More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_3096 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_3891  S-adenosylmethionine synthetase  77.78 
 
 		 396 aa  640    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00109689  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2251  methionine adenosyltransferase  79.44 
 
 		 397 aa  657    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000460807  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3096  methionine adenosyltransferase  100 
 
 		 397 aa  806    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3981  S-adenosylmethionine synthetase  75.76 
 
 		 396 aa  626  1e-178  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000348916  hitchhiker  0.00000146833 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2777  S-adenosylmethionine synthetase  76.08 
 
 		 403 aa  626  1e-178  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000102854  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0659  S-adenosylmethionine synthetase  75.32 
 
 		 403 aa  622  1e-177  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3437  S-adenosylmethionine synthetase  76.01 
 
 		 399 aa  619  1e-176  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.109386  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4914  S-adenosylmethionine synthetase  75.95 
 
 		 399 aa  615  1e-175  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.11754  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4660  S-adenosylmethionine synthetase  75.95 
 
 		 399 aa  616  1e-175  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4500  S-adenosylmethionine synthetase  75.95 
 
 		 399 aa  616  1e-175  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4517  S-adenosylmethionine synthetase  75.95 
 
 		 399 aa  616  1e-175  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.536795  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5017  S-adenosylmethionine synthetase  75.95 
 
 		 399 aa  616  1e-175  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00446313  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4877  S-adenosylmethionine synthetase  75.95 
 
 		 399 aa  614  1e-175  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000842328  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4904  S-adenosylmethionine synthetase  75.95 
 
 		 399 aa  616  1e-175  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000363625  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4886  S-adenosylmethionine synthetase  75.95 
 
 		 399 aa  616  1e-175  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0087  S-adenosylmethionine synthetase  73.99 
 
 		 396 aa  615  1e-175  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000221578  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0363  S-adenosylmethionine synthetase  75.95 
 
 		 399 aa  614  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000052915  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0445  S-adenosylmethionine synthetase  73.86 
 
 		 395 aa  613  9.999999999999999e-175  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000309499  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4594  S-adenosylmethionine synthetase  75.7 
 
 		 399 aa  610  1e-173  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.791965  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0686  S-adenosylmethionine synthetase  75.51 
 
 		 396 aa  610  1e-173  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000273015  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2574  S-adenosylmethionine synthetase  73.59 
 
 		 395 aa  606  9.999999999999999e-173  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0485425  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0894  S-adenosylmethionine synthetase  71.72 
 
 		 395 aa  603  1.0000000000000001e-171  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000969915  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1071  S-adenosylmethionine synthetase  72.84 
 
 		 393 aa  598  1e-170  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0298396  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2084  methionine adenosyltransferase  73.47 
 
 		 395 aa  600  1e-170  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.191002  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1234  S-adenosylmethionine synthetase  71.97 
 
 		 396 aa  595  1e-169  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0170314  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09860  Methionine adenosyltransferase  72.45 
 
 		 402 aa  592  1e-168  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2330  methionine adenosyltransferase  68.43 
 
 		 396 aa  583  1.0000000000000001e-165  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3874  methionine adenosyltransferase  70.08 
 
 		 396 aa  578  1e-164  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000696498  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1877  S-adenosylmethionine synthetase  70.33 
 
 		 398 aa  568  1e-161  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1352  S-adenosylmethionine synthetase  71.1 
 
 		 399 aa  569  1e-161  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1841  S-adenosylmethionine synthetase  70.33 
 
 		 398 aa  568  1e-161  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0660  S-adenosylmethionine synthetase  70.05 
 
 		 402 aa  569  1e-161  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000409512  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2435  S-adenosylmethionine synthetase  71.47 
 
 		 391 aa  565  1e-160  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2145  S-adenosylmethionine synthetase  71.47 
 
 		 391 aa  565  1e-160  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1725  S-adenosylmethionine synthetase  68.38 
 
 		 402 aa  559  1e-158  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.710096  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2353  S-adenosylmethionine synthetase  67.18 
 
 		 405 aa  555  1e-157  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0456  S-adenosylmethionine synthetase  68.72 
 
 		 402 aa  555  1e-157  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000025014  normal  0.132712 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0489  S-adenosylmethionine synthetase  66.92 
 
 		 405 aa  550  1e-155  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0160  S-adenosylmethionine synthetase  65.91 
 
 		 405 aa  544  1e-153  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.754463  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1171  S-adenosylmethionine synthetase  65.81 
 
 		 395 aa  540  9.999999999999999e-153  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000972386  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1133  S-adenosylmethionine synthetase  65.81 
 
 		 395 aa  540  9.999999999999999e-153  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000111198  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1186  S-adenosylmethionine synthetase  66.08 
 
 		 414 aa  539  9.999999999999999e-153  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0512  S-adenosylmethionine synthetase  64.96 
 
 		 406 aa  536  1e-151  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.128804  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_453  S-adenosylmethionine synthetase  64.96 
 
 		 406 aa  536  1e-151  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00689475  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3116  S-adenosylmethionine synthetase  66.41 
 
 		 391 aa  536  1e-151  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.292647 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1296  S-adenosylmethionine synthetase  67.95 
 
 		 395 aa  535  1e-151  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0081249  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1135  S-adenosylmethionine synthetase  66.24 
 
 		 397 aa  535  1e-151  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2642  S-adenosylmethionine synthetase  66.32 
 
 		 391 aa  531  1e-150  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0488  S-adenosylmethionine synthetase  64.19 
 
 		 406 aa  533  1e-150  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.227197  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0831  S-adenosylmethionine synthetase  66.15 
 
 		 398 aa  528  1e-149  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0125  S-adenosylmethionine synthetase  64.3 
 
 		 396 aa  530  1e-149  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00105717  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3565  S-adenosylmethionine synthetase  66.08 
 
