More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0456 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_0456  S-adenosylmethionine synthetase  100 
 
 		 402 aa  824    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000025014  normal  0.132712 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2777  S-adenosylmethionine synthetase  69.9 
 
 		 403 aa  592  1e-168  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000102854  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0659  S-adenosylmethionine synthetase  70.63 
 
 		 403 aa  586  1e-166  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4914  S-adenosylmethionine synthetase  71.14 
 
 		 399 aa  579  1e-164  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.11754  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4904  S-adenosylmethionine synthetase  71.14 
 
 		 399 aa  578  1e-164  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000363625  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4660  S-adenosylmethionine synthetase  71.14 
 
 		 399 aa  579  1e-164  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4500  S-adenosylmethionine synthetase  71.14 
 
 		 399 aa  578  1e-164  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4517  S-adenosylmethionine synthetase  71.14 
 
 		 399 aa  579  1e-164  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.536795  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4886  S-adenosylmethionine synthetase  71.14 
 
 		 399 aa  579  1e-164  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5017  S-adenosylmethionine synthetase  71.14 
 
 		 399 aa  579  1e-164  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00446313  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3437  S-adenosylmethionine synthetase  70.63 
 
 		 399 aa  580  1e-164  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.109386  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4877  S-adenosylmethionine synthetase  71.14 
 
 		 399 aa  580  1e-164  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000842328  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0363  S-adenosylmethionine synthetase  71.14 
 
 		 399 aa  579  1e-164  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000052915  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4594  S-adenosylmethionine synthetase  71.14 
 
 		 399 aa  577  1.0000000000000001e-163  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.791965  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1135  S-adenosylmethionine synthetase  71.32 
 
 		 397 aa  577  1.0000000000000001e-163  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0831  S-adenosylmethionine synthetase  70.63 
 
 		 398 aa  572  1.0000000000000001e-162  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2574  S-adenosylmethionine synthetase  70.15 
 
 		 395 aa  568  1e-161  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0485425  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3981  S-adenosylmethionine synthetase  70.26 
 
 		 396 aa  564  1.0000000000000001e-159  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000348916  hitchhiker  0.00000146833 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2251  methionine adenosyltransferase  68.8 
 
 		 397 aa  558  1e-158  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000460807  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3874  methionine adenosyltransferase  66.33 
 
 		 396 aa  559  1e-158  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000696498  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3096  methionine adenosyltransferase  68.72 
 
 		 397 aa  555  1e-157  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3891  S-adenosylmethionine synthetase  67.52 
 
 		 396 aa  556  1e-157  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00109689  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1296  S-adenosylmethionine synthetase  70.15 
 
 		 395 aa  551  1e-156  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0081249  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0686  S-adenosylmethionine synthetase  68.37 
 
 		 396 aa  548  1e-155  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000273015  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2161  S-adenosylmethionine synthetase  70.15 
 
 		 399 aa  548  1e-155  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0445  S-adenosylmethionine synthetase  67.26 
 
 		 395 aa  543  1e-153  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000309499  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1877  S-adenosylmethionine synthetase  66.5 
 
 		 398 aa  540  9.999999999999999e-153  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2330  methionine adenosyltransferase  65.13 
 
 		 396 aa  539  9.999999999999999e-153  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1841  S-adenosylmethionine synthetase  66.5 
 
 		 398 aa  540  9.999999999999999e-153  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0087  S-adenosylmethionine synthetase  65.98 
 
 		 396 aa  536  1e-151  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000221578  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1071  S-adenosylmethionine synthetase  67.77 
 
 		 393 aa  534  1e-151  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0298396  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1352  S-adenosylmethionine synthetase  65.99 
 
 		 399 aa  527  1e-148  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0894  S-adenosylmethionine synthetase  64.1 
 
 		 395 aa  523  1e-147  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000969915  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0533  S-adenosylmethionine synthetase  63.52 
 
 		 393 aa  521  1e-146  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000146797  normal  0.123305 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2435  S-adenosylmethionine synthetase  66.16 
 
 		 391 aa  520  1e-146  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2145  S-adenosylmethionine synthetase  66.16 
 
 		 391 aa  520  1e-146  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2353  S-adenosylmethionine synthetase  63.54 
 
 		 405 aa  519  1e-146  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09860  Methionine adenosyltransferase  65.38 
 
 		 402 aa  514  1.0000000000000001e-145  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1171  S-adenosylmethionine synthetase  63.43 
 
 		 395 aa  517  1.0000000000000001e-145  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000972386  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1133  S-adenosylmethionine synthetase  63.43 
 
 		 395 aa  517  1.0000000000000001e-145  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000111198  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0125  S-adenosylmethionine synthetase  63.08 
 
 		 396 aa  513  1e-144  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00105717  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2084  methionine adenosyltransferase  64.36 
 
 		 395 aa  511  1e-143  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.191002  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1725  S-adenosylmethionine synthetase  61.17 
 
 		 402 aa  504  9.999999999999999e-143  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.710096  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0660  S-adenosylmethionine synthetase  62.72 
 
 		 402 aa  505  9.999999999999999e-143  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000409512  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1234  S-adenosylmethionine synthetase  63.94 
 
 		 396 aa  507  9.999999999999999e-143  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0170314  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1756  S-adenosylmethionine synthetase  61.68 
 
 		 395 aa  504  1e-141  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000785421  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0489  S-adenosylmethionine synthetase  61.21 
 
 		 405 aa  502  1e-141  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1186  S-adenosylmethionine synthetase  61.31 
 
 		 414 aa  499  1e-140  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0512  S-adenosylmethionine synthetase  61.03 
 
 		 406 aa  497  1e-139  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.128804  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0160  S-adenosylmethionine synthetase  60.96 
 
