More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2348 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_2575  S-adenosylmethionine synthetase  80.89 
 
 		 407 aa  671    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.136519  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3103  S-adenosylmethionine synthetase  81.06 
 
 		 401 aa  645    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0169073  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5235  S-adenosylmethionine synthetase  80.41 
 
 		 400 aa  637    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2348  S-adenosylmethionine synthetase  100 
 
 		 403 aa  813    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.233249  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2414  S-adenosylmethionine synthetase  79.25 
 
 		 402 aa  645    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.295636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2373  S-adenosylmethionine synthetase  79.25 
 
 		 402 aa  645    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15650  methionine adenosyltransferase  78.36 
 
 		 400 aa  645    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.148398  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4159  S-adenosylmethionine synthetase  79.4 
 
 		 397 aa  641    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0297831  normal  0.258747 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2420  S-adenosylmethionine synthetase  79.25 
 
 		 402 aa  645    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.219199 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3004  S-adenosylmethionine synthetase  76.69 
 
 		 397 aa  631  1e-180  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000578039  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11421  S-adenosylmethionine synthetase  78.84 
 
 		 403 aa  631  1e-180  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0291702  normal  0.38734 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27040  methionine adenosyltransferase  78.52 
 
 		 399 aa  630  1e-179  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.593252  normal  0.387061 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2670  S-adenosylmethionine synthetase  77.75 
 
 		 402 aa  629  1e-179  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.178907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3737  S-adenosylmethionine synthetase  77 
 
 		 402 aa  626  1e-178  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.193212 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2818  Methionine adenosyltransferase  76.94 
 
 		 395 aa  626  1e-178  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.575493 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3124  S-adenosylmethionine synthetase  76.13 
 
 		 398 aa  612  9.999999999999999e-175  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.110006  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1363  S-adenosylmethionine synthetase  74.44 
 
 		 395 aa  605  9.999999999999999e-173  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.176558  normal  0.04012 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5342  S-adenosylmethionine synthetase  74.63 
 
 		 399 aa  607  9.999999999999999e-173  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.339579  normal  0.683287 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1716  S-adenosylmethionine synthetase  75.06 
 
 		 398 aa  602  1.0000000000000001e-171  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.123594  hitchhiker  0.00797673 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1065  S-adenosylmethionine synthetase  73.37 
 
 		 397 aa  601  1.0000000000000001e-171  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1857  S-adenosylmethionine synthetase  73.48 
 
 		 399 aa  595  1e-169  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.41268  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3192  S-adenosylmethionine synthetase  75.31 
 
 		 398 aa  596  1e-169  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.000568371  normal  0.539174 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3094  S-adenosylmethionine synthetase  72.36 
 
 		 397 aa  591  1e-168  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0289909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1864  S-adenosylmethionine synthetase  72.98 
 
 		 399 aa  594  1e-168  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2989  Methionine adenosyltransferase  74.69 
 
 		 399 aa  590  1e-167  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.757819 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1290  S-adenosylmethionine synthetase  72.18 
 
 		 417 aa  582  1.0000000000000001e-165  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.134908  normal  0.0680854 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3161  S-adenosylmethionine synthetase  72.8 
 
 		 396 aa  574  1.0000000000000001e-162  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.153387  hitchhiker  0.00000474907 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2993  S-adenosylmethionine synthetase  70.5 
 
 		 401 aa  565  1e-160  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.285331 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2256  S-adenosylmethionine synthetase  70.35 
 
 		 411 aa  558  1e-158  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0616987  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1993  S-adenosylmethionine synthetase  70.35 
 
 		 411 aa  556  1e-157  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000306332 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1718  S-adenosylmethionine synthetase  71.1 
 
 		 400 aa  546  1e-154  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.388889  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1315  S-adenosylmethionine synthetase  68 
 
 		 398 aa  541  1e-153  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.119396  normal  0.284127 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2439  S-adenosylmethionine synthetase  72.28 
 
