More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_2777 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_3874  methionine adenosyltransferase  76.84 
 
 
396 aa  652    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000696498  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0659  S-adenosylmethionine synthetase  95.04 
 
 
403 aa  792    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4914  S-adenosylmethionine synthetase  87.66 
 
 
399 aa  732    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.11754  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4660  S-adenosylmethionine synthetase  87.66 
 
 
399 aa  732    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4500  S-adenosylmethionine synthetase  87.66 
 
 
399 aa  731    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4517  S-adenosylmethionine synthetase  87.66 
 
 
399 aa  732    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.536795  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4877  S-adenosylmethionine synthetase  87.41 
 
 
399 aa  731    Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000842328  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2777  S-adenosylmethionine synthetase  100 
 
 
403 aa  822    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000102854  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4594  S-adenosylmethionine synthetase  87.66 
 
 
399 aa  731    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.791965  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5017  S-adenosylmethionine synthetase  87.66 
 
 
399 aa  732    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00446313  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3437  S-adenosylmethionine synthetase  88.41 
 
 
399 aa  738    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.109386  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3981  S-adenosylmethionine synthetase  78.63 
 
 
396 aa  643    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000348916  hitchhiker  0.00000146833 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2251  methionine adenosyltransferase  79.8 
 
 
397 aa  666    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000460807  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0363  S-adenosylmethionine synthetase  87.66 
 
 
399 aa  733    Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000052915  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4886  S-adenosylmethionine synthetase  87.66 
 
 
399 aa  732    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0686  S-adenosylmethionine synthetase  80.87 
 
 
396 aa  661    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000273015  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2574  S-adenosylmethionine synthetase  79.04 
 
 
395 aa  645    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0485425  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4904  S-adenosylmethionine synthetase  87.66 
 
 
399 aa  731    Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000363625  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3891  S-adenosylmethionine synthetase  80.66 
 
 
396 aa  672    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00109689  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1841  S-adenosylmethionine synthetase  77.22 
 
 
398 aa  639    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0445  S-adenosylmethionine synthetase  78.88 
 
 
395 aa  650    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000309499  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1877  S-adenosylmethionine synthetase  77.22 
 
 
398 aa  639    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3096  methionine adenosyltransferase  76.08 
 
 
397 aa  626  1e-178  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0087  S-adenosylmethionine synthetase  74.3 
 
 
396 aa  627  1e-178  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000221578  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1352  S-adenosylmethionine synthetase  75.19 
 
 
399 aa  618  1e-176  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1234  S-adenosylmethionine synthetase  73.28 
 
 
396 aa  618  1e-176  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0170314  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2435  S-adenosylmethionine synthetase  75.96 
 
 
391 aa  609  1e-173  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2145  S-adenosylmethionine synthetase  75.96 
 
 
391 aa  609  1e-173  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09860  Methionine adenosyltransferase  74.37 
 
 
402 aa  608  1e-173  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2330  methionine adenosyltransferase  71.54 
 
 
396 aa  605  9.999999999999999e-173  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0894  S-adenosylmethionine synthetase  71.76 
 
 
395 aa  603  1.0000000000000001e-171  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000969915  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1071  S-adenosylmethionine synthetase  74.05 
 
 
393 aa  602  1.0000000000000001e-171  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0298396  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0660  S-adenosylmethionine synthetase  70.97 
 
 
402 aa  600  1e-170  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000409512  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2084  methionine adenosyltransferase  73.08 
 
 
395 aa  595  1e-169  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.191002  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0456  S-adenosylmethionine synthetase  69.9 
 
 
402 aa  592  1e-168  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000025014  normal  0.132712 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0160  S-adenosylmethionine synthetase  68.17 
 
 
405 aa  581  1.0000000000000001e-165  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.754463  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0489  S-adenosylmethionine synthetase  69.67 
 
 
405 aa  583  1.0000000000000001e-165  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2353  S-adenosylmethionine synthetase  67.34 
 
 
405 aa  571  1.0000000000000001e-162  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1296  S-adenosylmethionine synthetase  70.66 
 
 
395 aa  568  1e-161  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0081249  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0831  S-adenosylmethionine synthetase  67.86 
 
 
398 aa  566  1e-160  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1135  S-adenosylmethionine synthetase  68.03 
 
 
397 aa  567  1e-160  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3565  S-adenosylmethionine synthetase  68.09 
 
 
403 aa  565  1e-160  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.814506  normal  0.982729 
 
 
-
 
NC_002936  DET0512  S-adenosylmethionine synthetase  64.52 
 
 
406 aa  563  1.0000000000000001e-159  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.128804  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0488  S-adenosylmethionine synthetase  64.27 
 
 
406 aa  562  1.0000000000000001e-159  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.227197  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0125  S-adenosylmethionine synthetase  67.95 
 
 
396 aa  559  1e-158  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00105717  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3549  S-adenosylmethionine synthetase  67.84 
 
 
403 aa  558  1e-158  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.642541  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_453  S-adenosylmethionine synthetase  64.27 
 
 
406 aa  560  1e-158  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00689475  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1383  methionine adenosyltransferase  65.92 
 
 
401 aa  555  1e-157  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1171  S-adenosylmethionine synthetase  67.44 
 
 
395 aa  557  1e-157  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000972386  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1133  S-adenosylmethionine synthetase  67.44 
 
 
395 aa  557  1e-157  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000111198  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2161  S-adenosylmethionine synthetase  67.93 
 
 
399 aa  555  1e-157  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1756  S-adenosylmethionine synthetase  67.01 
 
