More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_2943 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_1332  S-adenosylmethionine synthetase  91.77 
 
 		 389 aa  728    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000124955  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1880  S-adenosylmethionine synthetase  88.37 
 
 		 387 aa  699    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000337587  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1341  S-adenosylmethionine synthetase  100 
 
 		 389 aa  800    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000125757  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1290  S-adenosylmethionine synthetase  88.17 
 
 		 389 aa  702    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.00000000000000134106  hitchhiker  0.0000021958 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2943  S-adenosylmethionine synthetase  100 
 
 		 389 aa  800    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0349  S-adenosylmethionine synthetase  78.91 
 
 		 388 aa  637    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000664302  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0044  S-adenosylmethionine synthetase  78.33 
 
 		 388 aa  641    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000084119  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1928  S-adenosylmethionine synthetase  77.12 
 
 		 389 aa  630  1e-179  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.10598e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0367  S-adenosylmethionine synthetase  69.41 
 
 		 389 aa  572  1.0000000000000001e-162  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.913598 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2850  S-adenosylmethionine synthetase  70.73 
 
 		 388 aa  558  1e-158  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2521  S-adenosylmethionine synthetase  66.32 
 
 		 388 aa  559  1e-158  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.53813 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0532  S-adenosylmethionine synthetase  67.88 
 
 		 389 aa  548  1e-155  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.347962  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0690  Methionine adenosyltransferase  67.88 
 
 		 389 aa  548  1e-155  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0374372  hitchhiker  0.00000199833 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2541  S-adenosylmethionine synthetase  66.15 
 
 		 399 aa  539  9.999999999999999e-153  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.245618  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3332  S-adenosylmethionine synthetase  66.93 
 
 		 389 aa  540  9.999999999999999e-153  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2251  methionine adenosyltransferase  66.08 
 
 		 397 aa  539  9.999999999999999e-153  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000460807  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0156  S-adenosylmethionine synthetase  63.73 
 
 		 387 aa  535  1e-151  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0139  S-adenosylmethionine synthetase  65.1 
 
 		 389 aa  531  1e-150  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0087  S-adenosylmethionine synthetase  64.48 
 
 		 396 aa  531  1e-150  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000221578  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0201  S-adenosylmethionine synthetase  63.21 
 
 		 387 aa  533  1e-150  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3880  S-adenosylmethionine synthetase  64.19 
 
 		 393 aa  534  1e-150  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.356419  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02772  S-adenosylmethionine synthetase  64.86 
 
 		 384 aa  528  1e-149  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.374196  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0753  Non-specific protein-tyrosine kinase  64.86 
 
 		 384 aa  528  1e-149  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3099  S-adenosylmethionine synthetase  64.86 
 
 		 384 aa  528  1e-149  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3084  S-adenosylmethionine synthetase  64.86 
 
 		 384 aa  528  1e-149  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.383726  hitchhiker  0.000161028 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02735  hypothetical protein  64.86 
 
 		 384 aa  528  1e-149  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.457385  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0172  S-adenosylmethionine synthetase  66.84 
 
 		 390 aa  529  1e-149  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3284  S-adenosylmethionine synthetase  64.86 
 
 		 384 aa  528  1e-149  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4244  S-adenosylmethionine synthetase  64.86 
 
 		 384 aa  528  1e-149  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.908743  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0772  S-adenosylmethionine synthetase  64.86 
 
 		 384 aa  528  1e-149  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0501612  hitchhiker  0.00139149 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0126  S-adenosylmethionine synthetase  63.68 
 
 		 393 aa  525  1e-148  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0210112 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3374  S-adenosylmethionine synthetase  64.6 
 
 		 384 aa  526  1e-148  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3346  S-adenosylmethionine synthetase  63.82 
 
 		 384 aa  525  1e-148  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.274047  decreased coverage  0.00210424 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1821  S-adenosylmethionine synthetase  63.82 
 
 		 385 aa  526  1e-148  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0267535  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0659  S-adenosylmethionine synthetase  62.72 
 
 		 403 aa  525  1e-148  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0154  S-adenosylmethionine synthetase  66.32 
 
 		 390 aa  525  1e-148  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0143732  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0841  S-adenosylmethionine synthetase  64.6 
 
 		 384 aa  525  1e-148  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0843  S-adenosylmethionine synthetase  64.6 
 
 		 384 aa  525  1e-148  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000750109  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3347  S-adenosylmethionine synthetase  64.6 
 
 		 384 aa  525  1e-148  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0161  S-adenosylmethionine synthetase  66.58 
 
 		 388 aa  527  1e-148  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4500  S-adenosylmethionine synthetase  63.16 
 
 		 399 aa  521  1e-147  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2574  S-adenosylmethionine synthetase  63.92 
 
 		 395 aa  523  1e-147  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0485425  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3328  S-adenosylmethionine synthetase  63.57 
 
 		 384 aa  521  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.196348  normal  0.570149 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3974  S-adenosylmethionine synthetase  63.82 
 
 		 384 aa  522  1e-147  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5604  S-adenosylmethionine synthetase  63.52 
 
 		 393 aa  522  1e-147  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.617182 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3336  S-adenosylmethionine synthetase  63.57 
 
 		 384 aa  522  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.216224  normal  0.254076 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0705  S-adenosylmethionine synthetase  64.54 
 
 		 393 aa  521  1e-147  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.102884 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3252  S-adenosylmethionine synthetase  63.31 
 
