More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3094 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_1857  S-adenosylmethionine synthetase  78.95 
 
 		 399 aa  641    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.41268  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1363  S-adenosylmethionine synthetase  79.29 
 
 		 395 aa  642    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.176558  normal  0.04012 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1065  S-adenosylmethionine synthetase  83.88 
 
 		 397 aa  680    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2818  Methionine adenosyltransferase  80.56 
 
 		 395 aa  652    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.575493 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3094  S-adenosylmethionine synthetase  100 
 
 		 397 aa  806    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0289909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1864  S-adenosylmethionine synthetase  78.7 
 
 		 399 aa  640    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3004  S-adenosylmethionine synthetase  81.82 
 
 		 397 aa  663    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000578039  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5342  S-adenosylmethionine synthetase  76.9 
 
 		 399 aa  627  1e-179  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.339579  normal  0.683287 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1716  S-adenosylmethionine synthetase  76.52 
 
 		 398 aa  617  1e-176  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.123594  hitchhiker  0.00797673 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15650  methionine adenosyltransferase  75.25 
 
 		 400 aa  611  9.999999999999999e-175  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.148398  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3161  S-adenosylmethionine synthetase  75 
 
 		 396 aa  612  9.999999999999999e-175  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.153387  hitchhiker  0.00000474907 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2575  S-adenosylmethionine synthetase  74.37 
 
 		 407 aa  604  9.999999999999999e-173  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.136519  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4159  S-adenosylmethionine synthetase  74.24 
 
 		 397 aa  605  9.999999999999999e-173  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0297831  normal  0.258747 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3192  S-adenosylmethionine synthetase  75.76 
 
 		 398 aa  607  9.999999999999999e-173  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.000568371  normal  0.539174 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27040  methionine adenosyltransferase  76.17 
 
 		 399 aa  606  9.999999999999999e-173  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.593252  normal  0.387061 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3124  S-adenosylmethionine synthetase  76.07 
 
 		 398 aa  607  9.999999999999999e-173  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.110006  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3103  S-adenosylmethionine synthetase  74.06 
 
 		 401 aa  603  1.0000000000000001e-171  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0169073  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1290  S-adenosylmethionine synthetase  75.25 
 
 		 417 aa  603  1.0000000000000001e-171  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.134908  normal  0.0680854 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5235  S-adenosylmethionine synthetase  75.65 
 
 		 400 aa  599  1e-170  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2348  S-adenosylmethionine synthetase  72.36 
 
 		 403 aa  591  1e-168  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.233249  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2989  Methionine adenosyltransferase  74.42 
 
 		 399 aa  593  1e-168  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.757819 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2993  S-adenosylmethionine synthetase  73.07 
 
 		 401 aa  588  1e-167  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.285331 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2414  S-adenosylmethionine synthetase  70.65 
 
 		 402 aa  575  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.295636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2373  S-adenosylmethionine synthetase  70.65 
 
 		 402 aa  575  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2420  S-adenosylmethionine synthetase  70.65 
 
 		 402 aa  575  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.219199 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3737  S-adenosylmethionine synthetase  70.85 
 
 		 402 aa  569  1e-161  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.193212 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2439  S-adenosylmethionine synthetase  73.06 
 
 		 396 aa  566  1e-160  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.523841  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18060  methionine adenosyltransferase  71.65 
 
 		 397 aa  562  1.0000000000000001e-159  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0593613  normal  0.705478 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2670  S-adenosylmethionine synthetase  69.85 
 
 		 402 aa  561  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.178907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11421  S-adenosylmethionine synthetase  70.89 
 
 		 403 aa  564  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0291702  normal  0.38734 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1315  S-adenosylmethionine synthetase  67.86 
 
 		 398 aa  546  1e-154  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.119396  normal  0.284127 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1853  S-adenosylmethionine synthetase  70.3 
 
 		 399 aa  546  1e-154  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0451389  normal  0.42131 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1718  S-adenosylmethionine synthetase  70.57 
 
