25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_1946 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011663  Sbal223_1946    100 
 
 
105 bp  208  2e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.563589 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2414  hypothetical protein  99.04 
 
 
1026 bp  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.301389  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1945  protein of unknown function DUF1568  98.08 
 
 
1026 bp  190  5e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.499337 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0868  hypothetical protein  95.19 
 
 
1035 bp  167  6.9999999999999995e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1126  hypothetical protein  93.27 
 
 
1035 bp  151  4e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.776641  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1178  hypothetical protein  93.27 
 
 
1035 bp  151  4e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0303591  normal  0.0825627 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3200    93.27 
 
 
1051 bp  151  4e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1167    92.38 
 
 
1051 bp  137  6.0000000000000005e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2480  hypothetical protein  92.08 
 
 
1035 bp  137  6.0000000000000005e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0910  hypothetical protein  92.08 
 
 
1035 bp  137  6.0000000000000005e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2403  hypothetical protein  90.38 
 
 
1026 bp  127  6e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.284659  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4403    90.1 
 
 
803 bp  121  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4264    90.1 
 
 
1034 bp  121  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4182    90.1 
 
 
863 bp  121  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3200  hypothetical protein  91.01 
 
 
1035 bp  113  9e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.789239 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1226  protein of unknown function DUF1568  88.46 
 
 
1026 bp  111  3e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.353731  hitchhiker  0.000000017845 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2840  protein of unknown function DUF1568  87.5 
 
 
1038 bp  103  8e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0644633 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1506    87.5 
 
 
192 bp  103  8e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1542  hypothetical protein  87.5 
 
 
420 bp  103  8e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1413    87.5 
 
 
639 bp  103  8e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1505    86.54 
 
 
1062 bp  95.6  2e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1514    86.54 
 
 
1062 bp  95.6  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1697  hypothetical protein  86.54 
 
 
1050 bp  95.6  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2906  hypothetical protein  88.33 
 
 
990 bp  63.9  0.000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.881072 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3659  hypothetical protein  90.91 
 
 
1044 bp  56  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>