More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_3549 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_0160  S-adenosylmethionine synthetase  76.54 
 
 
405 aa  650    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.754463  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3565  S-adenosylmethionine synthetase  97.77 
 
 
403 aa  804    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.814506  normal  0.982729 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0489  S-adenosylmethionine synthetase  76.79 
 
 
405 aa  645    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3549  S-adenosylmethionine synthetase  100 
 
 
403 aa  823    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.642541  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2353  S-adenosylmethionine synthetase  71.53 
 
 
405 aa  595  1e-169  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0686  S-adenosylmethionine synthetase  70.48 
 
 
396 aa  571  1e-161  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000273015  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2251  methionine adenosyltransferase  69.97 
 
 
397 aa  565  1e-160  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000460807  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0445  S-adenosylmethionine synthetase  67.85 
 
 
395 aa  558  1e-158  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000309499  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2777  S-adenosylmethionine synthetase  67.84 
 
 
403 aa  558  1e-158  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000102854  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2574  S-adenosylmethionine synthetase  67.94 
 
 
395 aa  549  1e-155  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0485425  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0659  S-adenosylmethionine synthetase  67.34 
 
 
403 aa  550  1e-155  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3437  S-adenosylmethionine synthetase  67 
 
 
399 aa  547  1e-154  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.109386  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4914  S-adenosylmethionine synthetase  66.75 
 
 
399 aa  541  1e-153  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.11754  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4877  S-adenosylmethionine synthetase  66.75 
 
 
399 aa  542  1e-153  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000842328  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1186  S-adenosylmethionine synthetase  65.19 
 
 
414 aa  543  1e-153  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0363  S-adenosylmethionine synthetase  66.75 
 
 
399 aa  541  1e-153  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000052915  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4660  S-adenosylmethionine synthetase  66.5 
 
 
399 aa  540  9.999999999999999e-153  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4500  S-adenosylmethionine synthetase  66.5 
 
 
399 aa  540  9.999999999999999e-153  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4517  S-adenosylmethionine synthetase  66.5 
 
 
399 aa  540  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.536795  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5017  S-adenosylmethionine synthetase  66.5 
 
 
399 aa  540  9.999999999999999e-153  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00446313  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4904  S-adenosylmethionine synthetase  66.5 
 
 
399 aa  540  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000363625  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4886  S-adenosylmethionine synthetase  66.5 
 
 
399 aa  540  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4594  S-adenosylmethionine synthetase  66.25 
 
 
399 aa  538  9.999999999999999e-153  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.791965  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3874  methionine adenosyltransferase  65.31 
 
 
396 aa  535  1e-151  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000696498  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2435  S-adenosylmethionine synthetase  68.21 
 
 
391 aa  537  1e-151  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2145  S-adenosylmethionine synthetase  68.21 
 
 
391 aa  537  1e-151  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0087  S-adenosylmethionine synthetase  65.82 
 
 
396 aa  534  1e-150  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000221578  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3891  S-adenosylmethionine synthetase  65.56 
 
 
396 aa  530  1e-149  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00109689  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3096  methionine adenosyltransferase  65.32 
 
 
397 aa  522  1e-147  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0894  S-adenosylmethionine synthetase  64.72 
 
 
395 aa  522  1e-147  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000969915  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1171  S-adenosylmethionine synthetase  62.53 
 
 
395 aa  520  1e-146  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000972386  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1133  S-adenosylmethionine synthetase  62.53 
 
 
395 aa  520  1e-146  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000111198  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09860  Methionine adenosyltransferase  63.27 
 
 
402 aa  520  1e-146  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3124  S-adenosylmethionine synthetase  66.75 
 
 
398 aa  519  1e-146  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.110006  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_453  S-adenosylmethionine synthetase  61.56 
 
 
406 aa  516  1.0000000000000001e-145  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00689475  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0512  S-adenosylmethionine synthetase  61.56 
 
 
406 aa  514  1.0000000000000001e-145  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.128804  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1071  S-adenosylmethionine synthetase  64.78 
 
 
393 aa  518  1.0000000000000001e-145  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0298396  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0488  S-adenosylmethionine synthetase  61.56 
 
 
406 aa  515  1.0000000000000001e-145  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.227197  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2330  methionine adenosyltransferase  62.66 
 
 
396 aa  512  1e-144  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15650  methionine adenosyltransferase  66.08 
 
 
400 aa  511  1e-143  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.148398  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1234  S-adenosylmethionine synthetase  62.78 
 
 
396 aa  509  1e-143  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0170314  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2084  methionine adenosyltransferase  64.71 
 
 
395 aa  507  9.999999999999999e-143  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.191002  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1725  S-adenosylmethionine synthetase  61.46 
 
 
402 aa  505  9.999999999999999e-143  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.710096  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0831  S-adenosylmethionine synthetase  62.76 
 
 
398 aa  507  9.999999999999999e-143  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3103  S-adenosylmethionine synthetase  64.48 
 
 
401 aa  505  9.999999999999999e-143  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0169073  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0125  S-adenosylmethionine synthetase  63.13 
 
 
396 aa  507  9.999999999999999e-143  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00105717  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0660  S-adenosylmethionine synthetase  61.9 
 
 
402 aa  506  9.999999999999999e-143  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000409512  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2575  S-adenosylmethionine synthetase  62.99 
 
 
407 aa  504  1e-141  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.136519  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3981  S-adenosylmethionine synthetase  61.52 
 
 
396 aa  501  1e-141  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000348916  hitchhiker  0.00000146833 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2348  S-adenosylmethionine synthetase  64.99 
 
 
403 aa  501  1e-141  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.233249  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27040  methionine adenosyltransferase  65.9 
 
