31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_1167 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011663  Sbal223_1167    100 
 
 
1051 bp  2083    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3200    99.05 
 
 
1051 bp  1990    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0868  hypothetical protein  84.28 
 
 
1035 bp  591  1e-166  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3200  hypothetical protein  90.66 
 
 
1035 bp  505  1e-141  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.789239 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1945  protein of unknown function DUF1568  84.7 
 
 
1026 bp  492  1e-136  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.499337 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1226  protein of unknown function DUF1568  84.54 
 
 
1026 bp  484  1e-134  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.353731  hitchhiker  0.000000017845 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2414  hypothetical protein  84.54 
 
 
1026 bp  484  1e-134  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.301389  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2403  hypothetical protein  84.38 
 
 
1026 bp  476  1e-132  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.284659  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1697  hypothetical protein  88.56 
 
 
1050 bp  442  9.999999999999999e-123  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4182    88.94 
 
 
863 bp  442  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4403    88.94 
 
 
803 bp  442  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4264    88.94 
 
 
1034 bp  442  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2480  hypothetical protein  88.41 
 
 
1035 bp  440  1e-121  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1178  hypothetical protein  88.45 
 
 
1035 bp  434  1e-119  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0303591  normal  0.0825627 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1126  hypothetical protein  88.21 
 
 
1035 bp  426  1e-117  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.776641  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0910  hypothetical protein  87.94 
 
 
1035 bp  408  1e-111  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1413    84.95 
 
 
639 bp  278  3e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2840  protein of unknown function DUF1568  80.41 
 
 
1038 bp  278  3e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0644633 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1514    79.63 
 
 
1062 bp  180  5e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1505    78.95 
 
 
1062 bp  157  8e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1946    92.38 
 
 
105 bp  137  6.999999999999999e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.563589 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1542  hypothetical protein  78.84 
 
 
420 bp  135  3e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1541  hypothetical protein  83.58 
 
 
630 bp  129  2e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2933  hypothetical protein  82.27 
 
 
1038 bp  117  7.000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.161086  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3659  hypothetical protein  81.68 
 
 
1044 bp  101  4e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1506    85.12 
 
 
192 bp  89.7  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3299  hypothetical protein  80.53 
 
 
642 bp  83.8  0.00000000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4450    84.85 
 
 
99 bp  77.8  0.000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4402  hypothetical protein  85.71 
 
 
78 bp  60  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2906  hypothetical protein  88.33 
 
 
990 bp  56  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.881072 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0856  hypothetical protein  91.67 
 
 
1044 bp  48.1  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>