More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_03161 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02772  S-adenosylmethionine synthetase  82.8 
 
 		 384 aa  659    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.374196  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0753  Non-specific protein-tyrosine kinase  82.8 
 
 		 384 aa  659    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3541  S-adenosylmethionine synthetase  83.64 
 
 		 383 aa  662    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3328  S-adenosylmethionine synthetase  82.8 
 
 		 384 aa  660    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.196348  normal  0.570149 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0772  S-adenosylmethionine synthetase  82.8 
 
 		 384 aa  659    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0501612  hitchhiker  0.00139149 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3084  S-adenosylmethionine synthetase  82.8 
 
 		 384 aa  659    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.383726  hitchhiker  0.000161028 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3347  S-adenosylmethionine synthetase  80.95 
 
 		 384 aa  643    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0929  S-adenosylmethionine synthetase  82.59 
 
 		 383 aa  664    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0875  S-adenosylmethionine synthetase  81.05 
 
 		 384 aa  648    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3252  S-adenosylmethionine synthetase  82.54 
 
 		 384 aa  660    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0015174  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3374  S-adenosylmethionine synthetase  82.8 
 
 		 384 aa  657    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3433  S-adenosylmethionine synthetase  82.54 
 
 		 384 aa  659    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00223184 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3263  S-adenosylmethionine synthetase  82.8 
 
 		 384 aa  661    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0673019  normal  0.240242 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0826  S-adenosylmethionine synthetase  83.38 
 
 		 383 aa  660    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.232254  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03161  S-adenosylmethionine synthetase  100 
 
 		 381 aa  788    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.713354  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3099  S-adenosylmethionine synthetase  82.8 
 
 		 384 aa  659    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3974  S-adenosylmethionine synthetase  82.01 
 
 		 384 aa  655    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0843  S-adenosylmethionine synthetase  80.95 
 
 		 384 aa  643    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000750109  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3284  S-adenosylmethionine synthetase  82.8 
 
 		 384 aa  659    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3466  S-adenosylmethionine synthetase  83.64 
 
 		 383 aa  662    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0871  S-adenosylmethionine synthetase  82.85 
 
 		 383 aa  666    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1082  S-adenosylmethionine synthetase  82.59 
 
 		 383 aa  656    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0507835  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03568  S-adenosylmethionine synthetase  82.28 
 
 		 384 aa  635    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0751  S-adenosylmethionine synthetase  84.7 
 
 		 383 aa  677    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3331  S-adenosylmethionine synthetase  86.05 
 
 		 383 aa  700    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.175486  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0787  S-adenosylmethionine synthetase  81.05 
 
 		 384 aa  646    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.451532  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0772  S-adenosylmethionine synthetase  82.59 
 
 		 383 aa  662    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3251  S-adenosylmethionine synthetase  82.59 
 
 		 383 aa  662    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0646  S-adenosylmethionine synthetase  82.32 
 
 		 383 aa  658    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00167645  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4244  S-adenosylmethionine synthetase  82.8 
 
 		 384 aa  659    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.908743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0873  S-adenosylmethionine synthetase  83.38 
 
 		 383 aa  671    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0841  S-adenosylmethionine synthetase  80.95 
 
 		 384 aa  643    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3660  S-adenosylmethionine synthetase  83.64 
 
 		 383 aa  662    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.2045 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3354  S-adenosylmethionine synthetase  82.59 
 
 		 383 aa  662    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02735  hypothetical protein  82.8 
 
 		 384 aa  659    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.457385  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2760  S-adenosylmethionine synthetase  83.11 
 
 		 383 aa  667    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3346  S-adenosylmethionine synthetase  82.54 
 
 		 384 aa  658    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.274047  decreased coverage  0.00210424 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3336  S-adenosylmethionine synthetase  82.8 
 
 		 384 aa  661    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.216224  normal  0.254076 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002467  S-adenosylmethionine synthetase  82.28 
 
 		 384 aa  633  1e-180  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.508872  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3227  S-adenosylmethionine synthetase  78.63 
 
 		 382 aa  632  1e-180  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.634793  normal  0.359365 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0506  S-adenosylmethionine synthetase  81.48 
 
 		 384 aa  625  1e-178  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000508675  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0552  S-adenosylmethionine synthetase  80.95 
 
 		 384 aa  625  1e-178  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3707  S-adenosylmethionine synthetase  81.22 
 
 		 383 aa  621  1e-177  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00568587  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0549  S-adenosylmethionine synthetase  80.95 
 
 		 384 aa  623  1e-177  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.00000243541  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3905  S-adenosylmethionine synthetase  81.22 
 
 		 406 aa  621  1e-177  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000687531  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0024  S-adenosylmethionine synthetase  80 
 
 		 385 aa  621  1e-177  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0413  S-adenosylmethionine synthetase  77.25 
 
 		 390 aa  612  9.999999999999999e-175  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0737611  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4320  methionine adenosyltransferase  77.72 
 
 		 387 aa  610  1e-173  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.238534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1623  S-adenosylmethionine synthetase  77.89 
 
 		 384 aa  606  9.999999999999999e-173  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0139  S-adenosylmethionine synthetase  77.78 
 
 		 389 aa  601  1.0000000000000001e-171  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1821  S-adenosylmethionine synthetase  75.59 
 
 		 385 aa  603  1.0000000000000001e-171  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0267535  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0015  S-adenosylmethionine synthetase  75.13 
 
