More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4271 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_4271  S-adenosylmethionine synthetase  100 
 
 		 406 aa  834    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.268739  decreased coverage  0.00381419 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3974  S-adenosylmethionine synthetase  65.63 
 
 		 384 aa  520  1e-146  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02772  S-adenosylmethionine synthetase  65.37 
 
 		 384 aa  516  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.374196  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0753  Non-specific protein-tyrosine kinase  65.37 
 
 		 384 aa  516  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3374  S-adenosylmethionine synthetase  65.37 
 
 		 384 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3433  S-adenosylmethionine synthetase  64.86 
 
 		 384 aa  516  1.0000000000000001e-145  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00223184 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3284  S-adenosylmethionine synthetase  65.37 
 
 		 384 aa  516  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0772  S-adenosylmethionine synthetase  65.37 
 
 		 384 aa  516  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0501612  hitchhiker  0.00139149 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3328  S-adenosylmethionine synthetase  65.12 
 
 		 384 aa  516  1.0000000000000001e-145  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.196348  normal  0.570149 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3346  S-adenosylmethionine synthetase  65.37 
 
 		 384 aa  515  1.0000000000000001e-145  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.274047  decreased coverage  0.00210424 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4244  S-adenosylmethionine synthetase  65.37 
 
 		 384 aa  516  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.908743  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02735  hypothetical protein  65.37 
 
 		 384 aa  516  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.457385  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3099  S-adenosylmethionine synthetase  65.37 
 
 		 384 aa  516  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03161  S-adenosylmethionine synthetase  65.1 
 
 		 381 aa  516  1.0000000000000001e-145  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.713354  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3084  S-adenosylmethionine synthetase  65.37 
 
 		 384 aa  516  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.383726  hitchhiker  0.000161028 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3252  S-adenosylmethionine synthetase  64.86 
 
 		 384 aa  517  1.0000000000000001e-145  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0015174  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3336  S-adenosylmethionine synthetase  65.12 
 
 		 384 aa  517  1.0000000000000001e-145  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.216224  normal  0.254076 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3263  S-adenosylmethionine synthetase  65.12 
 
 		 384 aa  517  1.0000000000000001e-145  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0673019  normal  0.240242 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2777  S-adenosylmethionine synthetase  63.33 
 
 		 403 aa  510  1e-143  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000102854  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0843  S-adenosylmethionine synthetase  63.99 
 
 		 384 aa  504  9.999999999999999e-143  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000750109  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3891  S-adenosylmethionine synthetase  61.71 
 
 		 396 aa  506  9.999999999999999e-143  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00109689  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2251  methionine adenosyltransferase  62.69 
 
 		 397 aa  505  9.999999999999999e-143  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000460807  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0751  S-adenosylmethionine synthetase  64.23 
 
 		 383 aa  505  9.999999999999999e-143  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3347  S-adenosylmethionine synthetase  63.99 
 
 		 384 aa  504  9.999999999999999e-143  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1082  S-adenosylmethionine synthetase  64.25 
 
 		 383 aa  505  9.999999999999999e-143  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0507835  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0646  S-adenosylmethionine synthetase  63.73 
 
 		 383 aa  504  9.999999999999999e-143  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00167645  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0871  S-adenosylmethionine synthetase  64.34 
 
 		 383 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0659  S-adenosylmethionine synthetase  63.59 
 
 		 403 aa  507  9.999999999999999e-143  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0841  S-adenosylmethionine synthetase  63.99 
 
 		 384 aa  504  9.999999999999999e-143  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2760  S-adenosylmethionine synthetase  63.73 
 
 		 383 aa  503  1e-141  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0929  S-adenosylmethionine synthetase  64.06 
 
 		 383 aa  501  1e-140  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3466  S-adenosylmethionine synthetase  63.82 
 
 		 383 aa  499  1e-140  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0826  S-adenosylmethionine synthetase  63.82 
 
 		 383 aa  498  1e-140  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.232254  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3660  S-adenosylmethionine synthetase  63.82 
 
 		 383 aa  499  1e-140  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.2045 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3331  S-adenosylmethionine synthetase  62.76 
 
 		 383 aa  499  1e-140  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.175486  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0087  S-adenosylmethionine synthetase  61.06 
 
 		 396 aa  499  1e-140  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000221578  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0772  S-adenosylmethionine synthetase  63.21 
 
 		 383 aa  501  1e-140  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3251  S-adenosylmethionine synthetase  63.21 
 
 		 383 aa  501  1e-140  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3541  S-adenosylmethionine synthetase  63.82 
 
 		 383 aa  499  1e-140  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0873  S-adenosylmethionine synthetase  63.97 
 
 		 383 aa  501  1e-140  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3354  S-adenosylmethionine synthetase  63.21 
 
 		 383 aa  501  1e-140  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1877  S-adenosylmethionine synthetase  60.71 
 
 		 398 aa  495  1e-139  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4914  S-adenosylmethionine synthetase  61.68 
 
 		 399 aa  496  1e-139  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.11754  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4660  S-adenosylmethionine synthetase  61.68 
 
 		 399 aa  496  1e-139  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4517  S-adenosylmethionine synthetase  61.68 
 
 		 399 aa  496  1e-139  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.536795  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0686  S-adenosylmethionine synthetase  62.37 
 
 		 396 aa  496  1e-139  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000273015  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1841  S-adenosylmethionine synthetase  60.71 
 
 		 398 aa  495  1e-139  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5017  S-adenosylmethionine synthetase  61.68 
 
 		 399 aa  496  1e-139  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00446313  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4877  S-adenosylmethionine synthetase  61.42 
 
 		 399 aa  495  1e-139  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000842328  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4886  S-adenosylmethionine synthetase  61.68 
 