 		 405 aa  497  1e-139  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.754463  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0929  S-adenosylmethionine synthetase  62.56 
 
 		 383 aa  496  1e-139  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1383  methionine adenosyltransferase  60.86 
 
 		 401 aa  497  1e-139  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4320  methionine adenosyltransferase  61.48 
 
 		 387 aa  495  1e-139  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.238534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_453  S-adenosylmethionine synthetase  60.26 
 
 		 406 aa  491  9.999999999999999e-139  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00689475  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2642  S-adenosylmethionine synthetase  63.17 
 
 		 391 aa  492  9.999999999999999e-139  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3116  S-adenosylmethionine synthetase  63.85 
 
 		 391 aa  493  9.999999999999999e-139  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.292647 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03161  S-adenosylmethionine synthetase  62.37 
 
 		 381 aa  492  9.999999999999999e-139  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.713354  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3565  S-adenosylmethionine synthetase  61.36 
 
 		 403 aa  493  9.999999999999999e-139  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.814506  normal  0.982729 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0488  S-adenosylmethionine synthetase  60.31 
 
 		 406 aa  494  9.999999999999999e-139  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.227197  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3549  S-adenosylmethionine synthetase  61.11 
 
 		 403 aa  491  9.999999999999999e-139  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.642541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0772  S-adenosylmethionine synthetase  62.31 
 
 		 383 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3251  S-adenosylmethionine synthetase  62.31 
 
 		 383 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0871  S-adenosylmethionine synthetase  61.79 
 
 		 383 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3354  S-adenosylmethionine synthetase  62.31 
 
 		 383 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3541  S-adenosylmethionine synthetase  62.56 
 
 		 383 aa  490  1e-137  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0413  S-adenosylmethionine synthetase  60.81 
 
 		 390 aa  489  1e-137  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0737611  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3660  S-adenosylmethionine synthetase  62.56 
 
 		 383 aa  490  1e-137  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.2045 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0751  S-adenosylmethionine synthetase  62.05 
 
 		 383 aa  489  1e-137  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3466  S-adenosylmethionine synthetase  62.56 
 
 		 383 aa  490  1e-137  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2894  S-adenosylmethionine synthetase  62.21 
 
 		 391 aa  488  1e-137  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0646  S-adenosylmethionine synthetase  62.31 
 
 		 383 aa  488  1e-137  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00167645  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0826  S-adenosylmethionine synthetase  62.31 
 
 		 383 aa  488  1e-137  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.232254  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3336  S-adenosylmethionine synthetase  61.79 
 
 		 384 aa  484  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.216224  normal  0.254076 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0787  S-adenosylmethionine synthetase  61.03 
 
 		 384 aa  484  1e-136  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.451532  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3252  S-adenosylmethionine synthetase  61.54 
 
 		 384 aa  484  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0015174  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3478  S-adenosylmethionine synthetase  59.81 
 
 		 418 aa  485  1e-136  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.575314 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3263  S-adenosylmethionine synthetase  61.79 
 
 		 384 aa  484  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0673019  normal  0.240242 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3331  S-adenosylmethionine synthetase  61.28 
 
 		 383 aa  486  1e-136  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.175486  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4661  S-adenosylmethionine synthetase  58.39 
 
 		 420 aa  485  1e-136  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.778397  decreased coverage  0.00341152 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0044  S-adenosylmethionine synthetase  63.1 
 
 		 388 aa  485  1e-136  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000084119  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2760  S-adenosylmethionine synthetase  61.54 
 
 		 383 aa  488  1e-136  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02772  S-adenosylmethionine synthetase  61.54 
 
 		 384 aa  482  1e-135  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.374196  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0753  Non-specific protein-tyrosine kinase  61.54 
 
 		 384 aa  482  1e-135  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0875  S-adenosylmethionine synthetase  60.77 
 
 		 384 aa  484  1e-135  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0349  S-adenosylmethionine synthetase  63.01 
 
 		 388 aa  481  1e-135  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000664302  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3433  S-adenosylmethionine synthetase  61.54 
 
 		 384 aa  483  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00223184 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3346  S-adenosylmethionine synthetase  61.54 
 
 		 384 aa  481  1e-135  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.274047  decreased coverage  0.00210424 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2131  S-adenosylmethionine synthetase  59.64 
 
 		 393 aa  482  1e-135  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.204435  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0873  S-adenosylmethionine synthetase  60.77 
 
 		 383 aa  483  1e-135  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3284  S-adenosylmethionine synthetase  61.54 
 
 		 384 aa  482  1e-135  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4244  S-adenosylmethionine synthetase  61.54 
 
 		 384 aa  482  1e-135  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.908743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1821  S-adenosylmethionine synthetase  61.34 
 
 		 385 aa  481  1e-135  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0267535  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4132  S-adenosylmethionine synthetase  58.89 
 
 		 421 aa  483  1e-135  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000371992  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0470  S-adenosylmethionine synthetase  61.34 
 
 		 382 aa  483  1e-135  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3084  S-adenosylmethionine synthetase  61.54 
 
 		 384 aa  482  1e-135  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.383726  hitchhiker  0.000161028 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1082  S-adenosylmethionine synthetase  61.28 
 
 		 383 aa  483  1e-135  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0507835  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0053  S-adenosylmethionine synthetase  59.64 
 
 		 393 aa  483  1e-135  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3099  S-adenosylmethionine synthetase  61.54 
 
 		 384 aa  482  1e-135  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02735  hypothetical protein  61.54 
 
 		 384 aa  482  1e-135  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.457385  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0772  S-adenosylmethionine synthetase  61.54 
 
 		 384 aa  482  1e-135  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0501612  hitchhiker  0.00139149 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>