More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_0349 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU1880  S-adenosylmethionine synthetase  78.91 
 
 
387 aa  635    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000337587  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2943  S-adenosylmethionine synthetase  78.91 
 
 
389 aa  636    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1341  S-adenosylmethionine synthetase  78.91 
 
 
389 aa  636    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000125757  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1290  S-adenosylmethionine synthetase  79.95 
 
 
389 aa  641    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.00000000000000134106  hitchhiker  0.0000021958 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1332  S-adenosylmethionine synthetase  78.65 
 
 
389 aa  635    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000124955  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0044  S-adenosylmethionine synthetase  82.95 
 
 
388 aa  658    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000084119  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0349  S-adenosylmethionine synthetase  100 
 
 
388 aa  801    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000664302  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1928  S-adenosylmethionine synthetase  74.48 
 
 
389 aa  598  1e-170  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.10598e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2521  S-adenosylmethionine synthetase  67.01 
 
 
388 aa  560  1e-158  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.53813 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0690  Methionine adenosyltransferase  66.75 
 
 
389 aa  551  1e-155  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0374372  hitchhiker  0.00000199833 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0532  S-adenosylmethionine synthetase  66.75 
 
 
389 aa  551  1e-155  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.347962  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0139  S-adenosylmethionine synthetase  66.24 
 
 
389 aa  546  1e-154  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2850  S-adenosylmethionine synthetase  67.53 
 
 
388 aa  546  1e-154  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0201  S-adenosylmethionine synthetase  65.21 
 
 
387 aa  541  1e-153  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0871  S-adenosylmethionine synthetase  66.49 
 
 
383 aa  542  1e-153  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02772  S-adenosylmethionine synthetase  66.23 
 
 
384 aa  540  9.999999999999999e-153  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.374196  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0753  Non-specific protein-tyrosine kinase  66.23 
 
 
384 aa  540  9.999999999999999e-153  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0772  S-adenosylmethionine synthetase  66.23 
 
 
384 aa  540  9.999999999999999e-153  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0501612  hitchhiker  0.00139149 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0929  S-adenosylmethionine synthetase  66.23 
 
 
383 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3328  S-adenosylmethionine synthetase  66.23 
 
 
384 aa  538  9.999999999999999e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.196348  normal  0.570149 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3099  S-adenosylmethionine synthetase  66.23 
 
 
384 aa  540  9.999999999999999e-153  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02735  hypothetical protein  66.23 
 
 
384 aa  540  9.999999999999999e-153  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.457385  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3336  S-adenosylmethionine synthetase  66.23 
 
 
384 aa  539  9.999999999999999e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.216224  normal  0.254076 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0470  S-adenosylmethionine synthetase  66.06 
 
 
382 aa  540  9.999999999999999e-153  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3263  S-adenosylmethionine synthetase  66.23 
 
 
384 aa  539  9.999999999999999e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0673019  normal  0.240242 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3374  S-adenosylmethionine synthetase  66.23 
 
 
384 aa  538  9.999999999999999e-153  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0156  S-adenosylmethionine synthetase  64.95 
 
 
387 aa  539  9.999999999999999e-153  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3284  S-adenosylmethionine synthetase  66.23 
 
 
384 aa  540  9.999999999999999e-153  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3346  S-adenosylmethionine synthetase  66.23 
 
 
384 aa  539  9.999999999999999e-153  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.274047  decreased coverage  0.00210424 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3252  S-adenosylmethionine synthetase  65.97 
 
 
384 aa  539  9.999999999999999e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0015174  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0772  S-adenosylmethionine synthetase  66.23 
 
 
383 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3251  S-adenosylmethionine synthetase  66.23 
 
 
383 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3084  S-adenosylmethionine synthetase  66.23 
 
 
384 aa  540  9.999999999999999e-153  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.383726  hitchhiker  0.000161028 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4244  S-adenosylmethionine synthetase  66.23 
 
 
384 aa  540  9.999999999999999e-153  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.908743  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3332  S-adenosylmethionine synthetase  66.84 
 
 
389 aa  539  9.999999999999999e-153  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3354  S-adenosylmethionine synthetase  66.23 
 
 
383 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0826  S-adenosylmethionine synthetase  67.01 
 
 
383 aa  539  9.999999999999999e-153  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.232254  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1256  S-adenosylmethionine synthetase  63.54 
 
 
395 aa  535  1e-151  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.247936  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3466  S-adenosylmethionine synthetase  66.75 
 
 
383 aa  537  1e-151  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0087  S-adenosylmethionine synthetase  64.81 
 
 
396 aa  535  1e-151  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000221578  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3433  S-adenosylmethionine synthetase  65.97 
 
 
384 aa  537  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00223184 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2541  S-adenosylmethionine synthetase  66.23 
 
 
399 aa  536  1e-151  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.245618  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3541  S-adenosylmethionine synthetase  66.75 
 
 
383 aa  537  1e-151  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3660  S-adenosylmethionine synthetase  66.75 
 
 
383 aa  537  1e-151  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.2045 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0367  S-adenosylmethionine synthetase  64.16 
 
 
389 aa  536  1e-151  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.913598 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4320  methionine adenosyltransferase  64.87 
 
 
387 aa  533  1e-150  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.238534  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3347  S-adenosylmethionine synthetase  66.23 
 
 
384 aa  534  1e-150  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1082  S-adenosylmethionine synthetase  65.97 
 
 
383 aa  532  1e-150  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0507835  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03161  S-adenosylmethionine synthetase  67.2 
 
