More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_09870 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_1306  S-adenosylmethionine synthetase  76.78 
 
 		 421 aa  652    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.883498  normal  0.454571 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09870  methionine adenosyltransferase  100 
 
 		 420 aa  864    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00866848 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08430  methionine adenosyltransferase  73.03 
 
 		 422 aa  598  1e-170  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.520335  normal  0.541462 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0501  S-adenosylmethionine synthetase  69.34 
 
 		 420 aa  571  1e-161  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2251  methionine adenosyltransferase  63.73 
 
 		 397 aa  520  1e-146  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000460807  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0087  S-adenosylmethionine synthetase  61.65 
 
 		 396 aa  514  1.0000000000000001e-145  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000221578  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0445  S-adenosylmethionine synthetase  61.65 
 
 		 395 aa  514  1e-144  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000309499  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0686  S-adenosylmethionine synthetase  63.28 
 
 		 396 aa  511  1e-144  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000273015  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09860  Methionine adenosyltransferase  61.8 
 
 		 402 aa  508  1e-143  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3891  S-adenosylmethionine synthetase  61.41 
 
 		 396 aa  508  9.999999999999999e-143  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00109689  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1065  S-adenosylmethionine synthetase  61.31 
 
 		 397 aa  504  9.999999999999999e-143  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2777  S-adenosylmethionine synthetase  60.68 
 
 		 403 aa  505  9.999999999999999e-143  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000102854  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0489  S-adenosylmethionine synthetase  61.11 
 
 		 405 aa  501  1e-141  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3874  methionine adenosyltransferase  58.84 
 
 		 396 aa  502  1e-141  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000696498  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4914  S-adenosylmethionine synthetase  59.47 
 
 		 399 aa  498  1e-140  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.11754  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0363  S-adenosylmethionine synthetase  60.05 
 
 		 399 aa  499  1e-140  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000052915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0160  S-adenosylmethionine synthetase  60.14 
 
 		 405 aa  500  1e-140  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.754463  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4594  S-adenosylmethionine synthetase  60.05 
 
 		 399 aa  498  1e-140  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.791965  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4877  S-adenosylmethionine synthetase  59.81 
 
 		 399 aa  498  1e-140  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000842328  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0894  S-adenosylmethionine synthetase  60.34 
 
 		 395 aa  499  1e-140  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000969915  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2818  Methionine adenosyltransferase  61.26 
 
 		 395 aa  498  1e-140  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.575493 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3565  S-adenosylmethionine synthetase  61.02 
 
 		 403 aa  498  1e-140  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.814506  normal  0.982729 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1234  S-adenosylmethionine synthetase  61.17 
 
 		 396 aa  500  1e-140  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0170314  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0659  S-adenosylmethionine synthetase  61.52 
 
 		 403 aa  499  1e-140  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3004  S-adenosylmethionine synthetase  59.22 
 
 		 397 aa  494  1e-139  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000578039  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4660  S-adenosylmethionine synthetase  59.23 
 
 		 399 aa  496  1e-139  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4500  S-adenosylmethionine synthetase  59.47 
 
 		 399 aa  498  1e-139  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4517  S-adenosylmethionine synthetase  59.23 
 
 		 399 aa  496  1e-139  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.536795  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2353  S-adenosylmethionine synthetase  59.42 
 
 		 405 aa  496  1e-139  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3437  S-adenosylmethionine synthetase  59.71 
 
 		 399 aa  498  1e-139  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.109386  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4886  S-adenosylmethionine synthetase  59.23 
 
 		 399 aa  496  1e-139  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5017  S-adenosylmethionine synthetase  59.23 
 
 		 399 aa  496  1e-139  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00446313  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4904  S-adenosylmethionine synthetase  59.47 
 
 		 399 aa  498  1e-139  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000363625  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3161  S-adenosylmethionine synthetase  59.85 
 
 		 396 aa  495  1e-139  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.153387  hitchhiker  0.00000474907 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3729  S-adenosylmethionine synthetase  61.9 
 
