More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2251 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003909  BCE_4914  S-adenosylmethionine synthetase  78.63 
 
 		 399 aa  642    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.11754  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4660  S-adenosylmethionine synthetase  78.88 
 
 		 399 aa  645    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4500  S-adenosylmethionine synthetase  78.88 
 
 		 399 aa  644    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4517  S-adenosylmethionine synthetase  78.88 
 
 		 399 aa  645    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.536795  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4886  S-adenosylmethionine synthetase  78.88 
 
 		 399 aa  645    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2251  methionine adenosyltransferase  100 
 
 		 397 aa  813    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000460807  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0363  S-adenosylmethionine synthetase  78.63 
 
 		 399 aa  642    Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000052915  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2574  S-adenosylmethionine synthetase  77.41 
 
 		 395 aa  650    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0485425  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5017  S-adenosylmethionine synthetase  78.88 
 
 		 399 aa  645    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00446313  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4904  S-adenosylmethionine synthetase  78.88 
 
 		 399 aa  644    Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000363625  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4877  S-adenosylmethionine synthetase  78.63 
 
 		 399 aa  642    Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000842328  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3437  S-adenosylmethionine synthetase  79.13 
 
 		 399 aa  649    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.109386  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4594  S-adenosylmethionine synthetase  78.12 
 
 		 399 aa  637    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.791965  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3096  methionine adenosyltransferase  79.44 
 
 		 397 aa  657    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0445  S-adenosylmethionine synthetase  79.59 
 
 		 395 aa  663    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000309499  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3891  S-adenosylmethionine synthetase  78.17 
 
 		 396 aa  653    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00109689  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0659  S-adenosylmethionine synthetase  79.04 
 
 		 403 aa  657    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0686  S-adenosylmethionine synthetase  81.27 
 
 		 396 aa  666    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000273015  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0087  S-adenosylmethionine synthetase  82.99 
 
 		 396 aa  697    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000221578  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2777  S-adenosylmethionine synthetase  79.8 
 
 		 403 aa  666    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000102854  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3981  S-adenosylmethionine synthetase  76.65 
 
 		 396 aa  628  1e-179  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000348916  hitchhiker  0.00000146833 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1071  S-adenosylmethionine synthetase  75.13 
 
 		 393 aa  621  1e-177  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0298396  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2084  methionine adenosyltransferase  74.68 
 
 		 395 aa  618  1e-176  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.191002  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3874  methionine adenosyltransferase  75.06 
 
 		 396 aa  619  1e-176  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000696498  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2435  S-adenosylmethionine synthetase  76.67 
 
 		 391 aa  612  9.999999999999999e-175  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2145  S-adenosylmethionine synthetase  76.67 
 
 		 391 aa  612  9.999999999999999e-175  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0894  S-adenosylmethionine synthetase  72.34 
 
 		 395 aa  607  9.999999999999999e-173  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000969915  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2330  methionine adenosyltransferase  71.07 
 
 		 396 aa  602  1.0000000000000001e-171  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1234  S-adenosylmethionine synthetase  73.1 
 
 		 396 aa  602  1.0000000000000001e-171  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0170314  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09860  Methionine adenosyltransferase  71.39 
 
 		 402 aa  589  1e-167  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0660  S-adenosylmethionine synthetase  69.27 
 
 		 402 aa  582  1.0000000000000001e-165  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000409512  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1877  S-adenosylmethionine synthetase  71.03 
 
 		 398 aa  583  1.0000000000000001e-165  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1841  S-adenosylmethionine synthetase  71.03 
 
 		 398 aa  583  1.0000000000000001e-165  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3565  S-adenosylmethionine synthetase  70.99 
 
 		 403 aa  577  1e-164  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.814506  normal  0.982729 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0831  S-adenosylmethionine synthetase  71.03 
 
 		 398 aa  576  1.0000000000000001e-163  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2353  S-adenosylmethionine synthetase  69.31 
 