 
381 aa  533  1e-150  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.713354  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0351  S-adenosylmethionine synthetase  66.67 
 
 
396 aa  531  1e-150  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.756862 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0843  S-adenosylmethionine synthetase  66.23 
 
 
384 aa  534  1e-150  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000750109  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0646  S-adenosylmethionine synthetase  65.45 
 
 
383 aa  533  1e-150  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00167645  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3840  S-adenosylmethionine synthetase  66.75 
 
 
387 aa  534  1e-150  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.50059  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0841  S-adenosylmethionine synthetase  66.23 
 
 
384 aa  534  1e-150  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2760  S-adenosylmethionine synthetase  65.71 
 
 
383 aa  533  1e-150  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3437  S-adenosylmethionine synthetase  65.15 
 
 
399 aa  528  1e-149  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.109386  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2777  S-adenosylmethionine synthetase  62.94 
 
 
403 aa  529  1e-149  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000102854  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4914  S-adenosylmethionine synthetase  65.15 
 
 
399 aa  528  1e-149  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.11754  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4594  S-adenosylmethionine synthetase  65.4 
 
 
399 aa  530  1e-149  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.791965  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4660  S-adenosylmethionine synthetase  65.15 
 
 
399 aa  529  1e-149  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4500  S-adenosylmethionine synthetase  65.4 
 
 
399 aa  530  1e-149  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4517  S-adenosylmethionine synthetase  65.15 
 
 
399 aa  529  1e-149  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.536795  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0363  S-adenosylmethionine synthetase  65.15 
 
 
399 aa  529  1e-149  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000052915  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5269  S-adenosylmethionine synthetase  63.57 
 
 
396 aa  530  1e-149  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.613554  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5017  S-adenosylmethionine synthetase  65.15 
 
 
399 aa  529  1e-149  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00446313  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4904  S-adenosylmethionine synthetase  65.4 
 
 
399 aa  530  1e-149  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000363625  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0659  S-adenosylmethionine synthetase  63.29 
 
 
403 aa  530  1e-149  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0873  S-adenosylmethionine synthetase  65.71 
 
 
383 aa  529  1e-149  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3880  S-adenosylmethionine synthetase  63.1 
 
 
393 aa  530  1e-149  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.356419  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4371  S-adenosylmethionine synthetase  66.67 
 
 
396 aa  531  1e-149  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3331  S-adenosylmethionine synthetase  65.97 
 
 
383 aa  530  1e-149  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.175486  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4877  S-adenosylmethionine synthetase  65.4 
 
 
399 aa  530  1e-149  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000842328  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0413  S-adenosylmethionine synthetase  65.8 
 
 
390 aa  530  1e-149  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0737611  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0751  S-adenosylmethionine synthetase  65.97 
 
 
383 aa  530  1e-149  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4886  S-adenosylmethionine synthetase  65.15 
 
 
399 aa  529  1e-149  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3099  S-adenosylmethionine synthetase  65.72 
 
 
395 aa  524  1e-148  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3262  S-adenosylmethionine synthetase  65.72 
 
 
395 aa  525  1e-148  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3424  S-adenosylmethionine synthetase  65.72 
 
 
395 aa  525  1e-148  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0395  S-adenosylmethionine synthetase  65.72 
 
 
395 aa  525  1e-148  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1071  S-adenosylmethionine synthetase  65.22 
 
 
393 aa  527  1e-148  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0298396  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0211  S-adenosylmethionine synthetase  65.72 
 
 
395 aa  525  1e-148  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.357003  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1821  S-adenosylmethionine synthetase  65.01 
 
 
385 aa  527  1e-148  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0267535  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2165  S-adenosylmethionine synthetase  65.72 
 
 
395 aa  525  1e-148  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2924  S-adenosylmethionine synthetase  65.72 
 
 
395 aa  525  1e-148  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0174  S-adenosylmethionine synthetase  65.72 
 
 
395 aa  527  1e-148  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2467  S-adenosylmethionine synthetase  65.72 
 
 
395 aa  524  1e-148  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0199  S-adenosylmethionine synthetase  65.72 
 
 
395 aa  525  1e-148  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3974  S-adenosylmethionine synthetase  64.68 
 
 
384 aa  525  1e-148  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07090  S-adenosylmethionine synthetase  64.07 
 
 
396 aa  525  1e-148  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.905662  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3081  S-adenosylmethionine synthetase  65.72 
 
 
395 aa  524  1e-148  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.735784  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0649  S-adenosylmethionine synthetase  64.07 
 
 
396 aa  525  1e-148  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2251  methionine adenosyltransferase  63.64 
 
 
397 aa  524  1e-147  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000460807  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2131  S-adenosylmethionine synthetase  62.37 
 
 
393 aa  522  1e-147  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.204435  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0875  S-adenosylmethionine synthetase  65.03 
 
 
384 aa  523  1e-147  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0078  S-adenosylmethionine synthetase  65.12 
 
 
395 aa  522  1e-147  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0053  S-adenosylmethionine synthetase  62.37 
 
 
393 aa  522  1e-147  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2992  S-adenosylmethionine synthetase  65.46 
 
 
395 aa  523  1e-147  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0235224 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0172  S-adenosylmethionine synthetase  66.32 
 
 
390 aa  522  1e-147  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3078  S-adenosylmethionine synthetase  65.21 
 
 
407 aa  521  1e-147  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.138759 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3252  S-adenosylmethionine synthetase  63.1 
 
 
393 aa  523  1e-147  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>