 		 408 aa  496  1e-139  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.582078  normal  0.310239 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0125  S-adenosylmethionine synthetase  60.14 
 
 		 396 aa  494  1e-139  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00105717  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2435  S-adenosylmethionine synthetase  62.56 
 
 		 391 aa  494  9.999999999999999e-139  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2145  S-adenosylmethionine synthetase  62.56 
 
 		 391 aa  494  9.999999999999999e-139  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1290  S-adenosylmethionine synthetase  60.68 
 
 		 417 aa  494  9.999999999999999e-139  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.134908  normal  0.0680854 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3096  methionine adenosyltransferase  60.77 
 
 		 397 aa  493  9.999999999999999e-139  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15650  methionine adenosyltransferase  59.85 
 
 		 400 aa  489  1e-137  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.148398  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27040  methionine adenosyltransferase  60.7 
 
 		 399 aa  488  1e-137  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.593252  normal  0.387061 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1186  S-adenosylmethionine synthetase  58.31 
 
 		 414 aa  486  1e-136  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14830  methionine adenosyltransferase  60.58 
 
 		 402 aa  487  1e-136  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.000117882  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2574  S-adenosylmethionine synthetase  58.62 
 
 		 395 aa  485  1e-136  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0485425  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2330  methionine adenosyltransferase  57.28 
 
 		 396 aa  485  1e-136  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1171  S-adenosylmethionine synthetase  58.74 
 
 		 395 aa  486  1e-136  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000972386  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18060  methionine adenosyltransferase  59.02 
 
 		 397 aa  485  1e-136  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0593613  normal  0.705478 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3981  S-adenosylmethionine synthetase  59.9 
 
 		 396 aa  487  1e-136  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000348916  hitchhiker  0.00000146833 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1133  S-adenosylmethionine synthetase  58.74 
 
 		 395 aa  486  1e-136  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000111198  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3549  S-adenosylmethionine synthetase  60.29 
 
 		 403 aa  486  1e-136  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.642541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1756  S-adenosylmethionine synthetase  59.76 
 
 		 395 aa  487  1e-136  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000785421  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1841  S-adenosylmethionine synthetase  56.39 
 
 		 398 aa  483  1e-135  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1864  S-adenosylmethionine synthetase  58.25 
 
 		 399 aa  484  1e-135  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2084  methionine adenosyltransferase  59.61 
 
 		 395 aa  484  1e-135  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.191002  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5342  S-adenosylmethionine synthetase  58.74 
 
 		 399 aa  481  1e-135  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.339579  normal  0.683287 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1470  S-adenosylmethionine synthetase  61.06 
 
 		 412 aa  483  1e-135  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0274097  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1877  S-adenosylmethionine synthetase  56.39 
 
 		 398 aa  483  1e-135  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1363  S-adenosylmethionine synthetase  58.99 
 
 		 395 aa  483  1e-135  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.176558  normal  0.04012 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1853  S-adenosylmethionine synthetase  60.1 
 
 		 399 aa  482  1e-135  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0451389  normal  0.42131 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3094  S-adenosylmethionine synthetase  58.39 
 
 		 397 aa  479  1e-134  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0289909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1716  S-adenosylmethionine synthetase  58.17 
 
 		 398 aa  478  1e-134  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.123594  hitchhiker  0.00797673 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1383  methionine adenosyltransferase  57.52 
 
 		 401 aa  481  1e-134  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0660  S-adenosylmethionine synthetase  58.41 
 
 		 402 aa  479  1e-134  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000409512  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1857  S-adenosylmethionine synthetase  58.25 
 
 		 399 aa  480  1e-134  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.41268  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0512  S-adenosylmethionine synthetase  57.6 
 
 		 406 aa  476  1e-133  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.128804  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2989  Methionine adenosyltransferase  59.22 
 
 		 399 aa  476  1e-133  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.757819 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3103  S-adenosylmethionine synthetase  57.52 
 
 		 401 aa  476  1e-133  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0169073  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_453  S-adenosylmethionine synthetase  57.11 
 