 		 403 aa  530  1e-149  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.814506  normal  0.982729 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1290  S-adenosylmethionine synthetase  66.17 
 
 		 417 aa  529  1e-149  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.134908  normal  0.0680854 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1756  S-adenosylmethionine synthetase  65.47 
 
 		 395 aa  527  1e-148  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000785421  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3124  S-adenosylmethionine synthetase  64.57 
 
 		 398 aa  526  1e-148  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.110006  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3549  S-adenosylmethionine synthetase  65.32 
 
 		 403 aa  522  1e-147  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.642541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1692  S-adenosylmethionine synthetase  65.14 
 
 		 397 aa  519  1e-146  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.753186  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1716  S-adenosylmethionine synthetase  65.49 
 
 		 398 aa  521  1e-146  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.123594  hitchhiker  0.00797673 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2348  S-adenosylmethionine synthetase  64.5 
 
 		 403 aa  516  1.0000000000000001e-145  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.233249  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0871  S-adenosylmethionine synthetase  62.12 
 
 		 383 aa  514  1.0000000000000001e-145  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1470  S-adenosylmethionine synthetase  67.43 
 
 		 412 aa  515  1.0000000000000001e-145  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0274097  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3331  S-adenosylmethionine synthetase  62.63 
 
 		 383 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.175486  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03161  S-adenosylmethionine synthetase  62.76 
 
 		 381 aa  517  1.0000000000000001e-145  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.713354  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1363  S-adenosylmethionine synthetase  65.83 
 
 		 395 aa  512  1e-144  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.176558  normal  0.04012 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0929  S-adenosylmethionine synthetase  61.87 
 
 		 383 aa  511  1e-144  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2818  Methionine adenosyltransferase  65.83 
 
 		 395 aa  512  1e-144  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.575493 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0533  S-adenosylmethionine synthetase  63.27 
 
 		 393 aa  513  1e-144  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000146797  normal  0.123305 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2463  S-adenosylmethionine synthetase  62.93 
 
 		 417 aa  512  1e-144  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.328764  hitchhiker  0.00000000000157811 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3161  S-adenosylmethionine synthetase  64.57 
 
 		 396 aa  511  1e-144  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.153387  hitchhiker  0.00000474907 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0772  S-adenosylmethionine synthetase  62.37 
 
 		 383 aa  514  1e-144  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3251  S-adenosylmethionine synthetase  62.37 
 
 		 383 aa  514  1e-144  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2161  S-adenosylmethionine synthetase  64.9 
 
 		 399 aa  512  1e-144  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3004  S-adenosylmethionine synthetase  65.08 
 
 		 397 aa  514  1e-144  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000578039  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3354  S-adenosylmethionine synthetase  62.37 
 
 		 383 aa  514  1e-144  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3729  S-adenosylmethionine synthetase  66.41 
 
 		 408 aa  514  1e-144  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.582078  normal  0.310239 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3541  S-adenosylmethionine synthetase  62.37 
 
 		 383 aa  510  1e-143  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3660  S-adenosylmethionine synthetase  62.37 
 
 		 383 aa  510  1e-143  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.2045 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1065  S-adenosylmethionine synthetase  64.48 
 
 		 397 aa  510  1e-143  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15650  methionine adenosyltransferase  65.4 
 
 		 400 aa  511  1e-143  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.148398  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0646  S-adenosylmethionine synthetase  62.37 
 
 		 383 aa  508  1e-143  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00167645  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3466  S-adenosylmethionine synthetase  62.37 
 
 		 383 aa  510  1e-143  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0826  S-adenosylmethionine synthetase  62.12 
 
 		 383 aa  508  1e-143  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.232254  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3192  S-adenosylmethionine synthetase  64.63 
 
 		 398 aa  508  9.999999999999999e-143  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.000568371  normal  0.539174 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1082  S-adenosylmethionine synthetase  61.87 
 
 		 383 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0507835  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3661  S-adenosylmethionine synthetase  65.24 
 
 		 393 aa  504  9.999999999999999e-143  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.284553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0413  S-adenosylmethionine synthetase  62.24 
 
 		 390 aa  504  9.999999999999999e-143  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0737611  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0751  S-adenosylmethionine synthetase  62.12 
 
 		 383 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1864  S-adenosylmethionine synthetase  62.53 
 
 		 399 aa  505  9.999999999999999e-143  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3094  S-adenosylmethionine synthetase  63.98 
 
 		 397 aa  504  1e-141  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0289909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4320  methionine adenosyltransferase  62.09 
 
 		 387 aa  501  1e-141  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.238534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3099  S-adenosylmethionine synthetase  61.65 
 
 		 384 aa  499  1e-140  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1256  S-adenosylmethionine synthetase  58.62 
 
 		 395 aa  500  1e-140  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.247936  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4132  S-adenosylmethionine synthetase  62.44 
 
 		 421 aa  500  1e-140  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000371992  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3252  S-adenosylmethionine synthetase  61.15 
 
 		 384 aa  499  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0015174  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4159  S-adenosylmethionine synthetase  63.82 
 
 		 397 aa  500  1e-140  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0297831  normal  0.258747 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1383  methionine adenosyltransferase  60.7 
 
 		 401 aa  500  1e-140  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3433  S-adenosylmethionine synthetase  61.15 
 
 		 384 aa  498  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00223184 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3328  S-adenosylmethionine synthetase  61.4 
 
 		 384 aa  500  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.196348  normal  0.570149 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3084  S-adenosylmethionine synthetase  61.65 
 
 		 384 aa  499  1e-140  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.383726  hitchhiker  0.000161028 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02735  hypothetical protein  61.65 
 
 		 384 aa  499  1e-140  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.457385  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>