More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_13270 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_13270  phosphotransferase system HPr (HPr) family protein  100 
 
 
88 aa  177  4e-44  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1350  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase  40.23 
 
 
835 aa  74.3  0.0000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0318787 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1288  HPrNtr  37.93 
 
 
88 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.12196  hitchhiker  0.00000200864 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0638  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  43.37 
 
 
86 aa  72  0.000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.866098  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0876  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  42.22 
 
 
90 aa  68.2  0.00000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.45631  normal  0.298141 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0130  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  35.63 
 
 
89 aa  67.8  0.00000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0517698 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2161  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  36.78 
 
 
88 aa  67.4  0.00000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2967  phosphocarrier protein Chr  39.02 
 
 
85 aa  67  0.00000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000334349  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2036  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  38.27 
 
 
86 aa  66.2  0.0000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.67189  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1882  phosphocarrier protein HPr  35.63 
 
 
88 aa  65.5  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.38742  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0150  phosphocarrier, HPr family  40.96 
 
 
86 aa  65.9  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.20789  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1757  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  40.74 
 
 
88 aa  65.9  0.0000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0245  hypothetical protein  40.54 
 
 
89 aa  65.1  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.519653  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0203  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  37.84 
 
 
89 aa  64.7  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.405136  normal  0.268008 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3551  bifunctional PTS system fructose-specific transporter subunit IIA/HPr protein  35.96 
 
 
373 aa  64.7  0.0000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0296  phosphoryl transfer system, HPr  39.19 
 
 
89 aa  63.5  0.0000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0331  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  39.73 
 
 
87 aa  63.5  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01690  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  40.48 
 
 
93 aa  63.5  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14490  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  31.76 
 
 
88 aa  63.2  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00608366  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0222  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  36.49 
 
 
89 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000064621 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3385  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  33.33 
 
 
88 aa  63.2  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0224  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  34.48 
 
 
89 aa  63.2  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1190  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  34.94 
 
 
88 aa  63.5  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0347  phosphohistidinoprotein-hexose phosphotransferase  36.49 
 
 
89 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.648241 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0117  HPrNtr domain-containing protein  34.48 
 
 
90 aa  62  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.668749  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3144  phosphocarrier protein Chr  38.55 
 
 
85 aa  62.4  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0444  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  38.1 
 
 
99 aa  62.8  0.000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05958  bifunctional PTS system fructose-specific transporter subunit IIA/HPr protein  38.27 
 
 
377 aa  61.6  0.000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2413  HPrNtr  35.63 
 
 
89 aa  62  0.000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.981961  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2966  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  33.33 
 
 
88 aa  61.6  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.351605  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1930  phosphocarrier protein HPr  36.36 
 
 
95 aa  62  0.000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000294443  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1549  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  46.27 
 
 
86 aa  61.6  0.000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000108973  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3549  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  34.94 
 
 
100 aa  61.2  0.000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0189328  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1641  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  37.5 
 
 
88 aa  61.6  0.000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00381683  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2138  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  37.97 
 
 
87 aa  61.2  0.000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.580759  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4005  phosphotransferase system HPr enzyme  35.63 
 
 
89 aa  61.2  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4060  PTS system HPr enzyme  35.63 
 
 
89 aa  61.2  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.672483  normal  0.754895 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1091  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  38.67 
 
 
90 aa  60.8  0.000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.153113  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0442  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  34.48 
 
 
89 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.293204  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000222  fructose-specific phosphocarrier protein HPr/PTS system fructose-specific IIA component  37.04 
 
 
377 aa  60.5  0.000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2735  HPrNtr domain-containing protein  35.63 
 
 
89 aa  60.5  0.000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0874  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  31.03 
 
 
88 aa  59.3  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0015  HPrNtr  32.18 
 
 
93 aa  59.7  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000952712 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0090  bifunctional PTS system fructose-specific transporter subunit IIA/HPr protein  38.1 
 
 
378 aa  60.1  0.00000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4110  PTS system HPr enzyme  34.48 
 
 
89 aa  58.9  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.556155  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1869  HPrNtr  32.95 
 
 
88 aa  58.9  0.00000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2413  phosphoenolpyruvate--protein phosphotransferase  34.88 
 
 
836 aa  58.9  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4626  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  36.23 
 
 
92 aa  59.3  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.563542  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2247  phosphotransferase system, HPr  32.18 
 
