More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_2353 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_2353  S-adenosylmethionine synthetase  100 
 
 
405 aa  827    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0160  S-adenosylmethionine synthetase  71.78 
 
 
405 aa  614  9.999999999999999e-175  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.754463  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0489  S-adenosylmethionine synthetase  72.03 
 
 
405 aa  613  9.999999999999999e-175  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3565  S-adenosylmethionine synthetase  72.03 
 
 
403 aa  598  1e-170  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.814506  normal  0.982729 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3549  S-adenosylmethionine synthetase  71.53 
 
 
403 aa  595  1e-169  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.642541  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0445  S-adenosylmethionine synthetase  69.21 
 
 
395 aa  585  1e-166  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000309499  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2574  S-adenosylmethionine synthetase  69.13 
 
 
395 aa  581  1.0000000000000001e-165  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0485425  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3874  methionine adenosyltransferase  69.82 
 
 
396 aa  580  1e-164  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000696498  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0659  S-adenosylmethionine synthetase  68.59 
 
 
403 aa  577  1.0000000000000001e-163  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0686  S-adenosylmethionine synthetase  70.69 
 
 
396 aa  575  1.0000000000000001e-163  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000273015  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2777  S-adenosylmethionine synthetase  67.34 
 
 
403 aa  571  1.0000000000000001e-162  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000102854  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2251  methionine adenosyltransferase  69.31 
 
 
397 aa  572  1.0000000000000001e-162  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000460807  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3437  S-adenosylmethionine synthetase  68 
 
 
399 aa  568  1e-161  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.109386  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4914  S-adenosylmethionine synthetase  67.25 
 
 
399 aa  562  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.11754  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4660  S-adenosylmethionine synthetase  67.25 
 
 
399 aa  563  1.0000000000000001e-159  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4500  S-adenosylmethionine synthetase  67.25 
 
 
399 aa  563  1.0000000000000001e-159  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4517  S-adenosylmethionine synthetase  67.25 
 
 
399 aa  563  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.536795  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4886  S-adenosylmethionine synthetase  67.25 
 
 
399 aa  563  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0363  S-adenosylmethionine synthetase  67 
 
 
399 aa  561  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000052915  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3891  S-adenosylmethionine synthetase  66.41 
 
 
396 aa  564  1.0000000000000001e-159  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00109689  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4904  S-adenosylmethionine synthetase  67.25 
 
 
399 aa  563  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000363625  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5017  S-adenosylmethionine synthetase  67.25 
 
 
399 aa  563  1.0000000000000001e-159  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00446313  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4877  S-adenosylmethionine synthetase  67.25 
 
 
399 aa  563  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000842328  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4594  S-adenosylmethionine synthetase  67 
 
 
399 aa  560  1e-158  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.791965  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3096  methionine adenosyltransferase  67.18 
 
 
397 aa  555  1e-157  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3981  S-adenosylmethionine synthetase  65.32 
 
 
396 aa  555  1e-157  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000348916  hitchhiker  0.00000146833 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0087  S-adenosylmethionine synthetase  65.9 
 
 
396 aa  551  1e-156  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000221578  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0894  S-adenosylmethionine synthetase  66.92 
 
 
395 aa  551  1e-156  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000969915  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2330  methionine adenosyltransferase  64.63 
 
 
396 aa  553  1e-156  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0512  S-adenosylmethionine synthetase  62.41 
 
 
406 aa  547  1e-154  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.128804  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0488  S-adenosylmethionine synthetase  62.16 
 
 
406 aa  545  1e-154  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.227197  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_453  S-adenosylmethionine synthetase  61.65 
 
 
406 aa  543  1e-153  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00689475  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1071  S-adenosylmethionine synthetase  67.01 
 
 
393 aa  542  1e-153  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0298396  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1725  S-adenosylmethionine synthetase  64.72 
 
 
402 aa  539  9.999999999999999e-153  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.710096  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2435  S-adenosylmethionine synthetase  67.27 
 
 
391 aa  537  1e-151  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2145  S-adenosylmethionine synthetase  67.27 
 
 
391 aa  537  1e-151  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0660  S-adenosylmethionine synthetase  63.38 
 
 
402 aa  532  1e-150  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000409512  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1133  S-adenosylmethionine synthetase  64.69 
 
 
395 aa  528  1e-149  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000111198  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2084  methionine adenosyltransferase  63.96 
 
 
395 aa  530  1e-149  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.191002  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0125  S-adenosylmethionine synthetase  65.82 
 
 
396 aa  530  1e-149  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00105717  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1186  S-adenosylmethionine synthetase  63.39 
 
 
414 aa  531  1e-149  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1171  S-adenosylmethionine synthetase  64.69 
 
 
395 aa  528  1e-149  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000972386  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1234  S-adenosylmethionine synthetase  64.89 
 
 
396 aa  530  1e-149  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0170314  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1841  S-adenosylmethionine synthetase  63.5 
 
 
398 aa  523  1e-147  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1877  S-adenosylmethionine synthetase  63.5 
 
 
398 aa  523  1e-147  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2161  S-adenosylmethionine synthetase  64.8 
 
 
399 aa  522  1e-147  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0456  S-adenosylmethionine synthetase  63.54 
 
 
402 aa  519  1e-146  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000025014  normal  0.132712 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1352  S-adenosylmethionine synthetase  62.78 
 
 
399 aa  516  1.0000000000000001e-145  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09860  Methionine adenosyltransferase  62.66 
 
 
402 aa  517  1.0000000000000001e-145  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1135  S-adenosylmethionine synthetase  63.52 
 
 
397 aa  515  1.0000000000000001e-145  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1470  S-adenosylmethionine synthetase  65.48 
 
