More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1928 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_1928  S-adenosylmethionine synthetase  100 
 
 		 389 aa  801    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.10598e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1880  S-adenosylmethionine synthetase  77.26 
 
 		 387 aa  632  1e-180  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000337587  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1290  S-adenosylmethionine synthetase  78.41 
 
 		 389 aa  631  1e-180  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.00000000000000134106  hitchhiker  0.0000021958 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1332  S-adenosylmethionine synthetase  77.12 
 
 		 389 aa  630  1e-180  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000124955  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1341  S-adenosylmethionine synthetase  77.12 
 
 		 389 aa  627  1e-179  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000125757  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2943  S-adenosylmethionine synthetase  77.12 
 
 		 389 aa  627  1e-179  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0044  S-adenosylmethionine synthetase  73.63 
 
 		 388 aa  605  9.999999999999999e-173  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000084119  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0349  S-adenosylmethionine synthetase  74.48 
 
 		 388 aa  597  1e-169  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000664302  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0367  S-adenosylmethionine synthetase  67.87 
 
 		 389 aa  565  1e-160  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.913598 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2850  S-adenosylmethionine synthetase  69.19 
 
 		 388 aa  556  1e-157  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0532  S-adenosylmethionine synthetase  70.23 
 
 		 389 aa  550  1e-155  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.347962  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0690  Methionine adenosyltransferase  70.23 
 
 		 389 aa  550  1e-155  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0374372  hitchhiker  0.00000199833 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0087  S-adenosylmethionine synthetase  64.9 
 
 		 396 aa  543  1e-153  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000221578  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2521  S-adenosylmethionine synthetase  64.94 
 
 		 388 aa  544  1e-153  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.53813 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0156  S-adenosylmethionine synthetase  65.8 
 
 		 387 aa  538  9.999999999999999e-153  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0201  S-adenosylmethionine synthetase  65.03 
 
 		 387 aa  536  1e-151  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2251  methionine adenosyltransferase  64.47 
 
 		 397 aa  537  1e-151  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000460807  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0139  S-adenosylmethionine synthetase  65.62 
 
 		 389 aa  534  1e-150  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0470  S-adenosylmethionine synthetase  65.17 
 
 		 382 aa  533  1e-150  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4320  methionine adenosyltransferase  65.3 
 
 		 387 aa  532  1e-150  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.238534  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0134  S-adenosylmethionine synthetase  67.36 
 
 		 396 aa  531  1e-149  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2678  S-adenosylmethionine synthetase  64.06 
 
 		 403 aa  529  1e-149  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.257721  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3252  S-adenosylmethionine synthetase  63.68 
 
 		 393 aa  528  1e-149  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0036  S-adenosylmethionine synthetase  67.1 
 
 		 396 aa  528  1e-149  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.094057 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3332  S-adenosylmethionine synthetase  65.28 
 
 		 389 aa  530  1e-149  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0413  S-adenosylmethionine synthetase  64.49 
 
 		 390 aa  525  1e-148  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0737611  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3346  S-adenosylmethionine synthetase  64.6 
 
 		 384 aa  525  1e-148  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.274047  decreased coverage  0.00210424 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0126  S-adenosylmethionine synthetase  63.43 
 
 		 393 aa  525  1e-148  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0210112 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03161  S-adenosylmethionine synthetase  63.87 
 
 		 381 aa  527  1e-148  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.713354  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2541  S-adenosylmethionine synthetase  65.12 
 
 		 399 aa  526  1e-148  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.245618  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0030  S-adenosylmethionine synthetase  66.58 
 
 		 396 aa  527  1e-148  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3880  S-adenosylmethionine synthetase  63.43 
 
 		 393 aa  527  1e-148  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.356419  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1234  S-adenosylmethionine synthetase  64.14 
 
 		 396 aa  526  1e-148  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0170314  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3336  S-adenosylmethionine synthetase  64.34 
 
 		 384 aa  525  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.216224  normal  0.254076 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3263  S-adenosylmethionine synthetase  64.34 
 
 		 384 aa  525  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0673019  normal  0.240242 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02772  S-adenosylmethionine synthetase  64.34 
 
 		 384 aa  524  1e-147  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.374196  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0753  Non-specific protein-tyrosine kinase  64.34 
 
 		 384 aa  524  1e-147  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3252  S-adenosylmethionine synthetase  64.08 
 
 		 384 aa  524  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0015174  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3099  S-adenosylmethionine synthetase  64.34 
 
 		 384 aa  524  1e-147  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3433  S-adenosylmethionine synthetase  64.08 
 
 		 384 aa  522  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00223184 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4244  S-adenosylmethionine synthetase  64.34 
 
 		 384 aa  524  1e-147  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.908743  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5604  S-adenosylmethionine synthetase  64.29 
 
 		 393 aa  524  1e-147  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.617182 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0683  S-adenosylmethionine synthetase  64.29 
 
 		 393 aa  523  1e-147  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.842341  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3084  S-adenosylmethionine synthetase  64.34 
 
 		 384 aa  524  1e-147  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.383726  hitchhiker  0.000161028 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0843  S-adenosylmethionine synthetase  64.34 
 
 		 384 aa  523  1e-147  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000750109  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3347  S-adenosylmethionine synthetase  64.34 
 
 		 384 aa  523  1e-147  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3840  S-adenosylmethionine synthetase  65.63 
 
 		 387 aa  523  1e-147  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.50059  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0841  S-adenosylmethionine synthetase  64.34 
 
 		 384 aa  523  1e-147  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3284  S-adenosylmethionine synthetase  64.34 
 