 		 385 aa  604  1.0000000000000001e-171  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2678  S-adenosylmethionine synthetase  74.54 
 
 		 403 aa  595  1e-169  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.257721  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1179  Methionine adenosyltransferase  74.8 
 
 		 389 aa  592  1e-168  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2262  S-adenosylmethionine synthetase  73.42 
 
 		 385 aa  592  1e-168  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0470  S-adenosylmethionine synthetase  74.47 
 
 		 382 aa  590  1e-167  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1256  S-adenosylmethionine synthetase  71.28 
 
 		 395 aa  584  1e-166  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.247936  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3042  S-adenosylmethionine synthetase  72.61 
 
 		 396 aa  584  1e-166  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.983396  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05530  S-adenosylmethionine synthetase  72.09 
 
 		 396 aa  579  1e-164  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0649  S-adenosylmethionine synthetase  73.32 
 
 		 396 aa  578  1e-164  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07090  S-adenosylmethionine synthetase  73.32 
 
 		 396 aa  578  1e-164  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.905662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0454  S-adenosylmethionine synthetase  71.91 
 
 		 396 aa  575  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5269  S-adenosylmethionine synthetase  71.91 
 
 		 396 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.613554  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2894  S-adenosylmethionine synthetase  74.4 
 
 		 391 aa  572  1.0000000000000001e-162  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0850  S-adenosylmethionine synthetase  70.26 
 
 		 388 aa  572  1.0000000000000001e-162  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.876069  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0499  S-adenosylmethionine synthetase  72.02 
 
 		 396 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4967  S-adenosylmethionine synthetase  71.5 
 
 		 396 aa  569  1e-161  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.3549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5016  S-adenosylmethionine synthetase  71.5 
 
 		 396 aa  569  1e-161  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.330289 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0828  S-adenosylmethionine synthetase  70.26 
 
 		 388 aa  568  1e-161  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.296122  normal  0.0311874 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2131  S-adenosylmethionine synthetase  70.9 
 
 		 393 aa  569  1e-161  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.204435  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0053  S-adenosylmethionine synthetase  70.9 
 
 		 393 aa  569  1e-161  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4840  S-adenosylmethionine synthetase  71.5 
 
 		 396 aa  569  1e-161  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.905564  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1676  methionine adenosyltransferase  73.54 
 
 		 388 aa  568  1e-161  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.176297  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2004  S-adenosylmethionine synthetase  70.37 
 
 		 382 aa  565  1e-160  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0879  S-adenosylmethionine synthetase  68.95 
 
 		 388 aa  564  1e-160  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000307684  hitchhiker  0.000000742555 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1840  S-adenosylmethionine synthetase  68.09 
 
 		 403 aa  561  1.0000000000000001e-159  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1999  S-adenosylmethionine synthetase  70.11 
 
 		 382 aa  563  1.0000000000000001e-159  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0385  S-adenosylmethionine synthetase  68.43 
 
 		 406 aa  562  1.0000000000000001e-159  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0383  S-adenosylmethionine synthetase  70.45 
 
 		 396 aa  558  1e-158  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4794  S-adenosylmethionine synthetase  72.48 
 
 		 396 aa  558  1e-158  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00494476 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04686  S-adenosylmethionine synthetase  70.86 
 
 		 403 aa  558  1e-158  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1771  S-adenosylmethionine synthetase  67.59 
 
 		 403 aa  558  1e-158  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2391  S-adenosylmethionine synthetase  68.77 
 
 		 390 aa  548  1e-155  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.855704  normal  0.120433 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0630  S-adenosylmethionine synthetase  70.43 
 
 		 403 aa  546  1e-154  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.370099  normal  0.156733 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0690  Methionine adenosyltransferase  70 
 
 		 389 aa  536  1e-151  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0374372  hitchhiker  0.00000199833 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0532  S-adenosylmethionine synthetase  70 
 
 		 389 aa  536  1e-151  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.347962  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2521  S-adenosylmethionine synthetase  67.11 
 
 		 388 aa  532  1e-150  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.53813 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2777  S-adenosylmethionine synthetase  65.04 
 
 		 403 aa  525  1e-148  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000102854  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0659  S-adenosylmethionine synthetase  65.3 
 
 		 403 aa  526  1e-148  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0919  methionine adenosyltransferase  67.2 
 
 		 386 aa  523  1e-147  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2574  S-adenosylmethionine synthetase  64.25 
 
 		 395 aa  522  1e-147  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0485425  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3840  S-adenosylmethionine synthetase  67.62 
 
 		 387 aa  519  1e-146  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.50059  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2251  methionine adenosyltransferase  62.15 
 
 		 397 aa  518  1e-146  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000460807  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0156  S-adenosylmethionine synthetase  66.84 
 
 		 387 aa  519  1e-146  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3891  S-adenosylmethionine synthetase  63.17 
 
 		 396 aa  520  1e-146  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00109689  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0201  S-adenosylmethionine synthetase  66.32 
 
 		 387 aa  517  1.0000000000000001e-145  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3096  methionine adenosyltransferase  62.76 
 
 		 397 aa  517  1.0000000000000001e-145  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0087  S-adenosylmethionine synthetase  63.17 
 
 		 396 aa  514  1.0000000000000001e-145  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000221578  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3081  S-adenosylmethionine synthetase  69.58 
 
 		 395 aa  514  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.735784  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0044  S-adenosylmethionine synthetase  68.6 
 
 		 388 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000084119  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>