More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_3840 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_3840  S-adenosylmethionine synthetase  100 
 
 
387 aa  791    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.50059  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2521  S-adenosylmethionine synthetase  75.32 
 
 
388 aa  616  1e-175  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.53813 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0201  S-adenosylmethionine synthetase  74.03 
 
 
387 aa  605  9.999999999999999e-173  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2541  S-adenosylmethionine synthetase  74.16 
 
 
399 aa  605  9.999999999999999e-173  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.245618  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0156  S-adenosylmethionine synthetase  73.25 
 
 
387 aa  598  1e-170  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0194  S-adenosylmethionine synthetase  74.27 
 
 
387 aa  589  1e-167  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.378325  hitchhiker  0.00256294 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0188  S-adenosylmethionine synthetase  72.35 
 
 
387 aa  581  1.0000000000000001e-165  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0351  S-adenosylmethionine synthetase  73.18 
 
 
396 aa  579  1e-164  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.756862 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5604  S-adenosylmethionine synthetase  71.1 
 
 
393 aa  578  1e-164  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.617182 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0078  S-adenosylmethionine synthetase  72.66 
 
 
395 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0174  S-adenosylmethionine synthetase  72.99 
 
 
395 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4371  S-adenosylmethionine synthetase  72.66 
 
 
396 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3099  S-adenosylmethionine synthetase  72.73 
 
 
395 aa  571  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3262  S-adenosylmethionine synthetase  72.47 
 
 
395 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0211  S-adenosylmethionine synthetase  72.47 
 
 
395 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.357003  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2165  S-adenosylmethionine synthetase  72.47 
 
 
395 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0395  S-adenosylmethionine synthetase  72.47 
 
 
395 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2924  S-adenosylmethionine synthetase  72.47 
 
 
395 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3424  S-adenosylmethionine synthetase  72.47 
 
 
395 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3252  S-adenosylmethionine synthetase  69.74 
 
 
393 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3880  S-adenosylmethionine synthetase  70 
 
 
393 aa  571  1.0000000000000001e-162  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.356419  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3078  S-adenosylmethionine synthetase  72.47 
 
 
407 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.138759 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2467  S-adenosylmethionine synthetase  72.73 
 
 
395 aa  571  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1719  S-adenosylmethionine synthetase  72.99 
 
 
388 aa  573  1.0000000000000001e-162  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.950197  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3081  S-adenosylmethionine synthetase  72.73 
 
 
395 aa  571  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.735784  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0199  S-adenosylmethionine synthetase  72.47 
 
 
395 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0532  S-adenosylmethionine synthetase  72.06 
 
 
389 aa  569  1e-161  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.347962  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0134  S-adenosylmethionine synthetase  72.47 
 
 
396 aa  570  1e-161  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0030  S-adenosylmethionine synthetase  72.47 
 
 
396 aa  569  1e-161  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6431  S-adenosylmethionine synthetase  72.47 
 
 
395 aa  569  1e-161  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.335957 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2992  S-adenosylmethionine synthetase  72.21 
 
 
395 aa  569  1e-161  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0235224 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2003  S-adenosylmethionine synthetase  72.47 
 
 
388 aa  570  1e-161  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0979  S-adenosylmethionine synthetase  71.61 
 
 
393 aa  569  1e-161  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0690  Methionine adenosyltransferase  72.06 
 
 
389 aa  569  1e-161  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0374372  hitchhiker  0.00000199833 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3129  S-adenosylmethionine synthetase  72.21 
 
 
395 aa  569  1e-161  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.965515  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0139  S-adenosylmethionine synthetase  71.09 
 
 
389 aa  567  1e-160  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0036  S-adenosylmethionine synthetase  71.95 
 
 
396 aa  566  1e-160  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.094057 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2262  S-adenosylmethionine synthetase  67.18 
 
 
385 aa  565  1e-160  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0126  S-adenosylmethionine synthetase  68.97 
 
 
393 aa  565  1e-160  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0210112 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0705  S-adenosylmethionine synthetase  70.59 
 
 
393 aa  566  1e-160  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.102884 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0683  S-adenosylmethionine synthetase  70.59 
 
 
393 aa  566  1e-160  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.842341  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0660  S-adenosylmethionine synthetase  69.72 
 
 
395 aa  562  1.0000000000000001e-159  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00877697  decreased coverage  0.0019474 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0767  S-adenosylmethionine synthetase  70 
 
 
393 aa  561  1.0000000000000001e-159  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3346  S-adenosylmethionine synthetase  69.51 
 
 
384 aa  559  1e-158  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.274047  decreased coverage  0.00210424 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4844  S-adenosylmethionine synthetase  70.59 
 
 
403 aa  558  1e-158  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.277601 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0470  S-adenosylmethionine synthetase  68.15 
 
 
382 aa  558  1e-158  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02772  S-adenosylmethionine synthetase  68.73 
 
 
384 aa  555  1e-157  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.374196  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0753  Non-specific protein-tyrosine kinase  68.73 
 
 
384 aa  555  1e-157  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3328  S-adenosylmethionine synthetase  68.99 
 
 
384 aa  556  1e-157  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.196348  normal  0.570149 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3084  S-adenosylmethionine synthetase  68.73 
 
 
384 aa  555  1e-157  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.383726  hitchhiker  0.000161028 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0772  S-adenosylmethionine synthetase  68.73 
 
