More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_12750 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_12750  methionine adenosyltransferase  100 
 
 		 405 aa  820    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0223394 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1363  S-adenosylmethionine synthetase  70.93 
 
 		 395 aa  567  1e-160  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.176558  normal  0.04012 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2989  Methionine adenosyltransferase  72.75 
 
 		 399 aa  567  1e-160  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.757819 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2818  Methionine adenosyltransferase  69.4 
 
 		 395 aa  564  1.0000000000000001e-159  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.575493 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5342  S-adenosylmethionine synthetase  69.5 
 
 		 399 aa  558  1e-158  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.339579  normal  0.683287 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15650  methionine adenosyltransferase  70.05 
 
 		 400 aa  561  1e-158  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.148398  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27040  methionine adenosyltransferase  70.56 
 
 		 399 aa  553  1e-156  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.593252  normal  0.387061 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3004  S-adenosylmethionine synthetase  68.92 
 
 		 397 aa  554  1e-156  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000578039  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1864  S-adenosylmethionine synthetase  68.56 
 
 		 399 aa  553  1e-156  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1857  S-adenosylmethionine synthetase  68.32 
 
 		 399 aa  548  1e-155  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.41268  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3192  S-adenosylmethionine synthetase  68.81 
 
 		 398 aa  549  1e-155  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.000568371  normal  0.539174 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3124  S-adenosylmethionine synthetase  68.98 
 
 		 398 aa  548  1e-155  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.110006  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1290  S-adenosylmethionine synthetase  68.16 
 
 		 417 aa  548  1e-155  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.134908  normal  0.0680854 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3103  S-adenosylmethionine synthetase  68.32 
 
 		 401 aa  545  1e-154  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0169073  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5235  S-adenosylmethionine synthetase  69.62 
 
 		 400 aa  545  1e-154  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1065  S-adenosylmethionine synthetase  68.42 
 
 		 397 aa  546  1e-154  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4159  S-adenosylmethionine synthetase  68.5 
 
 		 397 aa  545  1e-154  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0297831  normal  0.258747 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2575  S-adenosylmethionine synthetase  68.16 
 
 		 407 aa  546  1e-154  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.136519  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1718  S-adenosylmethionine synthetase  69.54 
 
 		 400 aa  538  9.999999999999999e-153  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.388889  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1716  S-adenosylmethionine synthetase  68.67 
 
 		 398 aa  540  9.999999999999999e-153  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.123594  hitchhiker  0.00797673 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2373  S-adenosylmethionine synthetase  67.66 
 
 		 402 aa  539  9.999999999999999e-153  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2256  S-adenosylmethionine synthetase  68.56 
 
 		 411 aa  538  9.999999999999999e-153  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0616987  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2414  S-adenosylmethionine synthetase  67.66 
 
 		 402 aa  539  9.999999999999999e-153  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.295636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2420  S-adenosylmethionine synthetase  67.66 
 
 		 402 aa  539  9.999999999999999e-153  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.219199 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2348  S-adenosylmethionine synthetase  67.24 
 
 		 403 aa  536  1e-151  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.233249  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14830  methionine adenosyltransferase  69.08 
 
 		 402 aa  535  1e-151  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.000117882  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3161  S-adenosylmethionine synthetase  67 
 
 		 396 aa  534  1e-150  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.153387  hitchhiker  0.00000474907 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2670  S-adenosylmethionine synthetase  66.5 
 
 		 402 aa  533  1e-150  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.178907  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3094  S-adenosylmethionine synthetase  67.08 
 
 		 397 aa  528  1e-149  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0289909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1993  S-adenosylmethionine synthetase  68.67 
 
 		 411 aa  528  1e-149  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000306332 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3737  S-adenosylmethionine synthetase  66.25 
 
 		 402 aa  530  1e-149  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.193212 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11421  S-adenosylmethionine synthetase  66.25 
 
 		 403 aa  523  1e-147  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0291702  normal  0.38734 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2993  S-adenosylmethionine synthetase  66.42 
 