 		 406 aa  473  1e-132  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00689475  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3124  S-adenosylmethionine synthetase  58.11 
 
 		 398 aa  472  1e-132  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.110006  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0488  S-adenosylmethionine synthetase  57.35 
 
 		 406 aa  474  1e-132  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.227197  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2521  S-adenosylmethionine synthetase  56.25 
 
 		 388 aa  474  1e-132  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.53813 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1718  S-adenosylmethionine synthetase  59.06 
 
 		 400 aa  474  1e-132  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.388889  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12520  methionine adenosyltransferase  58.7 
 
 		 420 aa  473  1e-132  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.260949  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2256  S-adenosylmethionine synthetase  59.21 
 
 		 411 aa  474  1e-132  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0616987  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1071  S-adenosylmethionine synthetase  58.48 
 
 		 393 aa  472  1e-132  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0298396  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1352  S-adenosylmethionine synthetase  56.17 
 
 		 399 aa  471  1.0000000000000001e-131  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1821  S-adenosylmethionine synthetase  56.69 
 
 		 385 aa  468  1.0000000000000001e-131  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0267535  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4271  S-adenosylmethionine synthetase  56.28 
 
 		 406 aa  468  1.0000000000000001e-131  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.268739  decreased coverage  0.00381419 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2575  S-adenosylmethionine synthetase  57.97 
 
 		 407 aa  468  1.0000000000000001e-131  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.136519  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1993  S-adenosylmethionine synthetase  59.95 
 
 		 411 aa  471  1.0000000000000001e-131  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000306332 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2439  S-adenosylmethionine synthetase  59.65 
 
 		 396 aa  471  1.0000000000000001e-131  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.523841  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1692  S-adenosylmethionine synthetase  58.11 
 
 		 397 aa  467  9.999999999999999e-131  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.753186  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4320  methionine adenosyltransferase  56.07 
 
 		 387 aa  466  9.999999999999999e-131  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.238534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3192  S-adenosylmethionine synthetase  57.04 
 
 		 398 aa  466  9.999999999999999e-131  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.000568371  normal  0.539174 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5235  S-adenosylmethionine synthetase  58.42 
 
 		 400 aa  465  9.999999999999999e-131  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4159  S-adenosylmethionine synthetase  58.03 
 
 		 397 aa  465  9.999999999999999e-131  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0297831  normal  0.258747 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4357  S-adenosylmethionine synthetase  59.81 
 
 		 410 aa  463  1e-129  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.808224  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1928  S-adenosylmethionine synthetase  58.25 
 
 		 389 aa  463  1e-129  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.10598e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0470  S-adenosylmethionine synthetase  57.39 
 
 		 382 aa  462  1e-129  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1135  S-adenosylmethionine synthetase  55.98 
 
 		 397 aa  461  1e-129  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2348  S-adenosylmethionine synthetase  57.69 
 
 		 403 aa  462  1e-129  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.233249  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3328  S-adenosylmethionine synthetase  55.9 
 
 		 384 aa  458  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.196348  normal  0.570149 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1315  S-adenosylmethionine synthetase  55.96 
 
 		 398 aa  459  9.999999999999999e-129  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.119396  normal  0.284127 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12750  methionine adenosyltransferase  56.49 
 
 		 405 aa  459  9.999999999999999e-129  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0223394 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2993  S-adenosylmethionine synthetase  57.35 
 
 		 401 aa  459  9.999999999999999e-129  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.285331 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0456  S-adenosylmethionine synthetase  57.28 
 
 		 402 aa  459  9.999999999999999e-129  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000025014  normal  0.132712 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0772  S-adenosylmethionine synthetase  55.66 
 
 		 384 aa  457  1e-127  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0501612  hitchhiker  0.00139149 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0201  S-adenosylmethionine synthetase  56.25 
 
 		 387 aa  457  1e-127  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3263  S-adenosylmethionine synthetase  55.66 
 
 		 384 aa  457  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0673019  normal  0.240242 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>