More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1864 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1864  S-adenosylmethionine synthetase  100 
 
 		 399 aa  807    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5342  S-adenosylmethionine synthetase  77.27 
 
 		 399 aa  637    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.339579  normal  0.683287 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3161  S-adenosylmethionine synthetase  82.32 
 
 		 396 aa  671    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.153387  hitchhiker  0.00000474907 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1857  S-adenosylmethionine synthetase  97.99 
 
 		 399 aa  794    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.41268  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3094  S-adenosylmethionine synthetase  78.7 
 
 		 397 aa  640    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0289909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1065  S-adenosylmethionine synthetase  77.19 
 
 		 397 aa  632  1e-180  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3004  S-adenosylmethionine synthetase  75.88 
 
 		 397 aa  630  1e-180  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000578039  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1290  S-adenosylmethionine synthetase  77.14 
 
 		 417 aa  633  1e-180  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.134908  normal  0.0680854 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1363  S-adenosylmethionine synthetase  75.38 
 
 		 395 aa  626  1e-178  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.176558  normal  0.04012 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1716  S-adenosylmethionine synthetase  77.75 
 
 		 398 aa  620  1e-177  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.123594  hitchhiker  0.00797673 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2818  Methionine adenosyltransferase  74.62 
 
 		 395 aa  623  1e-177  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.575493 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3103  S-adenosylmethionine synthetase  76.01 
 
 		 401 aa  611  9.999999999999999e-175  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0169073  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3192  S-adenosylmethionine synthetase  76.2 
 
 		 398 aa  612  9.999999999999999e-175  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.000568371  normal  0.539174 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2989  Methionine adenosyltransferase  76.34 
 
 		 399 aa  610  1e-173  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.757819 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4159  S-adenosylmethionine synthetase  74.87 
 
 		 397 aa  608  1e-173  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0297831  normal  0.258747 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2993  S-adenosylmethionine synthetase  73.32 
 
 		 401 aa  605  9.999999999999999e-173  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.285331 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5235  S-adenosylmethionine synthetase  76.55 
 
 		 400 aa  603  1.0000000000000001e-171  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2575  S-adenosylmethionine synthetase  73.55 
 
 		 407 aa  602  1.0000000000000001e-171  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.136519  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3124  S-adenosylmethionine synthetase  74.94 
 
 		 398 aa  603  1.0000000000000001e-171  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.110006  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27040  methionine adenosyltransferase  75.52 
 
 		 399 aa  599  1e-170  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.593252  normal  0.387061 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15650  methionine adenosyltransferase  74.62 
 
 		 400 aa  600  1e-170  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.148398  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2348  S-adenosylmethionine synthetase  72.98 
 
 		 403 aa  594  1e-168  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.233249  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2373  S-adenosylmethionine synthetase  71.21 
 
 		 402 aa  577  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2420  S-adenosylmethionine synthetase  71.21 
 
 		 402 aa  577  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.219199 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2414  S-adenosylmethionine synthetase  71.21 
 
 		 402 aa  577  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.295636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11421  S-adenosylmethionine synthetase  71.9 
 
 		 403 aa  572  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0291702  normal  0.38734 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3737  S-adenosylmethionine synthetase  69.95 
 
 		 402 aa  563  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.193212 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18060  methionine adenosyltransferase  71.76 
 
 		 397 aa  559  1e-158  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0593613  normal  0.705478 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2670  S-adenosylmethionine synthetase  69.44 
 
 		 402 aa  560  1e-158  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.178907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2439  S-adenosylmethionine synthetase  72.42 
 
 		 396 aa  556  1e-157  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.523841  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12750  methionine adenosyltransferase  68.56 
 
 		 405 aa  553  1e-156  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0223394 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1718  S-adenosylmethionine synthetase  70.73 
 
 		 400 aa  553  1e-156  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.388889  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1315  S-adenosylmethionine synthetase  68.53 
 