 		 396 aa  542  1e-153  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.523841  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18060  methionine adenosyltransferase  69.92 
 
 		 397 aa  538  9.999999999999999e-153  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0593613  normal  0.705478 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12750  methionine adenosyltransferase  67.24 
 
 		 405 aa  536  1e-151  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0223394 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1853  S-adenosylmethionine synthetase  69.48 
 
 		 399 aa  536  1e-151  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0451389  normal  0.42131 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2251  methionine adenosyltransferase  64.82 
 
 		 397 aa  521  1e-147  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000460807  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12520  methionine adenosyltransferase  66.5 
 
 		 420 aa  519  1e-146  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.260949  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0160  S-adenosylmethionine synthetase  65.41 
 
 		 405 aa  516  1.0000000000000001e-145  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.754463  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0659  S-adenosylmethionine synthetase  65.09 
 
 		 403 aa  515  1.0000000000000001e-145  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1071  S-adenosylmethionine synthetase  65.74 
 
 		 393 aa  517  1.0000000000000001e-145  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0298396  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3096  methionine adenosyltransferase  64.5 
 
 		 397 aa  516  1.0000000000000001e-145  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3891  S-adenosylmethionine synthetase  63.75 
 
 		 396 aa  515  1.0000000000000001e-145  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00109689  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2777  S-adenosylmethionine synthetase  64.09 
 
 		 403 aa  515  1.0000000000000001e-145  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000102854  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0489  S-adenosylmethionine synthetase  65.16 
 
 		 405 aa  513  1e-144  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14830  methionine adenosyltransferase  66.08 
 
 		 402 aa  513  1e-144  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.000117882  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2045  S-adenosylmethionine synthetase  69.04 
 
 		 407 aa  514  1e-144  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00317671 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09860  Methionine adenosyltransferase  63.96 
 
 		 402 aa  508  1e-143  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3437  S-adenosylmethionine synthetase  64.02 
 
 		 399 aa  504  9.999999999999999e-143  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.109386  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3981  S-adenosylmethionine synthetase  64.59 
 
 		 396 aa  506  9.999999999999999e-143  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000348916  hitchhiker  0.00000146833 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2574  S-adenosylmethionine synthetase  64.56 
 
 		 395 aa  505  9.999999999999999e-143  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0485425  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1692  S-adenosylmethionine synthetase  64.81 
 
 		 397 aa  506  9.999999999999999e-143  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.753186  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3565  S-adenosylmethionine synthetase  65.24 
 
 		 403 aa  506  9.999999999999999e-143  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.814506  normal  0.982729 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4914  S-adenosylmethionine synthetase  63.77 
 
 		 399 aa  502  1e-141  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.11754  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4660  S-adenosylmethionine synthetase  63.77 
 
 		 399 aa  503  1e-141  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4500  S-adenosylmethionine synthetase  63.77 
 
 		 399 aa  503  1e-141  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4517  S-adenosylmethionine synthetase  63.77 
 
 		 399 aa  503  1e-141  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.536795  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5017  S-adenosylmethionine synthetase  63.77 
 
 		 399 aa  503  1e-141  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00446313  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4886  S-adenosylmethionine synthetase  63.77 
 
 		 399 aa  503  1e-141  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4877  S-adenosylmethionine synthetase  63.77 
 
 		 399 aa  503  1e-141  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000842328  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3549  S-adenosylmethionine synthetase  64.99 
 
 		 403 aa  501  1e-141  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.642541  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0363  S-adenosylmethionine synthetase  64.02 
 
 		 399 aa  504  1e-141  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000052915  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4904  S-adenosylmethionine synthetase  63.77 
 
 		 399 aa  503  1e-141  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000363625  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0125  S-adenosylmethionine synthetase  63.16 
 
 		 396 aa  499  1e-140  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00105717  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0087  S-adenosylmethionine synthetase  61.65 
 
 		 396 aa  499  1e-140  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000221578  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0894  S-adenosylmethionine synthetase  62.47 
 
