More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3874 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012793  GWCH70_2777  S-adenosylmethionine synthetase  76.84 
 
 		 403 aa  652    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000102854  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0659  S-adenosylmethionine synthetase  76.47 
 
 		 403 aa  644    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3874  methionine adenosyltransferase  100 
 
 		 396 aa  817    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000696498  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3437  S-adenosylmethionine synthetase  74.05 
 
 		 399 aa  627  1e-179  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.109386  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0363  S-adenosylmethionine synthetase  74.3 
 
 		 399 aa  625  1e-178  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000052915  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4914  S-adenosylmethionine synthetase  74.05 
 
 		 399 aa  625  1e-178  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.11754  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4877  S-adenosylmethionine synthetase  74.05 
 
 		 399 aa  624  1e-178  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000842328  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4660  S-adenosylmethionine synthetase  73.79 
 
 		 399 aa  624  1e-177  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4500  S-adenosylmethionine synthetase  73.79 
 
 		 399 aa  623  1e-177  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4517  S-adenosylmethionine synthetase  73.79 
 
 		 399 aa  624  1e-177  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.536795  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4886  S-adenosylmethionine synthetase  73.79 
 
 		 399 aa  624  1e-177  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5017  S-adenosylmethionine synthetase  73.79 
 
 		 399 aa  624  1e-177  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00446313  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4594  S-adenosylmethionine synthetase  74.05 
 
 		 399 aa  623  1e-177  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.791965  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4904  S-adenosylmethionine synthetase  73.79 
 
 		 399 aa  623  1e-177  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000363625  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2251  methionine adenosyltransferase  75.06 
 
 		 397 aa  619  1e-176  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000460807  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0686  S-adenosylmethionine synthetase  75.06 
 
 		 396 aa  609  1e-173  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000273015  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0445  S-adenosylmethionine synthetase  73.15 
 
 		 395 aa  607  9.999999999999999e-173  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000309499  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0087  S-adenosylmethionine synthetase  71.43 
 
 		 396 aa  600  1e-170  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000221578  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3891  S-adenosylmethionine synthetase  70.84 
 
 		 396 aa  597  1e-170  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00109689  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1841  S-adenosylmethionine synthetase  70.99 
 
 		 398 aa  592  1e-168  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1877  S-adenosylmethionine synthetase  70.99 
 
 		 398 aa  592  1e-168  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2574  S-adenosylmethionine synthetase  69.54 
 
 		 395 aa  583  1.0000000000000001e-165  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0485425  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2353  S-adenosylmethionine synthetase  69.82 
 
 		 405 aa  580  1e-164  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3096  methionine adenosyltransferase  70.08 
 
 		 397 aa  578  1e-164  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2435  S-adenosylmethionine synthetase  70.48 
 
 		 391 aa  574  1.0000000000000001e-162  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2145  S-adenosylmethionine synthetase  70.48 
 
 		 391 aa  574  1.0000000000000001e-162  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1352  S-adenosylmethionine synthetase  68.29 
 
 		 399 aa  563  1.0000000000000001e-159  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2330  methionine adenosyltransferase  66.75 
 
 		 396 aa  561  1.0000000000000001e-159  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3981  S-adenosylmethionine synthetase  68.21 
 
 		 396 aa  561  1.0000000000000001e-159  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000348916  hitchhiker  0.00000146833 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1071  S-adenosylmethionine synthetase  67.52 
 
 		 393 aa  558  1e-158  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0298396  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0489  S-adenosylmethionine synthetase  67.18 
 
 		 405 aa  558  1e-158  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1234  S-adenosylmethionine synthetase  67.52 
 
 		 396 aa  560  1e-158  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0170314  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0456  S-adenosylmethionine synthetase  66.33 
 
 		 402 aa  559  1e-158  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000025014  normal  0.132712 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0160  S-adenosylmethionine synthetase  66.41 
 
 		 405 aa  558  1e-158  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.754463  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0831  S-adenosylmethionine synthetase  65.4 
 
 		 398 aa  555  1e-157  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0894  S-adenosylmethionine synthetase  65.47 
 
 		 395 aa  556  1e-157  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000969915  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09860  Methionine adenosyltransferase  66.67 
 
 		 402 aa  550  1e-155  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1296  S-adenosylmethionine synthetase  67.68 
 
 		 395 aa  550  1e-155  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0081249  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2161  S-adenosylmethionine synthetase  66.75 
 
 		 399 aa  549  1e-155  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0660  S-adenosylmethionine synthetase  65.06 
 
 		 402 aa  547  1e-154  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000409512  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2084  methionine adenosyltransferase  65.64 
 
 		 395 aa  546  1e-154  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.191002  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3565  S-adenosylmethionine synthetase  65.82 
 
 		 403 aa  540  9.999999999999999e-153  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.814506  normal  0.982729 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0125  S-adenosylmethionine synthetase  64.62 
 
 		 396 aa  540  9.999999999999999e-153  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00105717  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1186  S-adenosylmethionine synthetase  65.23 
 
 		 414 aa  538  9.999999999999999e-153  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1135  S-adenosylmethionine synthetase  64.38 
 
 		 397 aa  540  9.999999999999999e-153  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1133  S-adenosylmethionine synthetase  64.71 
 
 		 395 aa  536  1e-151  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000111198  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3549  S-adenosylmethionine synthetase  65.31 
 
 		 403 aa  535  1e-151  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.642541  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1171  S-adenosylmethionine synthetase  64.71 
 
 		 395 aa  536  1e-151  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000972386  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0512  S-adenosylmethionine synthetase  63.17 
 
 		 406 aa  533  1e-150  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.128804  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1725  S-adenosylmethionine synthetase  62.5 
 