 		 401 aa  523  1e-147  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.285331 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18060  methionine adenosyltransferase  67 
 
 		 397 aa  518  1e-146  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0593613  normal  0.705478 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1315  S-adenosylmethionine synthetase  65.25 
 
 		 398 aa  519  1e-146  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.119396  normal  0.284127 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1853  S-adenosylmethionine synthetase  68.67 
 
 		 399 aa  520  1e-146  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0451389  normal  0.42131 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2045  S-adenosylmethionine synthetase  67.08 
 
 		 407 aa  513  1e-144  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00317671 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2439  S-adenosylmethionine synthetase  66.07 
 
 		 396 aa  511  1e-143  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.523841  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12520  methionine adenosyltransferase  66.42 
 
 		 420 aa  506  9.999999999999999e-143  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.260949  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2251  methionine adenosyltransferase  61.76 
 
 		 397 aa  504  1e-141  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000460807  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2574  S-adenosylmethionine synthetase  63.09 
 
 		 395 aa  499  1e-140  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0485425  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1692  S-adenosylmethionine synthetase  62.97 
 
 		 397 aa  498  1e-140  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.753186  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2777  S-adenosylmethionine synthetase  61.08 
 
 		 403 aa  496  1e-139  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000102854  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0087  S-adenosylmethionine synthetase  59.8 
 
 		 396 aa  494  9.999999999999999e-139  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000221578  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0659  S-adenosylmethionine synthetase  61.33 
 
 		 403 aa  490  1e-137  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3891  S-adenosylmethionine synthetase  61.04 
 
 		 396 aa  483  1e-135  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00109689  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0445  S-adenosylmethionine synthetase  58.52 
 
 		 395 aa  481  1e-134  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000309499  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0686  S-adenosylmethionine synthetase  58.37 
 
 		 396 aa  475  1e-133  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000273015  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3096  methionine adenosyltransferase  61.25 
 
 		 397 aa  476  1e-133  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3437  S-adenosylmethionine synthetase  60.3 
 
 		 399 aa  475  1e-133  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.109386  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3565  S-adenosylmethionine synthetase  62.59 
 
 		 403 aa  474  1e-132  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.814506  normal  0.982729 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1186  S-adenosylmethionine synthetase  59.9 
 
 		 414 aa  473  1e-132  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2084  methionine adenosyltransferase  59.85 
 
 		 395 aa  473  1e-132  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.191002  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4914  S-adenosylmethionine synthetase  60.05 
 
 		 399 aa  470  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.11754  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4660  S-adenosylmethionine synthetase  60.05 
 
 		 399 aa  470  1.0000000000000001e-131  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4500  S-adenosylmethionine synthetase  60.05 
 
 		 399 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4517  S-adenosylmethionine synthetase  60.05 
 
 		 399 aa  470  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.536795  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4877  S-adenosylmethionine synthetase  60.05 
 
 		 399 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000842328  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5017  S-adenosylmethionine synthetase  60.05 
 
 		 399 aa  470  1.0000000000000001e-131  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00446313  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3981  S-adenosylmethionine synthetase  58.66 
 
 		 396 aa  469  1.0000000000000001e-131  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000348916  hitchhiker  0.00000146833 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09860  Methionine adenosyltransferase  58.94 
 
 		 402 aa  470  1.0000000000000001e-131  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1071  S-adenosylmethionine synthetase  60.5 
 
 		 393 aa  469  1.0000000000000001e-131  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0298396  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4904  S-adenosylmethionine synthetase  60.05 
 
 		 399 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000363625  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4886  S-adenosylmethionine synthetase  60.05 
 
 		 399 aa  470  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0363  S-adenosylmethionine synthetase  60.05 
 
 		 399 aa  470  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000052915  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1306  S-adenosylmethionine synthetase  59.33 
 
 		 421 aa  466  9.999999999999999e-131  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.883498  normal  0.454571 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2435  S-adenosylmethionine synthetase  59.85 
 
 		 391 aa  465  9.999999999999999e-131  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2145  S-adenosylmethionine synthetase  59.85 
 