 		 395 aa  500  1e-140  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000969915  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4594  S-adenosylmethionine synthetase  63.77 
 
 		 399 aa  501  1e-140  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.791965  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0445  S-adenosylmethionine synthetase  61.56 
 
 		 395 aa  497  1e-139  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000309499  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2330  methionine adenosyltransferase  59.25 
 
 		 396 aa  493  9.999999999999999e-139  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2084  methionine adenosyltransferase  61.62 
 
 		 395 aa  492  9.999999999999999e-139  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.191002  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2435  S-adenosylmethionine synthetase  65.31 
 
 		 391 aa  493  9.999999999999999e-139  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2145  S-adenosylmethionine synthetase  65.31 
 
 		 391 aa  493  9.999999999999999e-139  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1171  S-adenosylmethionine synthetase  61.31 
 
 		 395 aa  491  1e-137  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000972386  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1133  S-adenosylmethionine synthetase  61.31 
 
 		 395 aa  491  1e-137  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000111198  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0686  S-adenosylmethionine synthetase  61.4 
 
 		 396 aa  490  1e-137  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000273015  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4661  S-adenosylmethionine synthetase  58.15 
 
 		 420 aa  484  1e-136  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.778397  decreased coverage  0.00341152 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1186  S-adenosylmethionine synthetase  62.41 
 
 		 414 aa  484  1e-135  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2642  S-adenosylmethionine synthetase  63.04 
 
 		 391 aa  482  1e-135  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2353  S-adenosylmethionine synthetase  60.3 
 
 		 405 aa  479  1e-134  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1877  S-adenosylmethionine synthetase  59.8 
 
 		 398 aa  480  1e-134  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1858  S-adenosylmethionine synthetase  59.22 
 
 		 422 aa  481  1e-134  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1841  S-adenosylmethionine synthetase  59.8 
 
 		 398 aa  480  1e-134  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1832  S-adenosylmethionine synthetase  59.22 
 
 		 422 aa  481  1e-134  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0780  S-adenosylmethionine synthetase  58.64 
 
 		 420 aa  476  1e-133  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000106532  hitchhiker  0.000013186 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3729  S-adenosylmethionine synthetase  63.04 
 
 		 408 aa  476  1e-133  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.582078  normal  0.310239 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0753  Non-specific protein-tyrosine kinase  61.6 
 
 		 384 aa  473  1e-132  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3252  S-adenosylmethionine synthetase  62.09 
 
 		 384 aa  473  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0015174  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0831  S-adenosylmethionine synthetase  59.34 
 
 		 398 aa  472  1e-132  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0772  S-adenosylmethionine synthetase  61.6 
 
 		 384 aa  473  1e-132  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0501612  hitchhiker  0.00139149 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4244  S-adenosylmethionine synthetase  61.6 
 
 		 384 aa  473  1e-132  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.908743  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3336  S-adenosylmethionine synthetase  62.34 
 
 		 384 aa  473  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.216224  normal  0.254076 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3099  S-adenosylmethionine synthetase  61.6 
 
 		 384 aa  473  1e-132  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3374  S-adenosylmethionine synthetase  61.6 
 
 		 384 aa  472  1e-132  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3284  S-adenosylmethionine synthetase  61.6 
 
 		 384 aa  473  1e-132  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1234  S-adenosylmethionine synthetase  60.5 
 
 		 396 aa  473  1e-132  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0170314  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3433  S-adenosylmethionine synthetase  62.09 
 
 		 384 aa  471  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00223184 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1756  S-adenosylmethionine synthetase  60 
 
 		 395 aa  473  1e-132  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000785421  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3084  S-adenosylmethionine synthetase  61.6 
 
 		 384 aa  473  1e-132  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.383726  hitchhiker  0.000161028 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3874  methionine adenosyltransferase  60.05 
 
 		 396 aa  474  1e-132  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000696498  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02735  hypothetical protein  61.6 
 
 		 384 aa  473  1e-132  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.457385  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>