29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_1514 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009052  Sbal_1514    100 
 
 
1062 bp  2105    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2840  protein of unknown function DUF1568  89.78 
 
 
1038 bp  765    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0644633 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1505    98.78 
 
 
1062 bp  2002    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1542  hypothetical protein  99.52 
 
 
420 bp  817    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1541  hypothetical protein  98.41 
 
 
630 bp  1166    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1697  hypothetical protein  85.06 
 
 
1050 bp  527  1e-147  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1178  hypothetical protein  83.39 
 
 
1035 bp  440  1e-121  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0303591  normal  0.0825627 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1126  hypothetical protein  83.23 
 
 
1035 bp  432  1e-119  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.776641  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3200  hypothetical protein  81.65 
 
 
1035 bp  353  7e-95  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.789239 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1413    96.45 
 
 
639 bp  335  2e-89  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0910  hypothetical protein  80.85 
 
 
1035 bp  313  5.9999999999999995e-83  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2480  hypothetical protein  83.99 
 
 
1035 bp  272  2e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4403    83.67 
 
 
803 bp  270  8e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4264    83.67 
 
 
1034 bp  270  8e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4182    83.42 
 
 
863 bp  262  2e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0868  hypothetical protein  84.18 
 
 
1035 bp  258  3e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2414  hypothetical protein  83.62 
 
 
1026 bp  242  2e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.301389  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1945  protein of unknown function DUF1568  83.33 
 
 
1026 bp  234  4e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.499337 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1506    99.17 
 
 
192 bp  230  7e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2403  hypothetical protein  89.19 
 
 
1026 bp  208  2e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.284659  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1226  protein of unknown function DUF1568  89.19 
 
 
1026 bp  208  2e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.353731  hitchhiker  0.000000017845 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3200    78.23 
 
 
1051 bp  190  6e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1167    79.63 
 
 
1051 bp  180  5e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3659  hypothetical protein  81.06 
 
 
1044 bp  172  1e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0856  hypothetical protein  84.43 
 
 
1044 bp  125  3e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3299  hypothetical protein  81.82 
 
 
642 bp  95.6  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1946    86.54 
 
 
105 bp  95.6  2e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.563589 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2906  hypothetical protein  81.66 
 
 
990 bp  89.7  0.000000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.881072 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2933  hypothetical protein  81.33 
 
 
1038 bp  83.8  0.00000000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.161086  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>