 
89 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1735  HPrNtr domain-containing protein  36.14 
 
 
86 aa  58.9  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00241683  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2861  HPr family phosphocarrier protein  32.18 
 
 
89 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.324976  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2778  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  32.18 
 
 
89 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2872  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  32.18 
 
 
89 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.424776  normal  0.410297 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3989  phosphotransferase system HPr enzyme  34.48 
 
 
89 aa  58.9  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.846206 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2719  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  32.18 
 
 
89 aa  58.9  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1294  phosphocarrier protein HPr  38.55 
 
 
88 aa  58.5  0.00000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000628889  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4116  phosphocarrier protein HPr  36.78 
 
 
87 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4180  phosphocarrier protein HPr  36.78 
 
 
87 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00012094  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0309  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase  34.48 
 
 
865 aa  58.2  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3878  phosphocarrier protein HPr  35.63 
 
 
87 aa  57.8  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.050969  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3212  phosphocarrier protein HPr  31.03 
 
 
89 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0657  phosphocarrier protein HPr  31.03 
 
 
89 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.300797  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2833  phosphocarrier protein HPr  31.03 
 
 
89 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.858125  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0492  phosphocarrier protein HPr  31.03 
 
 
89 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0473  phosphocarrier protein HPr  31.03 
 
 
89 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.316514  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2916  HPr family phosphocarrier protein  31.03 
 
 
89 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0186  phosphocarrier protein HPr  31.03 
 
 
89 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1406  phosphocarrier protein HPr  31.03 
 
 
89 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2748  phosphocarrier protein HPr  35.63 
 
 
87 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0121246  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20160  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  33.33 
 
 
94 aa  57.4  0.00000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0751  phosphotransferase system HPr enzyme  32.18 
 
 
89 aa  57  0.00000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.862158  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0720  phosphoryl transfer system, HPr  33.33 
 
 
89 aa  57  0.00000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03197  phosphocarrier protein NPR  34.57 
 
 
90 aa  56.6  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.789521  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1143  phosphocarrier protein HPr  32.1 
 
 
88 aa  56.2  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.716406  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3959  phosphocarrier protein HPr  35.63 
 
 
87 aa  56.2  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.130103  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3790  phosphocarrier protein HPr  35.63 
 
 
87 aa  56.2  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.190201  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3805  phosphocarrier protein HPr  35.63 
 
 
87 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.241033  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2799  phosphoryl transfer system, HPr  34.48 
 
 
89 aa  56.6  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4268  phosphocarrier protein HPr  35.63 
 
 
87 aa  56.2  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0194102  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1080  phosphocarrier protein HPr  35.63 
 
 
87 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0937867  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0412  phosphocarrier protein HPr  31.03 
 
 
89 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.889761  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4069  phosphocarrier protein HPr  35.63 
 
 
87 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.486642 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2436  phosphotransferase system, HPr  34.57 
 
 
89 aa  56.2  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.119206  normal  0.979343 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4158  phosphocarrier protein HPr  35.63 
 
 
87 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00355795  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1165  phosphocarrier protein HPr  32.1 
 
 
88 aa  56.2  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.388376  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4827  phosphocarrier, HPr family  37.93 
 
 
89 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4270  dihydroxyacetone kinase subunit M  37.65 
 
 
477 aa  55.5  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.150742 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6190  HPrNtr  31.03 
 
 
89 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0323  phosphocarrier, HPr family  33.33 
 
 
112 aa  55.5  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0665  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  31.03 
 
 
89 aa  56.2  0.0000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0157  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  29.76 
 
 
90 aa  55.8  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.160349 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0643  phosphocarrier protein HPr  40.54 
 
 
87 aa  55.8  0.0000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.958845  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5271  phosphocarrier protein Chr  35.37 
 
 
82 aa  55.5  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0269583  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1215  PTS system HPr component  36.62 
 
 
86 aa  56.2  0.0000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0980  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  39.08 
 
 
88 aa  55.8  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0451  bifunctional PTS system fructose-specific transporter subunit IIA/HPr protein  32.95 
 
 
390 aa  55.1  0.0000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0219  HPrNtr  32.18 
 
 
89 aa  55.1  0.0000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0152  HPrNtr  28.57 
 
 
90 aa  55.1  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.28673  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0170  phosphocarrier, HPr family  28.57 
 
 
90 aa  55.1  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0159  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  28.57 
 
 
90 aa  55.1  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>