 		 398 aa  546  1e-154  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.119396  normal  0.284127 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1853  S-adenosylmethionine synthetase  70.2 
 
 		 399 aa  544  1e-153  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0451389  normal  0.42131 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2256  S-adenosylmethionine synthetase  68.43 
 
 		 411 aa  538  9.999999999999999e-153  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0616987  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2045  S-adenosylmethionine synthetase  68.7 
 
 		 407 aa  531  1e-150  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00317671 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1993  S-adenosylmethionine synthetase  68.69 
 
 		 411 aa  529  1e-149  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000306332 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0087  S-adenosylmethionine synthetase  63.16 
 
 		 396 aa  521  1e-147  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000221578  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1692  S-adenosylmethionine synthetase  66.84 
 
 		 397 aa  523  1e-147  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.753186  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2251  methionine adenosyltransferase  63.57 
 
 		 397 aa  516  1.0000000000000001e-145  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000460807  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12520  methionine adenosyltransferase  66.08 
 
 		 420 aa  512  1e-144  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.260949  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14830  methionine adenosyltransferase  65.39 
 
 		 402 aa  514  1e-144  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.000117882  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0686  S-adenosylmethionine synthetase  63.61 
 
 		 396 aa  509  1e-143  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000273015  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2574  S-adenosylmethionine synthetase  63.8 
 
 		 395 aa  508  9.999999999999999e-143  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0485425  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1071  S-adenosylmethionine synthetase  64.48 
 
 		 393 aa  505  9.999999999999999e-143  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0298396  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3096  methionine adenosyltransferase  62.53 
 
 		 397 aa  505  9.999999999999999e-143  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2777  S-adenosylmethionine synthetase  62.91 
 
 		 403 aa  502  1e-141  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000102854  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3891  S-adenosylmethionine synthetase  63.16 
 
 		 396 aa  502  1e-141  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00109689  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1133  S-adenosylmethionine synthetase  62.56 
 
 		 395 aa  501  1e-140  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000111198  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3565  S-adenosylmethionine synthetase  64.48 
 
 		 403 aa  500  1e-140  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.814506  normal  0.982729 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0445  S-adenosylmethionine synthetase  62.22 
 
 		 395 aa  501  1e-140  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000309499  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1171  S-adenosylmethionine synthetase  62.56 
 
 		 395 aa  501  1e-140  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000972386  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0659  S-adenosylmethionine synthetase  63.16 
 
 		 403 aa  498  1e-140  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3981  S-adenosylmethionine synthetase  61.4 
 
 		 396 aa  495  1e-139  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000348916  hitchhiker  0.00000146833 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0489  S-adenosylmethionine synthetase  63.68 
 
 		 405 aa  496  1e-139  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09860  Methionine adenosyltransferase  61.83 
 
 		 402 aa  497  1e-139  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0160  S-adenosylmethionine synthetase  64.16 
 
 		 405 aa  498  1e-139  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.754463  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1234  S-adenosylmethionine synthetase  62.03 
 
 		 396 aa  497  1e-139  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0170314  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3437  S-adenosylmethionine synthetase  62.56 
 
 		 399 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.109386  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4500  S-adenosylmethionine synthetase  62.56 
 
 		 399 aa  491  9.999999999999999e-139  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0125  S-adenosylmethionine synthetase  61.9 
 
 		 396 aa  492  9.999999999999999e-139  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00105717  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3549  S-adenosylmethionine synthetase  64.48 
 
 		 403 aa  493  9.999999999999999e-139  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.642541  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4904  S-adenosylmethionine synthetase  62.56 
 
 		 399 aa  491  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000363625  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4594  S-adenosylmethionine synthetase  62.31 
 
 		 399 aa  489  1e-137  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.791965  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1756  S-adenosylmethionine synthetase  61.96 
 
 		 395 aa  488  1e-137  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000785421  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4914  S-adenosylmethionine synthetase  62.31 
 
 		 399 aa  490  1e-137  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.11754  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4660  S-adenosylmethionine synthetase  62.31 
 