 		 405 aa  572  1.0000000000000001e-162  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0160  S-adenosylmethionine synthetase  69.29 
 
 		 405 aa  574  1.0000000000000001e-162  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.754463  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1135  S-adenosylmethionine synthetase  69.37 
 
 		 397 aa  572  1.0000000000000001e-162  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1352  S-adenosylmethionine synthetase  69.23 
 
 		 399 aa  568  1e-161  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0489  S-adenosylmethionine synthetase  68.78 
 
 		 405 aa  565  1e-160  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1133  S-adenosylmethionine synthetase  67.95 
 
 		 395 aa  565  1e-160  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000111198  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1171  S-adenosylmethionine synthetase  67.95 
 
 		 395 aa  565  1e-160  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000972386  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3549  S-adenosylmethionine synthetase  69.97 
 
 		 403 aa  565  1e-160  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.642541  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0512  S-adenosylmethionine synthetase  65.91 
 
 		 406 aa  558  1e-158  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.128804  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_453  S-adenosylmethionine synthetase  65.91 
 
 		 406 aa  560  1e-158  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00689475  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0533  S-adenosylmethionine synthetase  68.19 
 
 		 393 aa  558  1e-158  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000146797  normal  0.123305 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0456  S-adenosylmethionine synthetase  68.8 
 
 		 402 aa  558  1e-158  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000025014  normal  0.132712 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0488  S-adenosylmethionine synthetase  65.66 
 
 		 406 aa  557  1e-157  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.227197  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1725  S-adenosylmethionine synthetase  66.16 
 
 		 402 aa  554  1e-156  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.710096  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0125  S-adenosylmethionine synthetase  67.69 
 
 		 396 aa  553  1e-156  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00105717  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1186  S-adenosylmethionine synthetase  68.1 
 
 		 414 aa  547  1e-154  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1296  S-adenosylmethionine synthetase  68.29 
 
 		 395 aa  544  1e-153  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0081249  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2642  S-adenosylmethionine synthetase  67.69 
 
 		 391 aa  543  1e-153  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1756  S-adenosylmethionine synthetase  67.09 
 
 		 395 aa  540  9.999999999999999e-153  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000785421  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2161  S-adenosylmethionine synthetase  66.58 
 
 		 399 aa  533  1e-150  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3116  S-adenosylmethionine synthetase  65.47 
 
 		 391 aa  529  1e-149  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.292647 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3161  S-adenosylmethionine synthetase  65.39 
 
 		 396 aa  530  1e-149  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.153387  hitchhiker  0.00000474907 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1470  S-adenosylmethionine synthetase  67.51 
 
 		 412 aa  528  1e-149  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0274097  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3729  S-adenosylmethionine synthetase  66.15 
 
 		 408 aa  526  1e-148  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.582078  normal  0.310239 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1383  methionine adenosyltransferase  63.73 
 
 		 401 aa  526  1e-148  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3661  S-adenosylmethionine synthetase  67.94 
 
 		 393 aa  527  1e-148  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.284553  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1290  S-adenosylmethionine synthetase  65.25 
 
 		 417 aa  526  1e-148  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.134908  normal  0.0680854 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02772  S-adenosylmethionine synthetase  64.21 
 
 		 384 aa  521  1e-147  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.374196  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0753  Non-specific protein-tyrosine kinase  64.21 
 
 		 384 aa  521  1e-147  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3284  S-adenosylmethionine synthetase  64.21 
 
 		 384 aa  521  1e-147  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3084  S-adenosylmethionine synthetase  64.21 
 
 		 384 aa  521  1e-147  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.383726  hitchhiker  0.000161028 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1692  S-adenosylmethionine synthetase  64.89 
 
 		 397 aa  523  1e-147  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.753186  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2348  S-adenosylmethionine synthetase  64.82 
 
 		 403 aa  521  1e-147  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.233249  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4132  S-adenosylmethionine synthetase  63.64 
 
 		 421 aa  523  1e-147  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000371992  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02735  hypothetical protein  64.21 
 