 		 384 aa  522  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0015174  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4904  S-adenosylmethionine synthetase  63.16 
 
 		 399 aa  521  1e-147  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000363625  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0683  S-adenosylmethionine synthetase  64.54 
 
 		 393 aa  521  1e-147  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.842341  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3981  S-adenosylmethionine synthetase  61.36 
 
 		 396 aa  522  1e-147  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000348916  hitchhiker  0.00000146833 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4594  S-adenosylmethionine synthetase  63.16 
 
 		 399 aa  521  1e-147  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.791965  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2777  S-adenosylmethionine synthetase  62.47 
 
 		 403 aa  522  1e-147  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000102854  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0445  S-adenosylmethionine synthetase  62.5 
 
 		 395 aa  523  1e-147  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000309499  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4877  S-adenosylmethionine synthetase  63.16 
 
 		 399 aa  521  1e-147  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000842328  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3263  S-adenosylmethionine synthetase  63.57 
 
 		 384 aa  522  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0673019  normal  0.240242 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3840  S-adenosylmethionine synthetase  63.82 
 
 		 387 aa  519  1e-146  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.50059  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0134  S-adenosylmethionine synthetase  63.99 
 
 		 396 aa  520  1e-146  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4914  S-adenosylmethionine synthetase  62.91 
 
 		 399 aa  519  1e-146  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.11754  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4886  S-adenosylmethionine synthetase  62.91 
 
 		 399 aa  520  1e-146  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4660  S-adenosylmethionine synthetase  62.91 
 
 		 399 aa  520  1e-146  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4517  S-adenosylmethionine synthetase  62.91 
 
 		 399 aa  520  1e-146  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.536795  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0030  S-adenosylmethionine synthetase  63.99 
 
 		 396 aa  520  1e-146  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0363  S-adenosylmethionine synthetase  62.91 
 
 		 399 aa  520  1e-146  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000052915  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5017  S-adenosylmethionine synthetase  62.91 
 
 		 399 aa  520  1e-146  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00446313  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1071  S-adenosylmethionine synthetase  62.34 
 
 		 393 aa  518  1e-146  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0298396  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3433  S-adenosylmethionine synthetase  63.31 
 
 		 384 aa  520  1e-146  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00223184 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3252  S-adenosylmethionine synthetase  63.17 
 
 		 393 aa  520  1e-146  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4320  methionine adenosyltransferase  64.16 
 
 		 387 aa  519  1e-146  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.238534  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0686  S-adenosylmethionine synthetase  63.59 
 
 		 396 aa  520  1e-146  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000273015  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0036  S-adenosylmethionine synthetase  63.73 
 
 		 396 aa  519  1e-146  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.094057 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3437  S-adenosylmethionine synthetase  62.91 
 
 		 399 aa  519  1e-146  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.109386  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2924  S-adenosylmethionine synthetase  64.77 
 
 		 395 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0351  S-adenosylmethionine synthetase  64.42 
 
 		 396 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.756862 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3262  S-adenosylmethionine synthetase  64.77 
 
 		 395 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0199  S-adenosylmethionine synthetase  64.77 
 
 		 395 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0395  S-adenosylmethionine synthetase  64.77 
 
 		 395 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2678  S-adenosylmethionine synthetase  64.06 
 
 		 403 aa  517  1.0000000000000001e-145  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.257721  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6431  S-adenosylmethionine synthetase  64.51 
 
 		 395 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.335957 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0211  S-adenosylmethionine synthetase  64.77 
 
 		 395 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.357003  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3424  S-adenosylmethionine synthetase  64.77 
 
 		 395 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0174  S-adenosylmethionine synthetase  64.25 
 
 		 395 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2992  S-adenosylmethionine synthetase  64.25 
 
 		 395 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0235224 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0413  S-adenosylmethionine synthetase  63.45 
 
 		 390 aa  514  1.0000000000000001e-145  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0737611  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4371  S-adenosylmethionine synthetase  64.42 
 
 		 396 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2467  S-adenosylmethionine synthetase  64.51 
 
 		 395 aa  514  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1234  S-adenosylmethionine synthetase  63.89 
 
 		 396 aa  516  1.0000000000000001e-145  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0170314  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3129  S-adenosylmethionine synthetase  64.25 
 
 		 395 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.965515  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3081  S-adenosylmethionine synthetase  64.51 
 
 		 395 aa  514  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.735784  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3099  S-adenosylmethionine synthetase  64.51 
 
 		 395 aa  514  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2165  S-adenosylmethionine synthetase  64.77 
 
 		 395 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3078  S-adenosylmethionine synthetase  64.77 
 
 		 407 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.138759 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4844  S-adenosylmethionine synthetase  62.76 
 
 		 403 aa  511  1e-144  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.277601 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2131  S-adenosylmethionine synthetase  63.45 
 
 		 393 aa  514  1e-144  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.204435  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0188  S-adenosylmethionine synthetase  62.79 
 
 		 387 aa  511  1e-144  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2003  S-adenosylmethionine synthetase  64.25 
 
 		 388 aa  512  1e-144  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0470  S-adenosylmethionine synthetase  63.76 
 
 		 382 aa  511  1e-144  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0053  S-adenosylmethionine synthetase  63.71 
 
 		 393 aa  514  1e-144  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3891  S-adenosylmethionine synthetase  60.86 
 
 		 396 aa  514  1e-144  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00109689  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0979  S-adenosylmethionine synthetase  63.01 
 
 		 393 aa  513  1e-144  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>