 		 391 aa  465  9.999999999999999e-131  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4594  S-adenosylmethionine synthetase  59.55 
 
 		 399 aa  465  9.999999999999999e-131  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.791965  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0160  S-adenosylmethionine synthetase  60.4 
 
 		 405 aa  465  9.999999999999999e-131  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.754463  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3874  methionine adenosyltransferase  56.86 
 
 		 396 aa  462  1e-129  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000696498  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3549  S-adenosylmethionine synthetase  61.6 
 
 		 403 aa  464  1e-129  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.642541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2642  S-adenosylmethionine synthetase  58.06 
 
 		 391 aa  464  1e-129  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0489  S-adenosylmethionine synthetase  59.75 
 
 		 405 aa  459  9.999999999999999e-129  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1171  S-adenosylmethionine synthetase  57.32 
 
 		 395 aa  459  9.999999999999999e-129  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000972386  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1133  S-adenosylmethionine synthetase  57.32 
 
 		 395 aa  459  9.999999999999999e-129  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000111198  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3729  S-adenosylmethionine synthetase  60.5 
 
 		 408 aa  459  9.999999999999999e-129  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.582078  normal  0.310239 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0660  S-adenosylmethionine synthetase  58.71 
 
 		 402 aa  454  1.0000000000000001e-126  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000409512  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1841  S-adenosylmethionine synthetase  57 
 
 		 398 aa  454  1.0000000000000001e-126  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1877  S-adenosylmethionine synthetase  57 
 
 		 398 aa  454  1.0000000000000001e-126  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1234  S-adenosylmethionine synthetase  57.88 
 
 		 396 aa  454  1.0000000000000001e-126  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0170314  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0456  S-adenosylmethionine synthetase  56.97 
 
 		 402 aa  452  1.0000000000000001e-126  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000025014  normal  0.132712 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1135  S-adenosylmethionine synthetase  56.75 
 
 		 397 aa  453  1.0000000000000001e-126  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0512  S-adenosylmethionine synthetase  56.93 
 
 		 406 aa  449  1e-125  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.128804  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1963  S-adenosylmethionine synthetase  60.79 
 
 		 406 aa  451  1e-125  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1352  S-adenosylmethionine synthetase  56 
 
 		 399 aa  451  1e-125  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0831  S-adenosylmethionine synthetase  57.36 
 
 		 398 aa  451  1e-125  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1756  S-adenosylmethionine synthetase  57.07 
 
 		 395 aa  451  1e-125  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000785421  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1725  S-adenosylmethionine synthetase  56.82 
 
 		 402 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.710096  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0125  S-adenosylmethionine synthetase  56.27 
 
 		 396 aa  446  1.0000000000000001e-124  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00105717  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08430  methionine adenosyltransferase  57.14 
 
 		 422 aa  445  1.0000000000000001e-124  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.520335  normal  0.541462 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0894  S-adenosylmethionine synthetase  56.89 
 
 		 395 aa  447  1.0000000000000001e-124  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000969915  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2330  methionine adenosyltransferase  56 
 
 		 396 aa  448  1.0000000000000001e-124  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1470  S-adenosylmethionine synthetase  60.15 
 
 		 412 aa  445  1.0000000000000001e-124  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0274097  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_453  S-adenosylmethionine synthetase  56.42 
 
 		 406 aa  445  1.0000000000000001e-124  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00689475  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2353  S-adenosylmethionine synthetase  56.75 
 
 		 405 aa  446  1.0000000000000001e-124  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0488  S-adenosylmethionine synthetase  56.17 
 
 		 406 aa  445  1.0000000000000001e-124  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.227197  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03161  S-adenosylmethionine synthetase  56.42 
 
 		 381 aa  443  1e-123  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.713354  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1296  S-adenosylmethionine synthetase  58 
 
 		 395 aa  443  1e-123  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0081249  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0533  S-adenosylmethionine synthetase  54.5 
 
 		 393 aa  443  1e-123  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000146797  normal  0.123305 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>