 		 399 aa  489  1e-137  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4517  S-adenosylmethionine synthetase  62.31 
 
 		 399 aa  489  1e-137  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.536795  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0363  S-adenosylmethionine synthetase  62.06 
 
 		 399 aa  488  1e-137  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000052915  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4877  S-adenosylmethionine synthetase  62.31 
 
 		 399 aa  490  1e-137  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000842328  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5017  S-adenosylmethionine synthetase  62.31 
 
 		 399 aa  489  1e-137  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00446313  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2330  methionine adenosyltransferase  60.2 
 
 		 396 aa  491  1e-137  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4886  S-adenosylmethionine synthetase  62.31 
 
 		 399 aa  489  1e-137  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1186  S-adenosylmethionine synthetase  61.9 
 
 		 414 aa  484  1e-136  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2084  methionine adenosyltransferase  60.76 
 
 		 395 aa  481  1e-135  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.191002  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0894  S-adenosylmethionine synthetase  59.8 
 
 		 395 aa  479  1e-134  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000969915  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3729  S-adenosylmethionine synthetase  62.66 
 
 		 408 aa  477  1e-133  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.582078  normal  0.310239 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1877  S-adenosylmethionine synthetase  59.64 
 
 		 398 aa  478  1e-133  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1841  S-adenosylmethionine synthetase  59.64 
 
 		 398 aa  478  1e-133  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2353  S-adenosylmethionine synthetase  61.21 
 
 		 405 aa  474  1e-133  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2435  S-adenosylmethionine synthetase  62.34 
 
 		 391 aa  478  1e-133  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2145  S-adenosylmethionine synthetase  62.34 
 
 		 391 aa  478  1e-133  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1470  S-adenosylmethionine synthetase  64.05 
 
 		 412 aa  474  1e-132  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0274097  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3874  methionine adenosyltransferase  59.09 
 
 		 396 aa  473  1e-132  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000696498  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1352  S-adenosylmethionine synthetase  58.88 
 
 		 399 aa  471  1.0000000000000001e-131  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0501  S-adenosylmethionine synthetase  59.08 
 
 		 420 aa  468  1.0000000000000001e-131  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1306  S-adenosylmethionine synthetase  61.26 
 
 		 421 aa  471  1.0000000000000001e-131  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.883498  normal  0.454571 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2642  S-adenosylmethionine synthetase  58.63 
 
 		 391 aa  469  1.0000000000000001e-131  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0660  S-adenosylmethionine synthetase  60.5 
 
 		 402 aa  469  1.0000000000000001e-131  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000409512  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09870  methionine adenosyltransferase  58.25 
 
 		 420 aa  465  9.999999999999999e-131  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00866848 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0349  S-adenosylmethionine synthetase  60.35 
 
 		 388 aa  464  1e-129  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000664302  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2521  S-adenosylmethionine synthetase  59.14 
 
 		 388 aa  461  1e-129  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.53813 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1290  S-adenosylmethionine synthetase  59.9 
 
 		 389 aa  462  1e-129  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.00000000000000134106  hitchhiker  0.0000021958 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1383  methionine adenosyltransferase  57.67 
 
 		 401 aa  464  1e-129  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4661  S-adenosylmethionine synthetase  55.77 
 
 		 420 aa  462  1e-129  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.778397  decreased coverage  0.00341152 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1725  S-adenosylmethionine synthetase  59.45 
 
 		 402 aa  462  1e-129  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.710096  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1135  S-adenosylmethionine synthetase  57.79 
 
 		 397 aa  464  1e-129  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4132  S-adenosylmethionine synthetase  56.09 
 
 		 421 aa  460  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000371992  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2463  S-adenosylmethionine synthetase  57.04 
 
 		 417 aa  459  9.999999999999999e-129  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.328764  hitchhiker  0.00000000000157811 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1332  S-adenosylmethionine synthetase  59.1 
 
 		 389 aa  461  9.999999999999999e-129  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000124955  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>