 		 402 aa  533  1e-150  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.710096  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_453  S-adenosylmethionine synthetase  62.5 
 
 		 406 aa  531  1e-150  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00689475  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0488  S-adenosylmethionine synthetase  62.5 
 
 		 406 aa  530  1e-149  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.227197  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1082  S-adenosylmethionine synthetase  66.92 
 
 		 383 aa  528  1e-149  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0507835  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0646  S-adenosylmethionine synthetase  66.41 
 
 		 383 aa  528  1e-149  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00167645  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0533  S-adenosylmethionine synthetase  64.56 
 
 		 393 aa  525  1e-148  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000146797  normal  0.123305 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4320  methionine adenosyltransferase  62.44 
 
 		 387 aa  525  1e-148  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.238534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1756  S-adenosylmethionine synthetase  62.94 
 
 		 395 aa  527  1e-148  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000785421  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0871  S-adenosylmethionine synthetase  65.64 
 
 		 383 aa  524  1e-148  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2760  S-adenosylmethionine synthetase  65.9 
 
 		 383 aa  525  1e-148  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0929  S-adenosylmethionine synthetase  65.13 
 
 		 383 aa  521  1e-147  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1383  methionine adenosyltransferase  61.81 
 
 		 401 aa  521  1e-147  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3660  S-adenosylmethionine synthetase  66.15 
 
 		 383 aa  523  1e-147  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.2045 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3346  S-adenosylmethionine synthetase  65.13 
 
 		 384 aa  521  1e-147  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.274047  decreased coverage  0.00210424 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0826  S-adenosylmethionine synthetase  66.15 
 
 		 383 aa  522  1e-147  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.232254  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3466  S-adenosylmethionine synthetase  66.15 
 
 		 383 aa  523  1e-147  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0772  S-adenosylmethionine synthetase  65.38 
 
 		 383 aa  523  1e-147  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3251  S-adenosylmethionine synthetase  65.38 
 
 		 383 aa  523  1e-147  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0751  S-adenosylmethionine synthetase  66.15 
 
 		 383 aa  524  1e-147  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3354  S-adenosylmethionine synthetase  65.38 
 
 		 383 aa  523  1e-147  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3541  S-adenosylmethionine synthetase  66.15 
 
 		 383 aa  523  1e-147  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0413  S-adenosylmethionine synthetase  63.66 
 
 		 390 aa  523  1e-147  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0737611  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02772  S-adenosylmethionine synthetase  64.87 
 
 		 384 aa  520  1e-146  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.374196  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0753  Non-specific protein-tyrosine kinase  64.87 
 
 		 384 aa  520  1e-146  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3099  S-adenosylmethionine synthetase  64.87 
 
 		 384 aa  520  1e-146  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4244  S-adenosylmethionine synthetase  64.87 
 
 		 384 aa  520  1e-146  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.908743  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3374  S-adenosylmethionine synthetase  64.62 
 
 		 384 aa  518  1e-146  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3433  S-adenosylmethionine synthetase  64.62 
 
 		 384 aa  518  1e-146  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00223184 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3084  S-adenosylmethionine synthetase  64.87 
 
 		 384 aa  520  1e-146  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.383726  hitchhiker  0.000161028 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02735  hypothetical protein  64.87 
 
 		 384 aa  520  1e-146  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.457385  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3263  S-adenosylmethionine synthetase  64.87 
 
 		 384 aa  520  1e-146  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0673019  normal  0.240242 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3328  S-adenosylmethionine synthetase  64.87 
 
 		 384 aa  520  1e-146  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.196348  normal  0.570149 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3336  S-adenosylmethionine synthetase  64.87 
 
 		 384 aa  520  1e-146  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.216224  normal  0.254076 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3284  S-adenosylmethionine synthetase  64.87 
 
 		 384 aa  520  1e-146  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0772  S-adenosylmethionine synthetase  64.87 
 
 		 384 aa  520  1e-146  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0501612  hitchhiker  0.00139149 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3252  S-adenosylmethionine synthetase  64.62 
 
 		 384 aa  519  1e-146  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0015174  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0873  S-adenosylmethionine synthetase  65.38 
 
 		 383 aa  517  1.0000000000000001e-145  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03161  S-adenosylmethionine synthetase  64.19 
 
 		 381 aa  515  1.0000000000000001e-145  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.713354  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0875  S-adenosylmethionine synthetase  63.85 
 
 		 384 aa  517  1.0000000000000001e-145  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3661  S-adenosylmethionine synthetase  64.38 
 
 		 393 aa  516  1.0000000000000001e-145  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.284553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0787  S-adenosylmethionine synthetase  64.1 
 
 		 384 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.451532  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4132  S-adenosylmethionine synthetase  61.26 
 
 		 421 aa  514  1.0000000000000001e-145  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000371992  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0843  S-adenosylmethionine synthetase  63.59 
 
 		 384 aa  511  1e-144  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000750109  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3347  S-adenosylmethionine synthetase  63.59 
 
 		 384 aa  511  1e-144  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0841  S-adenosylmethionine synthetase  63.59 
 
 		 384 aa  511  1e-144  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0139  S-adenosylmethionine synthetase  61.93 
 
 		 389 aa  508  1e-143  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3974  S-adenosylmethionine synthetase  63.85 
 
 		 384 aa  510  1e-143  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2521  S-adenosylmethionine synthetase  61.07 
 
 		 388 aa  508  1e-143  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.53813 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2463  S-adenosylmethionine synthetase  59.85 
 
 		 417 aa  508  1e-143  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.328764  hitchhiker  0.00000000000157811 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2894  S-adenosylmethionine synthetase  62.37 
 
 		 391 aa  508  1e-143  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2262  S-adenosylmethionine synthetase  61.89 
 
 		 385 aa  510  1e-143  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>