 
395 aa  555  1e-157  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000785421  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0533  S-adenosylmethionine synthetase  67.09 
 
 
393 aa  553  1e-156  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000146797  normal  0.123305 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1186  S-adenosylmethionine synthetase  65.5 
 
 
414 aa  550  1e-155  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1725  S-adenosylmethionine synthetase  64.84 
 
 
402 aa  549  1e-155  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.710096  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1082  S-adenosylmethionine synthetase  67.43 
 
 
383 aa  542  1e-153  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0507835  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0646  S-adenosylmethionine synthetase  67.43 
 
 
383 aa  543  1e-153  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00167645  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0929  S-adenosylmethionine synthetase  65.9 
 
 
383 aa  538  9.999999999999999e-153  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0751  S-adenosylmethionine synthetase  65.9 
 
 
383 aa  538  9.999999999999999e-153  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0871  S-adenosylmethionine synthetase  66.67 
 
 
383 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4132  S-adenosylmethionine synthetase  64.3 
 
 
421 aa  540  9.999999999999999e-153  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000371992  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3541  S-adenosylmethionine synthetase  66.41 
 
 
383 aa  537  1e-151  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0826  S-adenosylmethionine synthetase  66.41 
 
 
383 aa  536  1e-151  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.232254  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3466  S-adenosylmethionine synthetase  66.41 
 
 
383 aa  537  1e-151  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3478  S-adenosylmethionine synthetase  65.2 
 
 
418 aa  537  1e-151  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.575314 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0772  S-adenosylmethionine synthetase  65.65 
 
 
383 aa  536  1e-151  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3251  S-adenosylmethionine synthetase  65.65 
 
 
383 aa  536  1e-151  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0873  S-adenosylmethionine synthetase  66.67 
 
 
383 aa  536  1e-151  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3354  S-adenosylmethionine synthetase  65.65 
 
 
383 aa  536  1e-151  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3660  S-adenosylmethionine synthetase  66.41 
 
 
383 aa  537  1e-151  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.2045 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4320  methionine adenosyltransferase  64.45 
 
 
387 aa  533  1e-150  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.238534  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2463  S-adenosylmethionine synthetase  62.71 
 
 
417 aa  533  1e-150  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.328764  hitchhiker  0.00000000000157811 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4661  S-adenosylmethionine synthetase  63.16 
 
 
420 aa  532  1e-150  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.778397  decreased coverage  0.00341152 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2760  S-adenosylmethionine synthetase  66.41 
 
 
383 aa  531  1e-150  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02772  S-adenosylmethionine synthetase  65.65 
 
 
384 aa  529  1e-149  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.374196  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0753  Non-specific protein-tyrosine kinase  65.65 
 
 
384 aa  529  1e-149  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3284  S-adenosylmethionine synthetase  65.65 
 
 
384 aa  529  1e-149  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3084  S-adenosylmethionine synthetase  65.65 
 
 
384 aa  529  1e-149  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.383726  hitchhiker  0.000161028 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1858  S-adenosylmethionine synthetase  64.06 
 
 
422 aa  530  1e-149  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4244  S-adenosylmethionine synthetase  65.65 
 
 
384 aa  529  1e-149  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.908743  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3328  S-adenosylmethionine synthetase  65.14 
 
 
384 aa  528  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.196348  normal  0.570149 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0772  S-adenosylmethionine synthetase  65.65 
 
 
384 aa  529  1e-149  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0501612  hitchhiker  0.00139149 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02735  hypothetical protein  65.65 
 
 
384 aa  529  1e-149  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.457385  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3263  S-adenosylmethionine synthetase  65.14 
 
 
384 aa  529  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0673019  normal  0.240242 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3252  S-adenosylmethionine synthetase  64.89 
 
 
384 aa  528  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0015174  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3661  S-adenosylmethionine synthetase  66.67 
 
 
393 aa  530  1e-149  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.284553  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3099  S-adenosylmethionine synthetase  65.65 
 
 
384 aa  529  1e-149  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1832  S-adenosylmethionine synthetase  64.06 
 
 
422 aa  530  1e-149  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3336  S-adenosylmethionine synthetase  65.14 
 
 
384 aa  529  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.216224  normal  0.254076 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0875  S-adenosylmethionine synthetase  64.38 
 
 
384 aa  530  1e-149  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03161  S-adenosylmethionine synthetase  65.04 
 
 
381 aa  525  1e-148  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.713354  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0780  S-adenosylmethionine synthetase  64.06 
 
 
420 aa  526  1e-148  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000106532  hitchhiker  0.000013186 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3374  S-adenosylmethionine synthetase  65.39 
 
 
384 aa  526  1e-148  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0787  S-adenosylmethionine synthetase  63.87 
 
 
384 aa  526  1e-148  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.451532  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3433  S-adenosylmethionine synthetase  64.89 
 
 
384 aa  526  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00223184 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3729  S-adenosylmethionine synthetase  63.82 
 
 
408 aa  525  1e-148  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.582078  normal  0.310239 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1065  S-adenosylmethionine synthetase  66.41 
 
 
397 aa  521  1e-147  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3346  S-adenosylmethionine synthetase  64.63 
 
 
384 aa  524  1e-147  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.274047  decreased coverage  0.00210424 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0841  S-adenosylmethionine synthetase  64.89 
 
 
384 aa  521  1e-147  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0044  S-adenosylmethionine synthetase  65.23 
 
 
388 aa  521  1e-147  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000084119  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>