More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A6431 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003295  RSc0134  S-adenosylmethionine synthetase  83.51 
 
 
396 aa  649    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0078  S-adenosylmethionine synthetase  93.67 
 
 
395 aa  741    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3262  S-adenosylmethionine synthetase  95.95 
 
 
395 aa  753    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3099  S-adenosylmethionine synthetase  99.49 
 
 
395 aa  799    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0036  S-adenosylmethionine synthetase  83.76 
 
 
396 aa  654    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.094057 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0188  S-adenosylmethionine synthetase  85.75 
 
 
387 aa  670    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0201  S-adenosylmethionine synthetase  85.31 
 
 
387 aa  688    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0395  S-adenosylmethionine synthetase  95.95 
 
 
395 aa  753    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6431  S-adenosylmethionine synthetase  100 
 
 
395 aa  805    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.335957 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0211  S-adenosylmethionine synthetase  95.95 
 
 
395 aa  753    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.357003  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2924  S-adenosylmethionine synthetase  95.95 
 
 
395 aa  753    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0174  S-adenosylmethionine synthetase  96.46 
 
 
395 aa  755    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0351  S-adenosylmethionine synthetase  92.41 
 
 
396 aa  734    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.756862 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3880  S-adenosylmethionine synthetase  78.63 
 
 
393 aa  635    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.356419  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0194  S-adenosylmethionine synthetase  85.9 
 
 
387 aa  657    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.378325  hitchhiker  0.00256294 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4371  S-adenosylmethionine synthetase  93.16 
 
 
396 aa  739    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0156  S-adenosylmethionine synthetase  84.54 
 
 
387 aa  683    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2467  S-adenosylmethionine synthetase  99.49 
 
 
395 aa  799    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3252  S-adenosylmethionine synthetase  80.41 
 
 
393 aa  639    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2992  S-adenosylmethionine synthetase  98.99 
 
 
395 aa  795    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0235224 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2165  S-adenosylmethionine synthetase  95.95 
 
 
395 aa  753    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0126  S-adenosylmethionine synthetase  79.13 
 
 
393 aa  639    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0210112 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3129  S-adenosylmethionine synthetase  98.99 
 
 
395 aa  795    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.965515  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5604  S-adenosylmethionine synthetase  80.2 
 
 
393 aa  642    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.617182 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1719  S-adenosylmethionine synthetase  85.82 
 
 
388 aa  659    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.950197  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3081  S-adenosylmethionine synthetase  99.49 
 
 
395 aa  799    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.735784  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3078  S-adenosylmethionine synthetase  98.99 
 
 
407 aa  796    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.138759 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0030  S-adenosylmethionine synthetase  84.79 
 
 
396 aa  659    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0199  S-adenosylmethionine synthetase  95.95 
 
 
395 aa  753    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3424  S-adenosylmethionine synthetase  95.95 
 
 
395 aa  753    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2003  S-adenosylmethionine synthetase  85.57 
 
 
388 aa  657    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0979  S-adenosylmethionine synthetase  80.71 
 
 
393 aa  631  1e-180  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2521  S-adenosylmethionine synthetase  76.03 
 
 
388 aa  629  1e-179  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.53813 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0683  S-adenosylmethionine synthetase  79.7 
 
 
393 aa  628  1e-179  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.842341  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0705  S-adenosylmethionine synthetase  79.44 
 
 
393 aa  627  1e-178  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.102884 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1126  S-adenosylmethionine synthetase  81.05 
 
 
393 aa  626  1e-178  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0767  S-adenosylmethionine synthetase  80.68 
 
 
393 aa  627  1e-178  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4844  S-adenosylmethionine synthetase  77.78 
 
 
403 aa  621  1e-177  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.277601 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0660  S-adenosylmethionine synthetase  77.97 
 
 
395 aa  623  1e-177  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00877697  decreased coverage  0.0019474 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2541  S-adenosylmethionine synthetase  72.94 
 
 
399 aa  597  1e-169  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.245618  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0690  Methionine adenosyltransferase  73.97 
 
 
389 aa  572  1.0000000000000001e-162  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0374372  hitchhiker  0.00000199833 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0532  S-adenosylmethionine synthetase  73.97 
 
 
389 aa  572  1.0000000000000001e-162  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.347962  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3840  S-adenosylmethionine synthetase  72.47 
 
 
387 aa  568  1e-161  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.50059  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0470  S-adenosylmethionine synthetase  71.47 
 
 
382 aa  558  1e-158  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0139  S-adenosylmethionine synthetase  68.56 
 
 
389 aa  545  1e-154  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2678  S-adenosylmethionine synthetase  69.95 
 
 
403 aa  544  1e-154  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.257721  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2262  S-adenosylmethionine synthetase  69.17 
 
 
385 aa  546  1e-154  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02772  S-adenosylmethionine synthetase  69.61 
 
 
384 aa  535  1e-151  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.374196  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0753  Non-specific protein-tyrosine kinase  69.61 
 
 
384 aa  535  1e-151  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3084  S-adenosylmethionine synthetase  69.61 
 
 
384 aa  535  1e-151  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.383726  hitchhiker  0.000161028 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4244  S-adenosylmethionine synthetase  69.61 
 
 
384 aa  535  1e-151  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.908743  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0772  S-adenosylmethionine synthetase  69.61 
 