 
399 aa  503  1e-141  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.593252  normal  0.387061 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1135  S-adenosylmethionine synthetase  61.68 
 
 
397 aa  503  1e-141  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1841  S-adenosylmethionine synthetase  60.71 
 
 
398 aa  501  1e-140  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1756  S-adenosylmethionine synthetase  62.09 
 
 
395 aa  499  1e-140  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000785421  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1877  S-adenosylmethionine synthetase  60.71 
 
 
398 aa  501  1e-140  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4159  S-adenosylmethionine synthetase  63.87 
 
 
397 aa  496  1e-139  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0297831  normal  0.258747 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5235  S-adenosylmethionine synthetase  65.54 
 
 
400 aa  495  1e-139  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1716  S-adenosylmethionine synthetase  64.19 
 
 
398 aa  495  1e-139  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.123594  hitchhiker  0.00797673 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2161  S-adenosylmethionine synthetase  62.18 
 
 
399 aa  494  1e-139  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0139  S-adenosylmethionine synthetase  63.64 
 
 
389 aa  492  9.999999999999999e-139  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3004  S-adenosylmethionine synthetase  63.38 
 
 
397 aa  493  9.999999999999999e-139  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000578039  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1296  S-adenosylmethionine synthetase  61.42 
 
 
395 aa  493  9.999999999999999e-139  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0081249  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1864  S-adenosylmethionine synthetase  64.48 
 
 
399 aa  493  9.999999999999999e-139  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0456  S-adenosylmethionine synthetase  61.11 
 
 
402 aa  491  9.999999999999999e-139  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000025014  normal  0.132712 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1857  S-adenosylmethionine synthetase  64.23 
 
 
399 aa  488  1e-137  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.41268  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1065  S-adenosylmethionine synthetase  64.05 
 
 
397 aa  490  1e-137  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5342  S-adenosylmethionine synthetase  63.04 
 
 
399 aa  488  1e-137  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.339579  normal  0.683287 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3192  S-adenosylmethionine synthetase  63.68 
 
 
398 aa  489  1e-137  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.000568371  normal  0.539174 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1290  S-adenosylmethionine synthetase  63.38 
 
 
417 aa  488  1e-137  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.134908  normal  0.0680854 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3737  S-adenosylmethionine synthetase  61.94 
 
 
402 aa  485  1e-136  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.193212 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11421  S-adenosylmethionine synthetase  61.69 
 
 
403 aa  485  1e-136  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0291702  normal  0.38734 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2262  S-adenosylmethionine synthetase  62.6 
 
 
385 aa  485  1e-136  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0646  S-adenosylmethionine synthetase  62.69 
 
 
383 aa  484  1e-136  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00167645  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0871  S-adenosylmethionine synthetase  61.93 
 
 
383 aa  486  1e-136  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3161  S-adenosylmethionine synthetase  63.71 
 
 
396 aa  485  1e-136  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.153387  hitchhiker  0.00000474907 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3094  S-adenosylmethionine synthetase  63.29 
 
 
397 aa  484  1e-135  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0289909  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1363  S-adenosylmethionine synthetase  62.37 
 
 
395 aa  482  1e-135  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.176558  normal  0.04012 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18060  methionine adenosyltransferase  62.72 
 
 
397 aa  481  1e-135  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0593613  normal  0.705478 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0929  S-adenosylmethionine synthetase  61.42 
 
 
383 aa  481  1e-135  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3336  S-adenosylmethionine synthetase  62.18 
 
 
384 aa  483  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.216224  normal  0.254076 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3252  S-adenosylmethionine synthetase  61.93 
 
 
384 aa  482  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0015174  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3263  S-adenosylmethionine synthetase  62.18 
 
 
384 aa  483  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0673019  normal  0.240242 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12520  methionine adenosyltransferase  62.53 
 
 
420 aa  481  1e-135  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.260949  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1082  S-adenosylmethionine synthetase  62.44 
 
 
383 aa  481  1e-135  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0507835  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3331  S-adenosylmethionine synthetase  61.93 
 
 
383 aa  483  1e-135  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.175486  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0772  S-adenosylmethionine synthetase  61.68 
 
 
383 aa  483  1e-135  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3251  S-adenosylmethionine synthetase  61.68 
 
 
383 aa  483  1e-135  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3354  S-adenosylmethionine synthetase  61.68 
 
 
383 aa  483  1e-135  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3328  S-adenosylmethionine synthetase  62.18 
 
 
384 aa  483  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.196348  normal  0.570149 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2818  Methionine adenosyltransferase  62.63 
 
 
395 aa  480  1e-134  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.575493 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1352  S-adenosylmethionine synthetase  59.6 
 
 
399 aa  479  1e-134  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0413  S-adenosylmethionine synthetase  60.25 
 
 
390 aa  479  1e-134  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0737611  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0751  S-adenosylmethionine synthetase  61.93 
 
 
383 aa  481  1e-134  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3541  S-adenosylmethionine synthetase  61.68 
 
 
383 aa  478  1e-134  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3433  S-adenosylmethionine synthetase  61.93 
 
 
384 aa  480  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00223184 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3466  S-adenosylmethionine synthetase  61.68 
 
 
383 aa  478  1e-134  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2670  S-adenosylmethionine synthetase  61.69 
 
 
402 aa  479  1e-134  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.178907  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3660  S-adenosylmethionine synthetase  61.68 
 
 
383 aa  478  1e-134  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.2045 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2414  S-adenosylmethionine synthetase  61.27 
 
 
402 aa  476  1e-133  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.295636  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02735  hypothetical protein  61.42 
 
 
384 aa  476  1e-133  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.457385  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>