 		 384 aa  521  1e-147  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.457385  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3099  S-adenosylmethionine synthetase  64.21 
 
 		 384 aa  521  1e-147  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4244  S-adenosylmethionine synthetase  64.21 
 
 		 384 aa  521  1e-147  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.908743  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0772  S-adenosylmethionine synthetase  64.21 
 
 		 384 aa  521  1e-147  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0501612  hitchhiker  0.00139149 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3478  S-adenosylmethionine synthetase  62.96 
 
 		 418 aa  518  1e-146  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.575314 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3336  S-adenosylmethionine synthetase  63.45 
 
 		 384 aa  518  1e-146  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.216224  normal  0.254076 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1332  S-adenosylmethionine synthetase  65.74 
 
 		 389 aa  520  1e-146  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000124955  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3328  S-adenosylmethionine synthetase  63.45 
 
 		 384 aa  518  1e-146  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.196348  normal  0.570149 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1928  S-adenosylmethionine synthetase  64.47 
 
 		 389 aa  520  1e-146  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.10598e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3124  S-adenosylmethionine synthetase  63.38 
 
 		 398 aa  518  1e-146  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.110006  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3263  S-adenosylmethionine synthetase  63.45 
 
 		 384 aa  518  1e-146  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0673019  normal  0.240242 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2463  S-adenosylmethionine synthetase  62.1 
 
 		 417 aa  519  1e-146  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.328764  hitchhiker  0.00000000000157811 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2943  S-adenosylmethionine synthetase  66.08 
 
 		 389 aa  520  1e-146  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3252  S-adenosylmethionine synthetase  63.2 
 
 		 384 aa  518  1e-146  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0015174  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1716  S-adenosylmethionine synthetase  63.52 
 
 		 398 aa  519  1e-146  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.123594  hitchhiker  0.00797673 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3004  S-adenosylmethionine synthetase  64.38 
 
 		 397 aa  518  1e-146  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000578039  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3374  S-adenosylmethionine synthetase  63.96 
 
 		 384 aa  519  1e-146  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03161  S-adenosylmethionine synthetase  62.15 
 
 		 381 aa  518  1e-146  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.713354  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1341  S-adenosylmethionine synthetase  66.08 
 
 		 389 aa  520  1e-146  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000125757  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1857  S-adenosylmethionine synthetase  63.57 
 
 		 399 aa  516  1.0000000000000001e-145  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.41268  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1363  S-adenosylmethionine synthetase  64.39 
 
 		 395 aa  514  1.0000000000000001e-145  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.176558  normal  0.04012 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3346  S-adenosylmethionine synthetase  63.45 
 
 		 384 aa  515  1.0000000000000001e-145  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.274047  decreased coverage  0.00210424 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3433  S-adenosylmethionine synthetase  63.2 
 
 		 384 aa  516  1.0000000000000001e-145  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00223184 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5342  S-adenosylmethionine synthetase  64.29 
 
 		 399 aa  515  1.0000000000000001e-145  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.339579  normal  0.683287 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3192  S-adenosylmethionine synthetase  63.45 
 
 		 398 aa  517  1.0000000000000001e-145  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.000568371  normal  0.539174 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3331  S-adenosylmethionine synthetase  62.03 
 
 		 383 aa  514  1.0000000000000001e-145  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.175486  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2818  Methionine adenosyltransferase  64.9 
 
 		 395 aa  514  1.0000000000000001e-145  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.575493 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15650  methionine adenosyltransferase  63.2 
 
 		 400 aa  517  1.0000000000000001e-145  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.148398  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27040  methionine adenosyltransferase  64.51 
 
 		 399 aa  517  1.0000000000000001e-145  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.593252  normal  0.387061 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1306  S-adenosylmethionine synthetase  64.22 
 
 		 421 aa  518  1.0000000000000001e-145  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.883498  normal  0.454571 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1864  S-adenosylmethionine synthetase  63.57 
 
 		 399 aa  516  1.0000000000000001e-145  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>