 		 400 aa  542  1e-153  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.388889  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2256  S-adenosylmethionine synthetase  66.92 
 
 		 411 aa  533  1e-150  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0616987  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12750  methionine adenosyltransferase  67.08 
 
 		 405 aa  528  1e-149  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0223394 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2045  S-adenosylmethionine synthetase  67.84 
 
 		 407 aa  524  1e-147  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00317671 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1993  S-adenosylmethionine synthetase  65.91 
 
 		 411 aa  519  1e-146  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000306332 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14830  methionine adenosyltransferase  66.07 
 
 		 402 aa  512  1e-144  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.000117882  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2251  methionine adenosyltransferase  63.96 
 
 		 397 aa  510  1e-143  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000460807  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0087  S-adenosylmethionine synthetase  62.97 
 
 		 396 aa  508  1e-143  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000221578  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1692  S-adenosylmethionine synthetase  65.9 
 
 		 397 aa  507  9.999999999999999e-143  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.753186  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0445  S-adenosylmethionine synthetase  63.8 
 
 		 395 aa  501  1e-141  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000309499  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3096  methionine adenosyltransferase  63.98 
 
 		 397 aa  504  1e-141  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0659  S-adenosylmethionine synthetase  64.89 
 
 		 403 aa  502  1e-141  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12520  methionine adenosyltransferase  64.9 
 
 		 420 aa  504  1e-141  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.260949  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1171  S-adenosylmethionine synthetase  63.94 
 
 		 395 aa  501  1e-141  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000972386  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1133  S-adenosylmethionine synthetase  63.94 
 
 		 395 aa  501  1e-141  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000111198  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2777  S-adenosylmethionine synthetase  64.12 
 
 		 403 aa  501  1e-140  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000102854  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4500  S-adenosylmethionine synthetase  63.64 
 
 		 399 aa  495  1e-139  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09860  Methionine adenosyltransferase  62.69 
 
 		 402 aa  496  1e-139  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1756  S-adenosylmethionine synthetase  62.88 
 
 		 395 aa  495  1e-139  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000785421  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0686  S-adenosylmethionine synthetase  62.56 
 
 		 396 aa  496  1e-139  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000273015  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2574  S-adenosylmethionine synthetase  62.85 
 
 		 395 aa  495  1e-139  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0485425  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4904  S-adenosylmethionine synthetase  63.64 
 
 		 399 aa  495  1e-139  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000363625  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0125  S-adenosylmethionine synthetase  61.96 
 
 		 396 aa  496  1e-139  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00105717  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4886  S-adenosylmethionine synthetase  63.38 
 
 		 399 aa  494  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3729  S-adenosylmethionine synthetase  64.19 
 
 		 408 aa  493  9.999999999999999e-139  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.582078  normal  0.310239 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4914  S-adenosylmethionine synthetase  63.13 
 
 		 399 aa  491  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.11754  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4660  S-adenosylmethionine synthetase  63.38 
 
 		 399 aa  494  9.999999999999999e-139  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4517  S-adenosylmethionine synthetase  63.38 
 
 		 399 aa  494  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.536795  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4877  S-adenosylmethionine synthetase  63.38 
 
 		 399 aa  492  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000842328  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5017  S-adenosylmethionine synthetase  63.38 
 
 		 399 aa  494  9.999999999999999e-139  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00446313  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2084  methionine adenosyltransferase  63.36 
 
 		 395 aa  493  9.999999999999999e-139  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.191002  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1071  S-adenosylmethionine synthetase  64.29 
 
 		 393 aa  492  9.999999999999999e-139  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0298396  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2330  methionine adenosyltransferase  60.55 
 
 		 396 aa  489  1e-137  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0363  S-adenosylmethionine synthetase  63.13 
 
 		 399 aa  491  1e-137  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000052915  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1234  S-adenosylmethionine synthetase  62.22 
 
 		 396 aa  489  1e-137  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0170314  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3437  S-adenosylmethionine synthetase  63.22 
 