 
384 aa  555  1e-157  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0501612  hitchhiker  0.00139149 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3433  S-adenosylmethionine synthetase  68.73 
 
 
384 aa  554  1e-157  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00223184 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3336  S-adenosylmethionine synthetase  68.99 
 
 
384 aa  556  1e-157  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.216224  normal  0.254076 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4244  S-adenosylmethionine synthetase  68.73 
 
 
384 aa  555  1e-157  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.908743  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3099  S-adenosylmethionine synthetase  68.73 
 
 
384 aa  555  1e-157  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3284  S-adenosylmethionine synthetase  68.73 
 
 
384 aa  555  1e-157  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3263  S-adenosylmethionine synthetase  68.99 
 
 
384 aa  556  1e-157  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0673019  normal  0.240242 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3252  S-adenosylmethionine synthetase  68.73 
 
 
384 aa  556  1e-157  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0015174  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0772  S-adenosylmethionine synthetase  68.22 
 
 
383 aa  555  1e-157  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3251  S-adenosylmethionine synthetase  68.22 
 
 
383 aa  555  1e-157  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0646  S-adenosylmethionine synthetase  68.48 
 
 
383 aa  557  1e-157  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00167645  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02735  hypothetical protein  68.73 
 
 
384 aa  555  1e-157  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.457385  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3354  S-adenosylmethionine synthetase  68.22 
 
 
383 aa  555  1e-157  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0871  S-adenosylmethionine synthetase  67.44 
 
 
383 aa  553  1e-156  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0929  S-adenosylmethionine synthetase  67.7 
 
 
383 aa  552  1e-156  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2678  S-adenosylmethionine synthetase  69.01 
 
 
403 aa  553  1e-156  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.257721  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3374  S-adenosylmethionine synthetase  68.73 
 
 
384 aa  553  1e-156  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1082  S-adenosylmethionine synthetase  68.22 
 
 
383 aa  553  1e-156  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0507835  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0413  S-adenosylmethionine synthetase  68.93 
 
 
390 aa  553  1e-156  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0737611  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1126  S-adenosylmethionine synthetase  69.82 
 
 
393 aa  551  1e-156  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3974  S-adenosylmethionine synthetase  68.99 
 
 
384 aa  553  1e-156  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3660  S-adenosylmethionine synthetase  67.96 
 
 
383 aa  549  1e-155  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.2045 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3541  S-adenosylmethionine synthetase  67.96 
 
 
383 aa  549  1e-155  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3466  S-adenosylmethionine synthetase  67.96 
 
 
383 aa  549  1e-155  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0843  S-adenosylmethionine synthetase  68.73 
 
 
384 aa  550  1e-155  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000750109  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4320  methionine adenosyltransferase  67.87 
 
 
387 aa  549  1e-155  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.238534  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0841  S-adenosylmethionine synthetase  68.73 
 
 
384 aa  550  1e-155  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3347  S-adenosylmethionine synthetase  68.73 
 
 
384 aa  550  1e-155  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1821  S-adenosylmethionine synthetase  66.15 
 
 
385 aa  546  1e-154  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0267535  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0751  S-adenosylmethionine synthetase  67.18 
 
 
383 aa  545  1e-154  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3331  S-adenosylmethionine synthetase  67.44 
 
 
383 aa  545  1e-154  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.175486  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0826  S-adenosylmethionine synthetase  67.7 
 
 
383 aa  547  1e-154  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.232254  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0787  S-adenosylmethionine synthetase  67.01 
 
 
384 aa  542  1e-153  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.451532  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0850  S-adenosylmethionine synthetase  66.15 
 
 
388 aa  541  1e-153  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.876069  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0873  S-adenosylmethionine synthetase  67.18 
 
 
383 aa  543  1e-153  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0875  S-adenosylmethionine synthetase  66.75 
 
 
384 aa  542  1e-153  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2760  S-adenosylmethionine synthetase  66.67 
 
 
383 aa  543  1e-153  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1256  S-adenosylmethionine synthetase  64.32 
 
 
395 aa  539  9.999999999999999e-153  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.247936  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0828  S-adenosylmethionine synthetase  65.64 
 
 
388 aa  538  9.999999999999999e-153  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.296122  normal  0.0311874 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03161  S-adenosylmethionine synthetase  67.62 
 
 
381 aa  540  9.999999999999999e-153  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.713354  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0879  S-adenosylmethionine synthetase  65.97 
 
 
388 aa  540  9.999999999999999e-153  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000307684  hitchhiker  0.000000742555 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3905  S-adenosylmethionine synthetase  68.73 
 
 
406 aa  535  1e-151  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000687531  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0349  S-adenosylmethionine synthetase  66.75 
 
 
388 aa  537  1e-151  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000664302  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05530  S-adenosylmethionine synthetase  64.82 
 
 
396 aa  536  1e-151  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0506  S-adenosylmethionine synthetase  69.25 
 
 
384 aa  535  1e-151  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000508675  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2894  S-adenosylmethionine synthetase  67.65 
 
 
391 aa  534  1e-150  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07090  S-adenosylmethionine synthetase  65.33 
 
 
396 aa  533  1e-150  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.905662  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0649  S-adenosylmethionine synthetase  65.33 
 
 
396 aa  533  1e-150  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0044  S-adenosylmethionine synthetase  65.37 
 
 
388 aa  533  1e-150  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000084119  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3042  S-adenosylmethionine synthetase  64.07 
 
 
396 aa  531  1e-150  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.983396  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>