 		 399 aa  496  1e-139  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1234  S-adenosylmethionine synthetase  60.96 
 
 		 396 aa  496  1e-139  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0170314  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3437  S-adenosylmethionine synthetase  61.68 
 
 		 399 aa  497  1e-139  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.109386  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0875  S-adenosylmethionine synthetase  61.76 
 
 		 384 aa  496  1e-139  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0044  S-adenosylmethionine synthetase  64.6 
 
 		 388 aa  497  1e-139  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000084119  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4500  S-adenosylmethionine synthetase  61.42 
 
 		 399 aa  494  9.999999999999999e-139  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2574  S-adenosylmethionine synthetase  62.02 
 
 		 395 aa  494  9.999999999999999e-139  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0485425  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1071  S-adenosylmethionine synthetase  60.97 
 
 		 393 aa  492  9.999999999999999e-139  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0298396  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1821  S-adenosylmethionine synthetase  61.4 
 
 		 385 aa  492  9.999999999999999e-139  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0267535  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0413  S-adenosylmethionine synthetase  61.26 
 
 		 390 aa  493  9.999999999999999e-139  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0737611  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09860  Methionine adenosyltransferase  60.15 
 
 		 402 aa  492  9.999999999999999e-139  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4904  S-adenosylmethionine synthetase  61.42 
 
 		 399 aa  494  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000363625  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0363  S-adenosylmethionine synthetase  61.17 
 
 		 399 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000052915  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2262  S-adenosylmethionine synthetase  62.27 
 
 		 385 aa  493  9.999999999999999e-139  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0445  S-adenosylmethionine synthetase  60.66 
 
 		 395 aa  493  9.999999999999999e-139  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000309499  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3874  methionine adenosyltransferase  60.2 
 
 		 396 aa  489  1e-137  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000696498  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4594  S-adenosylmethionine synthetase  60.66 
 
 		 399 aa  491  1e-137  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.791965  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0787  S-adenosylmethionine synthetase  60.98 
 
 		 384 aa  490  1e-137  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.451532  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3096  methionine adenosyltransferase  59.7 
 
 		 397 aa  488  1e-137  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0139  S-adenosylmethionine synthetase  61.5 
 
 		 389 aa  488  1e-136  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2521  S-adenosylmethionine synthetase  60.62 
 
 		 388 aa  488  1e-136  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.53813 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2678  S-adenosylmethionine synthetase  62.24 
 
 		 403 aa  486  1e-136  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.257721  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0894  S-adenosylmethionine synthetase  59.09 
 
 		 395 aa  486  1e-136  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000969915  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0506  S-adenosylmethionine synthetase  64.08 
 
 		 384 aa  484  1e-136  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000508675  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1332  S-adenosylmethionine synthetase  60.57 
 
 		 389 aa  484  1e-135  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000124955  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1928  S-adenosylmethionine synthetase  60.31 
 
 		 389 aa  481  1e-135  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.10598e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4320  methionine adenosyltransferase  60.42 
 
 		 387 aa  481  1e-135  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.238534  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1341  S-adenosylmethionine synthetase  61.08 
 
 		 389 aa  483  1e-135  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000125757  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3227  S-adenosylmethionine synthetase  61.1 
 
 		 382 aa  483  1e-135  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.634793  normal  0.359365 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2943  S-adenosylmethionine synthetase  61.08 
 
 		 389 aa  483  1e-135  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1880  S-adenosylmethionine synthetase  60.41 
 
 		 387 aa  480  1e-134  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000337587  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1256  S-adenosylmethionine synthetase  56.57 
 
 		 395 aa  479  1e-134  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.247936  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3840  S-adenosylmethionine synthetase  61.6 
 
 		 387 aa  478  1e-134  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.50059  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3905  S-adenosylmethionine synthetase  63.21 
 
 		 406 aa  480  1e-134  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000687531  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0454  S-adenosylmethionine synthetase  58.93 
 
 		 396 aa  479  1e-134  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0549  S-adenosylmethionine synthetase  63.57 
 
 		 384 aa  479  1e-134  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.00000243541  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2084  methionine adenosyltransferase  59.14 
 
 		 395 aa  479  1e-134  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.191002  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03568  S-adenosylmethionine synthetase  62.95 
 
 		 384 aa  479  1e-134  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0015  S-adenosylmethionine synthetase  61.04 
 
 		 385 aa  479  1e-134  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3981  S-adenosylmethionine synthetase  58.44 
 
 		 396 aa  481  1e-134  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000348916  hitchhiker  0.00000146833 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3707  S-adenosylmethionine synthetase  62.95 
 
 		 383 aa  478  1e-134  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00568587  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5016  S-adenosylmethionine synthetase  58.16 
 
 		 396 aa  475  1e-133  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.330289 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1352  S-adenosylmethionine synthetase  59.44 
 
 		 399 aa  476  1e-133  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1133  S-adenosylmethionine synthetase  59.69 
 
 		 395 aa  477  1e-133  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000111198  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0125  S-adenosylmethionine synthetase  59.54 
 
 		 396 aa  476  1e-133  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00105717  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0828  S-adenosylmethionine synthetase  57.81 
 
 		 388 aa  475  1e-133  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.296122  normal  0.0311874 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4840  S-adenosylmethionine synthetase  58.16 
 
 		 396 aa  475  1e-133  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.905564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0879  S-adenosylmethionine synthetase  59.58 
 
 		 388 aa  475  1e-133  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000307684  hitchhiker  0.000000742555 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0850  S-adenosylmethionine synthetase  58.07 
 
 		 388 aa  477  1e-133  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.876069  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0499  S-adenosylmethionine synthetase  57.91 
 
 		 396 aa  475  1e-133  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2330  methionine adenosyltransferase  57.18 
 
 		 396 aa  476  1e-133  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>