026 bp  222  1e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.301389  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1506    98.33 
 
 		 192 bp  222  1e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1226  protein of unknown function DUF1568  78.8 
 
 		 1026 bp  200  3e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.353731  hitchhiker  0.000000017845 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2403  hypothetical protein  78.58 
 
 		 1026 bp  198  1e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.284659  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1945  protein of unknown function DUF1568  87.31 
 
 		 1026 bp  192  8e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.499337 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0868  hypothetical protein  80.49 
 
 		 1035 bp  180  3e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1541  hypothetical protein  92.19 
 
 		 630 bp  174  2e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3659  hypothetical protein  85.16 
 
 		 1044 bp  125  1.9999999999999998e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1946    87.5 
 
 		 105 bp  103  6e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.563589 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2933  hypothetical protein  80.71 
 
 		 1038 bp  89.7  9e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.161086  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3299  hypothetical protein  82.14 
 
 		 642 bp  79.8  0.0000000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2906  hypothetical protein  81.9 
 
 		 990 bp  63.9  0.00000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.881072 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0856  hypothetical protein  82.24 
 
 		 1044 bp  61.9  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1777    92.11 
 
 		 1042 bp  52  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2414  hypothetical protein  96.55 
 
 		 981 bp  50.1  0.0008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.196776  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2533  hypothetical protein  96.55 
 
 		 981 bp  50.1  0.0008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0991372  normal  0.0595118 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>