 
412 aa  512  1e-144  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0274097  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1756  S-adenosylmethionine synthetase  61.7 
 
 
395 aa  512  1e-144  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000785421  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0831  S-adenosylmethionine synthetase  62.72 
 
 
398 aa  511  1e-143  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0413  S-adenosylmethionine synthetase  60.85 
 
 
390 aa  506  9.999999999999999e-143  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0737611  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1296  S-adenosylmethionine synthetase  63.61 
 
 
395 aa  505  9.999999999999999e-143  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0081249  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4132  S-adenosylmethionine synthetase  60.44 
 
 
421 aa  505  9.999999999999999e-143  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000371992  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1821  S-adenosylmethionine synthetase  60.2 
 
 
385 aa  494  1e-139  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0267535  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2463  S-adenosylmethionine synthetase  59.02 
 
 
417 aa  494  1e-139  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.328764  hitchhiker  0.00000000000157811 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3124  S-adenosylmethionine synthetase  61.77 
 
 
398 aa  496  1e-139  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.110006  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2894  S-adenosylmethionine synthetase  61.56 
 
 
391 aa  492  9.999999999999999e-139  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4159  S-adenosylmethionine synthetase  62.28 
 
 
397 aa  494  9.999999999999999e-139  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0297831  normal  0.258747 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3478  S-adenosylmethionine synthetase  59.85 
 
 
418 aa  493  9.999999999999999e-139  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.575314 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0646  S-adenosylmethionine synthetase  61.52 
 
 
383 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00167645  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0871  S-adenosylmethionine synthetase  60.25 
 
 
383 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0533  S-adenosylmethionine synthetase  59.02 
 
 
393 aa  489  1e-137  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000146797  normal  0.123305 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3660  S-adenosylmethionine synthetase  61.01 
 
 
383 aa  489  1e-137  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.2045 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0929  S-adenosylmethionine synthetase  59.75 
 
 
383 aa  490  1e-137  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0826  S-adenosylmethionine synthetase  61.01 
 
 
383 aa  491  1e-137  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.232254  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15650  methionine adenosyltransferase  61.93 
 
 
400 aa  489  1e-137  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.148398  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0780  S-adenosylmethionine synthetase  59.71 
 
 
420 aa  489  1e-137  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000106532  hitchhiker  0.000013186 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1082  S-adenosylmethionine synthetase  61.01 
 
 
383 aa  490  1e-137  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0507835  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1383  methionine adenosyltransferase  58.6 
 
 
401 aa  490  1e-137  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4661  S-adenosylmethionine synthetase  57.49 
 
 
420 aa  488  1e-137  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.778397  decreased coverage  0.00341152 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0772  S-adenosylmethionine synthetase  59.75 
 
 
383 aa  490  1e-137  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3251  S-adenosylmethionine synthetase  59.75 
 
 
383 aa  490  1e-137  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3466  S-adenosylmethionine synthetase  61.01 
 
 
383 aa  489  1e-137  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3354  S-adenosylmethionine synthetase  59.75 
 
 
383 aa  490  1e-137  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3541  S-adenosylmethionine synthetase  61.01 
 
 
383 aa  489  1e-137  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27040  methionine adenosyltransferase  63.43 
 
 
399 aa  487  1e-136  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.593252  normal  0.387061 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0139  S-adenosylmethionine synthetase  60.66 
 
 
389 aa  486  1e-136  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0873  S-adenosylmethionine synthetase  60.25 
 
 
383 aa  486  1e-136  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3263  S-adenosylmethionine synthetase  59.49 
 
 
384 aa  484  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0673019  normal  0.240242 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3103  S-adenosylmethionine synthetase  62.06 
 
 
401 aa  486  1e-136  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0169073  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3729  S-adenosylmethionine synthetase  59.29 
 
 
408 aa  484  1e-136  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.582078  normal  0.310239 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0751  S-adenosylmethionine synthetase  60.25 
 
 
383 aa  486  1e-136  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3661  S-adenosylmethionine synthetase  62.12 
 
 
393 aa  484  1e-136  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.284553  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1716  S-adenosylmethionine synthetase  61.07 
 
 
398 aa  487  1e-136  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.123594  hitchhiker  0.00797673 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2760  S-adenosylmethionine synthetase  59.24 
 
 
383 aa  487  1e-136  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3336  S-adenosylmethionine synthetase  59.49 
 
 
384 aa  484  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.216224  normal  0.254076 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3328  S-adenosylmethionine synthetase  59.49 
 
 
384 aa  484  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.196348  normal  0.570149 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4357  S-adenosylmethionine synthetase  61.39 
 
 
410 aa  484  1e-135  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.808224  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0053  S-adenosylmethionine synthetase  57.76 
 
 
393 aa  481  1e-135  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3331  S-adenosylmethionine synthetase  58.73 
 
 
383 aa  482  1e-135  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.175486  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2262  S-adenosylmethionine synthetase  59.75 
 
 
385 aa  483  1e-135  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3433  S-adenosylmethionine synthetase  59.24 
 
 
384 aa  482  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00223184 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3252  S-adenosylmethionine synthetase  59.24 
 
 
384 aa  484  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0015174  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0349  S-adenosylmethionine synthetase  60.96 
 
 
388 aa  483  1e-135  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000664302  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3099  S-adenosylmethionine synthetase  59.49 
 
 
384 aa  481  1e-134  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2521  S-adenosylmethionine synthetase  58.88 
 
 
388 aa  481  1e-134  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.53813 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3284  S-adenosylmethionine synthetase  59.49 
 
 
384 aa  481  1e-134  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>