 		 399 aa  488  1e-137  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.109386  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3981  S-adenosylmethionine synthetase  62.47 
 
 		 396 aa  486  1e-136  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000348916  hitchhiker  0.00000146833 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3565  S-adenosylmethionine synthetase  62.53 
 
 		 403 aa  484  1e-136  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.814506  normal  0.982729 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4594  S-adenosylmethionine synthetase  62.72 
 
 		 399 aa  488  1e-136  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.791965  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3549  S-adenosylmethionine synthetase  63.29 
 
 		 403 aa  484  1e-135  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.642541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1841  S-adenosylmethionine synthetase  60.76 
 
 		 398 aa  478  1e-134  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0489  S-adenosylmethionine synthetase  62.22 
 
 		 405 aa  480  1e-134  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1877  S-adenosylmethionine synthetase  60.76 
 
 		 398 aa  478  1e-134  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3891  S-adenosylmethionine synthetase  61.21 
 
 		 396 aa  480  1e-134  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00109689  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0160  S-adenosylmethionine synthetase  61.21 
 
 		 405 aa  476  1e-133  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.754463  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2642  S-adenosylmethionine synthetase  60.81 
 
 		 391 aa  475  1e-133  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0894  S-adenosylmethionine synthetase  59.09 
 
 		 395 aa  476  1e-133  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000969915  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1470  S-adenosylmethionine synthetase  63.27 
 
 		 412 aa  476  1e-133  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0274097  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0456  S-adenosylmethionine synthetase  59.75 
 
 		 402 aa  471  1e-132  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000025014  normal  0.132712 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3874  methionine adenosyltransferase  59.19 
 
 		 396 aa  473  1e-132  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000696498  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0831  S-adenosylmethionine synthetase  58.84 
 
 		 398 aa  469  1.0000000000000001e-131  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1306  S-adenosylmethionine synthetase  61.78 
 
 		 421 aa  468  1.0000000000000001e-131  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.883498  normal  0.454571 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1383  methionine adenosyltransferase  57.96 
 
 		 401 aa  468  1.0000000000000001e-131  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0660  S-adenosylmethionine synthetase  60.66 
 
 		 402 aa  466  9.999999999999999e-131  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000409512  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4357  S-adenosylmethionine synthetase  62.38 
 
 		 410 aa  465  9.999999999999999e-131  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.808224  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1290  S-adenosylmethionine synthetase  60.61 
 
 		 389 aa  467  9.999999999999999e-131  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.00000000000000134106  hitchhiker  0.0000021958 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3116  S-adenosylmethionine synthetase  59.8 
 
 		 391 aa  466  9.999999999999999e-131  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.292647 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0349  S-adenosylmethionine synthetase  60.15 
 
 		 388 aa  465  9.999999999999999e-131  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000664302  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2435  S-adenosylmethionine synthetase  60.56 
 
 		 391 aa  467  9.999999999999999e-131  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2145  S-adenosylmethionine synthetase  60.56 
 
 		 391 aa  467  9.999999999999999e-131  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1186  S-adenosylmethionine synthetase  60.15 
 
 		 414 aa  466  9.999999999999999e-131  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1135  S-adenosylmethionine synthetase  59.34 
 
 		 397 aa  466  9.999999999999999e-131  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0044  S-adenosylmethionine synthetase  60.1 
 
 		 388 aa  466  9.999999999999999e-131  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000084119  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1880  S-adenosylmethionine synthetase  60.65 
 
 		 387 aa  463  1e-129  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000337587  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1341  S-adenosylmethionine synthetase  60.35 
 
 		 389 aa  464  1e-129  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000125757  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1821  S-adenosylmethionine synthetase  59.6 
 
 		 385 aa  462  1e-129  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0267535  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2943  S-adenosylmethionine synthetase  60.35 
 
 		 389 aa  464  1e-129  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2521  S-adenosylmethionine synthetase  60.2 
 
 		 388 aa  460  9.999999999999999e-129  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.53813 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>