 
384 aa  535  1e-151  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0501612  hitchhiker  0.00139149 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3099  S-adenosylmethionine synthetase  69.61 
 
 
384 aa  535  1e-151  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02735  hypothetical protein  69.61 
 
 
384 aa  535  1e-151  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.457385  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4320  methionine adenosyltransferase  67.87 
 
 
387 aa  535  1e-151  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.238534  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3331  S-adenosylmethionine synthetase  69.27 
 
 
383 aa  535  1e-151  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.175486  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3284  S-adenosylmethionine synthetase  69.61 
 
 
384 aa  535  1e-151  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3346  S-adenosylmethionine synthetase  69.35 
 
 
384 aa  535  1e-151  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.274047  decreased coverage  0.00210424 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0044  S-adenosylmethionine synthetase  66.93 
 
 
388 aa  536  1e-151  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000084119  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0413  S-adenosylmethionine synthetase  69.01 
 
 
390 aa  533  1e-150  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0737611  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03161  S-adenosylmethionine synthetase  69.31 
 
 
381 aa  532  1e-150  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.713354  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3328  S-adenosylmethionine synthetase  69.35 
 
 
384 aa  532  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.196348  normal  0.570149 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3374  S-adenosylmethionine synthetase  69.35 
 
 
384 aa  533  1e-150  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3263  S-adenosylmethionine synthetase  69.35 
 
 
384 aa  532  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0673019  normal  0.240242 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1821  S-adenosylmethionine synthetase  67.62 
 
 
385 aa  531  1e-150  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0267535  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3336  S-adenosylmethionine synthetase  69.35 
 
 
384 aa  532  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.216224  normal  0.254076 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3252  S-adenosylmethionine synthetase  69.09 
 
 
384 aa  532  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0015174  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3433  S-adenosylmethionine synthetase  69.09 
 
 
384 aa  530  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00223184 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3974  S-adenosylmethionine synthetase  68.83 
 
 
384 aa  531  1e-149  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0879  S-adenosylmethionine synthetase  67.1 
 
 
388 aa  528  1e-149  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000307684  hitchhiker  0.000000742555 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1179  Methionine adenosyltransferase  68.13 
 
 
389 aa  530  1e-149  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0349  S-adenosylmethionine synthetase  65.72 
 
 
388 aa  526  1e-148  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000664302  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3347  S-adenosylmethionine synthetase  69.35 
 
 
384 aa  528  1e-148  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2894  S-adenosylmethionine synthetase  69.05 
 
 
391 aa  526  1e-148  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0841  S-adenosylmethionine synthetase  69.35 
 
 
384 aa  528  1e-148  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0843  S-adenosylmethionine synthetase  69.35 
 
 
384 aa  528  1e-148  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000750109  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1880  S-adenosylmethionine synthetase  65.03 
 
 
387 aa  521  1e-147  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000337587  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0646  S-adenosylmethionine synthetase  67.97 
 
 
383 aa  522  1e-147  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00167645  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1256  S-adenosylmethionine synthetase  64.97 
 
 
395 aa  519  1e-146  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.247936  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0929  S-adenosylmethionine synthetase  68.41 
 
 
383 aa  519  1e-146  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1332  S-adenosylmethionine synthetase  64.77 
 
 
389 aa  518  1e-146  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000124955  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0454  S-adenosylmethionine synthetase  66.33 
 
 
396 aa  520  1e-146  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0871  S-adenosylmethionine synthetase  67.19 
 
 
383 aa  518  1e-146  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1082  S-adenosylmethionine synthetase  67.97 
 
 
383 aa  519  1e-146  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0507835  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0772  S-adenosylmethionine synthetase  68.23 
 
 
383 aa  521  1e-146  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3251  S-adenosylmethionine synthetase  68.23 
 
 
383 aa  521  1e-146  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3354  S-adenosylmethionine synthetase  68.23 
 
 
383 aa  521  1e-146  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3541  S-adenosylmethionine synthetase  67.97 
 
 
383 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2943  S-adenosylmethionine synthetase  64.51 
 
 
389 aa  516  1.0000000000000001e-145  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1341  S-adenosylmethionine synthetase  64.51 
 
 
389 aa  516  1.0000000000000001e-145  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000125757  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0649  S-adenosylmethionine synthetase  66.08 
 
 
396 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3660  S-adenosylmethionine synthetase  67.97 
 
 
383 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.2045 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0850  S-adenosylmethionine synthetase  67.01 
 
 
388 aa  516  1.0000000000000001e-145  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.876069  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0053  S-adenosylmethionine synthetase  66.24 
 
 
393 aa  516  1.0000000000000001e-145  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0499  S-adenosylmethionine synthetase  65.33 
 
 
396 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07090  S-adenosylmethionine synthetase  66.08 
 
 
396 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.905662  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2131  S-adenosylmethionine synthetase  65.98 
 
 
393 aa  516  1.0000000000000001e-145  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.204435  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3466  S-adenosylmethionine synthetase  67.97 
 
 
383 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4967  S-adenosylmethionine synthetase  64.82 
 
 
396 aa  511  1e-144  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.3549  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5016  S-adenosylmethionine synthetase  64.82 
 
 
396 aa  511  1e-144  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.330289 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>