 		 384 aa  524  1e-147  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3374  S-adenosylmethionine synthetase  64.08 
 
 		 384 aa  521  1e-147  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0772  S-adenosylmethionine synthetase  64.34 
 
 		 384 aa  524  1e-147  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0501612  hitchhiker  0.00139149 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3328  S-adenosylmethionine synthetase  64.34 
 
 		 384 aa  523  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.196348  normal  0.570149 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0705  S-adenosylmethionine synthetase  64.29 
 
 		 393 aa  523  1e-147  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.102884 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02735  hypothetical protein  64.34 
 
 		 384 aa  524  1e-147  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.457385  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0445  S-adenosylmethionine synthetase  63.01 
 
 		 395 aa  523  1e-147  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000309499  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0172  S-adenosylmethionine synthetase  66.07 
 
 		 390 aa  520  1e-146  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1821  S-adenosylmethionine synthetase  63.31 
 
 		 385 aa  519  1e-146  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0267535  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3974  S-adenosylmethionine synthetase  63.82 
 
 		 384 aa  520  1e-146  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2574  S-adenosylmethionine synthetase  64.42 
 
 		 395 aa  519  1e-146  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0485425  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0161  S-adenosylmethionine synthetase  65.55 
 
 		 388 aa  515  1.0000000000000001e-145  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4660  S-adenosylmethionine synthetase  62.16 
 
 		 399 aa  514  1.0000000000000001e-145  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4500  S-adenosylmethionine synthetase  62.41 
 
 		 399 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4517  S-adenosylmethionine synthetase  62.16 
 
 		 399 aa  514  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.536795  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4904  S-adenosylmethionine synthetase  62.41 
 
 		 399 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000363625  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5017  S-adenosylmethionine synthetase  62.16 
 
 		 399 aa  514  1.0000000000000001e-145  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00446313  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0979  S-adenosylmethionine synthetase  63.78 
 
 		 393 aa  517  1.0000000000000001e-145  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2777  S-adenosylmethionine synthetase  61.89 
 
 		 403 aa  515  1.0000000000000001e-145  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000102854  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3331  S-adenosylmethionine synthetase  63.57 
 
 		 383 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.175486  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0159  S-adenosylmethionine synthetase  65.46 
 
 		 389 aa  514  1.0000000000000001e-145  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.114816 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4886  S-adenosylmethionine synthetase  62.16 
 
 		 399 aa  514  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4844  S-adenosylmethionine synthetase  63.52 
 
 		 403 aa  513  1e-144  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.277601 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4914  S-adenosylmethionine synthetase  62.16 
 
 		 399 aa  513  1e-144  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.11754  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1256  S-adenosylmethionine synthetase  60.45 
 
 		 395 aa  511  1e-144  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.247936  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4594  S-adenosylmethionine synthetase  62.16 
 
 		 399 aa  511  1e-144  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.791965  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0188  S-adenosylmethionine synthetase  63.57 
 
 		 387 aa  512  1e-144  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5269  S-adenosylmethionine synthetase  60.8 
 
 		 396 aa  513  1e-144  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.613554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1071  S-adenosylmethionine synthetase  63.33 
 
 		 393 aa  512  1e-144  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0298396  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1126  S-adenosylmethionine synthetase  64.55 
 
 		 393 aa  512  1e-144  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4877  S-adenosylmethionine synthetase  62.16 
 
 		 399 aa  514  1e-144  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000842328  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0154  S-adenosylmethionine synthetase  65.3 
 
 		 390 aa  514  1e-144  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0143732  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0767  S-adenosylmethionine synthetase  64.04 
 
 		 393 aa  513  1e-144  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0686  S-adenosylmethionine synthetase  62.82 
 
 		 396 aa  513  1e-144  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000273015  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0871  S-adenosylmethionine synthetase  62.53 
 
 		 383 aa  514  1e-144  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0659  S-adenosylmethionine synthetase  61.89 
 
 		 403 aa  511  1e-144  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0772  S-adenosylmethionine synthetase  62.79 
 
 		 383 aa  512  1e-144  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3251  S-adenosylmethionine synthetase  62.79 
 
 		 383 aa  512  1e-144  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2262  S-adenosylmethionine synthetase  62.53 
 
 		 385 aa  514  1e-144  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0363  S-adenosylmethionine synthetase  62.16 
 
 		 399 aa  513  1e-144  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000052915  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3354  S-adenosylmethionine synthetase  62.79 
 
 		 383 aa  512  1e-144  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0929  S-adenosylmethionine synthetase  62.27 
 
 		 383 aa  509  1e-143  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2004  S-adenosylmethionine synthetase  63.23 
 
 		 382 aa  508  1e-143  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1999  S-adenosylmethionine synthetase  63.23 
 
 		 382 aa  508  1e-143  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0351  S-adenosylmethionine synthetase  64.42 
 
 		 396 aa  509  1e-143  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.756862 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2303  S-adenosylmethionine synthetase  66.41 
 
 		 389 aa  510  1e-143  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0174  S-adenosylmethionine synthetase  63.73 
 
 		 395 aa  509  1e-143  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0053  S-adenosylmethionine synthetase  62.66 
 
 		 393 aa  509  1e-143  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4371  S-adenosylmethionine synthetase  64.68 
 
 		 396 aa  510  1e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3078  S-adenosylmethionine synthetase  63.73 
 
 		 407 aa  510  1e-143  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.138759 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3081  S-adenosylmethionine synthetase  63.73 
 
 		 395 aa  509  1e-143  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.735784  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2760  S-adenosylmethionine synthetase  62.53 
 
 		 383 aa  511  1e-143  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>